49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0811 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0811  sulfur oxidation protein SoxX  100 
 
 		 115 aa  240  6e-63  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000641747  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1922  sulfur oxidation protein SoxX  66.09 
 
 		 115 aa  169  1e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.113133  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0917  monoheme cytochrome SoxX (sulfur oxidation)  47.86 
 
 		 121 aa  117  3.9999999999999996e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.613288  normal  0.828483 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0567  monoheme cytochrome SoxX (sulfur oxidation)  47.37 
 
 		 120 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000813905  normal  0.590405 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0604  cytochrome c, class I  44.25 
 
 		 124 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.24563  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1907  cytochrome c, class I  45.61 
 
 		 126 aa  101  3e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000266985  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3676  cytochrome c, class I  41.12 
 
 		 123 aa  99.4  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.848793  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0146  cytochrome c class I  41.9 
 
 		 115 aa  97.8  5e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3043  cytochrome c, class I  36.84 
 
 		 114 aa  89  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.372249  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0697  putative cytochrome C  44.19 
 
 		 97 aa  85.1  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0314  hypothetical protein  29.21 
 
 		 169 aa  58.5  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.600566  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3419  hypothetical protein  40.26 
 
 		 220 aa  56.6  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1595  hypothetical protein  34.92 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0370029  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1671  hypothetical protein  34.92 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2862  cytochrome c class I  37.93 
 
 		 187 aa  54.7  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1909  monoheme cytochrome SoxX (sulfur oxidation)  32.32 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00277827  normal  0.155687 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2280  hypothetical protein  39.8 
 
 		 210 aa  55.1  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3251  hypothetical protein  36.73 
 
 		 224 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0774405  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4962  hypothetical protein  32.35 
 
 		 247 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.640591  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3717  monoheme cytochrome SoxX (sulfur oxidation)  30.69 
 
 		 144 aa  51.6  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000435088  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3452  monoheme cytochrome SoxX (sulfur oxidation)  36.84 
 
 		 190 aa  51.2  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3450  monoheme cytochrome SoxX (sulfur oxidation)  34.88 
 
 		 184 aa  51.2  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3125  hypothetical protein  32.32 
 
 		 220 aa  50.8  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1157  hypothetical protein  34.95 
 
 		 150 aa  50.4  0.000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3255  hypothetical protein  32.69 
 
 		 213 aa  49.7  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3453  hypothetical protein  32.32 
 
 		 220 aa  50.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4373  hypothetical protein  31.37 
 
 		 245 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2860  hypothetical protein  34.21 
 
 		 191 aa  48.5  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7668  cytochrome c class I  29.36 
 
 		 181 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4257  hypothetical protein  29.41 
 
 		 256 aa  47.8  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.629836  normal  0.422459 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1948  hypothetical protein  30.85 
 
 		 484 aa  47  0.00009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6956  cytochrome c class I  26.55 
 
 		 180 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0327018 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3671  monoheme cytochrome SoxX (sulfur oxidation)  29.52 
 
 		 135 aa  45.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0260  monoheme cytochrome SoxX  31.17 
 
 		 174 aa  44.3  0.0005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00749516  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1523  hypothetical protein  31.52 
 
 		 204 aa  43.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.547199 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0066  putative cytochrome c, putative SoxX protein  25 
 
 		 147 aa  42.4  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1450  cytochrome c  30.17 
 
 		 266 aa  41.6  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.901546 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0858  hypothetical protein  33.75 
 
 		 236 aa  42  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0628  cytochrome c oxidase, subunit II  30 
 
 		 351 aa  41.6  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.197881 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3129  hypothetical protein  31.17 
 
 		 215 aa  42  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0102671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2764  putative cytochrome c, putative soxX protein  25.44 
 
 		 138 aa  41.6  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3918  hypothetical protein  30.61 
 
 		 156 aa  41.2  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.32539 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2626  hypothetical protein  30.77 
 
 		 218 aa  41.2  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.112136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0407  cytochrome c oxidase, subunit II  24.31 
 
 		 435 aa  41.2  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4760  cytochrome c oxidase subunit II  28 
 
 		 327 aa  40.8  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.723293  normal  0.0836993 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2561  cytochrome c, class I  25 
 
 		 131 aa  40.4  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4156  cytochrome c class I  27.62 
 
 		 158 aa  40.4  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0854  hypothetical protein  27.63 
 
 		 232 aa  40.4  0.009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00309034  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3779  hypothetical protein  29.55 
 
 		 220 aa  40  0.01  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>