28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0917 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_0917  monoheme cytochrome SoxX (sulfur oxidation)  100 
 
 		 121 aa  250  4.0000000000000004e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.613288  normal  0.828483 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0567  monoheme cytochrome SoxX (sulfur oxidation)  56.76 
 
 		 120 aa  133  7.000000000000001e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000813905  normal  0.590405 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0811  sulfur oxidation protein SoxX  47.86 
 
 		 115 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000641747  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1922  sulfur oxidation protein SoxX  55.68 
 
 		 115 aa  113  1.0000000000000001e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.113133  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0604  cytochrome c, class I  54.44 
 
 		 124 aa  105  2e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.24563  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3676  cytochrome c, class I  46.32 
 
 		 123 aa  94.4  5e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.848793  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1907  cytochrome c, class I  42.74 
 
 		 126 aa  91.7  3e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000266985  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0146  cytochrome c class I  40.37 
 
 		 115 aa  89  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0697  putative cytochrome C  44.94 
 
 		 97 aa  82.8  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3043  cytochrome c, class I  36.79 
 
 		 114 aa  77  0.00000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.372249  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0314  hypothetical protein  32.94 
 
 		 169 aa  55.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.600566  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3450  monoheme cytochrome SoxX (sulfur oxidation)  30.34 
 
 		 184 aa  47.4  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3717  monoheme cytochrome SoxX (sulfur oxidation)  30.51 
 
 		 144 aa  47  0.00008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000435088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1948  hypothetical protein  32.63 
 
 		 484 aa  46.6  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2862  cytochrome c class I  32.58 
 
 		 187 aa  46.2  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1157  hypothetical protein  27.4 
 
 		 150 aa  45.8  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7668  cytochrome c class I  28.32 
 
 		 181 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0260  monoheme cytochrome SoxX  30.69 
 
 		 174 aa  43.9  0.0008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00749516  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1909  monoheme cytochrome SoxX (sulfur oxidation)  26.5 
 
 		 150 aa  43.5  0.0009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00277827  normal  0.155687 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0066  putative cytochrome c, putative SoxX protein  28.57 
 
 		 147 aa  43.5  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4760  cytochrome c oxidase subunit II  27.93 
 
 		 327 aa  41.2  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.723293  normal  0.0836993 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3251  hypothetical protein  27.55 
 
 		 224 aa  41.6  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0774405  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0958  cytochrome c551/c552-like protein  31.43 
 
 		 132 aa  41.2  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3918  hypothetical protein  26.23 
 
 		 156 aa  40.4  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.32539 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6956  cytochrome c class I  25 
 
 		 180 aa  40.4  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0327018 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3419  hypothetical protein  27.63 
 
 		 220 aa  40.4  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2764  putative cytochrome c, putative soxX protein  31.18 
 
 		 138 aa  40  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1671  hypothetical protein  30.85 
 
 		 210 aa  40  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>