37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3419 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_3419  hypothetical protein  100 
 
 		 220 aa  459  9.999999999999999e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3251  hypothetical protein  85.16 
 
 		 224 aa  345  4e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0774405  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3125  hypothetical protein  72.22 
 
 		 220 aa  296  2e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3453  hypothetical protein  74.57 
 
 		 220 aa  293  2e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3255  hypothetical protein  70.52 
 
 		 213 aa  279  3e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1671  hypothetical protein  56.67 
 
 		 210 aa  222  3e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1595  hypothetical protein  56.67 
 
 		 210 aa  222  4e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0370029  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2626  hypothetical protein  50.22 
 
 		 218 aa  221  8e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.112136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2433  hypothetical protein  58.33 
 
 		 212 aa  218  7.999999999999999e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3779  hypothetical protein  56.61 
 
 		 220 aa  212  2.9999999999999995e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2280  hypothetical protein  56.11 
 
 		 210 aa  211  9e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0806  hypothetical protein  51.38 
 
 		 212 aa  192  4e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1033  hypothetical protein  47.75 
 
 		 212 aa  192  5e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4962  hypothetical protein  45.75 
 
 		 247 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.640591  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4373  hypothetical protein  48.09 
 
 		 245 aa  186  3e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4257  hypothetical protein  50.27 
 
 		 256 aa  184  6e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.629836  normal  0.422459 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3129  hypothetical protein  42.79 
 
 		 215 aa  181  1e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0102671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1523  hypothetical protein  46.41 
 
 		 204 aa  157  1e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.547199 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3450  monoheme cytochrome SoxX (sulfur oxidation)  39.31 
 
 		 184 aa  131  7.999999999999999e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2862  cytochrome c class I  39.77 
 
 		 187 aa  122  5e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0854  hypothetical protein  39.41 
 
 		 232 aa  122  6e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00309034  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0856  hypothetical protein  33.76 
 
 		 233 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.097776  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0433  hypothetical protein  40 
 
 		 229 aa  118  6e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0434  hypothetical protein  40.72 
 
 		 227 aa  118  9e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0858  hypothetical protein  39.13 
 
 		 236 aa  114  7.999999999999999e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2860  hypothetical protein  37.22 
 
 		 191 aa  109  3e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3452  monoheme cytochrome SoxX (sulfur oxidation)  38.06 
 
 		 190 aa  94.4  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0314  hypothetical protein  38.21 
 
 		 169 aa  73.6  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.600566  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0811  sulfur oxidation protein SoxX  40.26 
 
 		 115 aa  57  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000641747  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1922  sulfur oxidation protein SoxX  36.36 
 
 		 115 aa  49.7  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.113133  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0604  cytochrome c, class I  32.47 
 
 		 124 aa  48.5  0.00009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.24563  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1907  cytochrome c, class I  33.68 
 
 		 126 aa  47.4  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000266985  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0146  cytochrome c class I  31.43 
 
 		 115 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1948  hypothetical protein  33.75 
 
 		 484 aa  45.8  0.0005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3676  cytochrome c, class I  31.17 
 
 		 123 aa  44.7  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.848793  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3043  cytochrome c, class I  31.17 
 
 		 114 aa  43.9  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.372249  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3918  hypothetical protein  35.05 
 
 		 156 aa  41.6  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.32539 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>