36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6956 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_6956  cytochrome c class I  100 
 
 		 180 aa  337  5e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0327018 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7668  cytochrome c class I  85.37 
 
 		 181 aa  206  2e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0066  putative cytochrome c, putative SoxX protein  57.58 
 
 		 147 aa  134  7.000000000000001e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2764  putative cytochrome c, putative soxX protein  54.01 
 
 		 138 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1157  hypothetical protein  45.07 
 
 		 150 aa  113  1.0000000000000001e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4156  cytochrome c class I  40.13 
 
 		 158 aa  103  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3717  monoheme cytochrome SoxX (sulfur oxidation)  42.74 
 
 		 144 aa  93.6  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000435088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3671  monoheme cytochrome SoxX (sulfur oxidation)  37.07 
 
 		 135 aa  86.7  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1909  monoheme cytochrome SoxX (sulfur oxidation)  39.84 
 
 		 150 aa  86.7  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00277827  normal  0.155687 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2807  cytochrome c  37.09 
 
 		 160 aa  77.8  0.00000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.294735 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3918  hypothetical protein  36.59 
 
 		 156 aa  75.5  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.32539 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4150  cytochrome c, class I  33.77 
 
 		 157 aa  68.9  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0314  hypothetical protein  36.27 
 
 		 169 aa  57  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.600566  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3558  cytochrome c oxidase subunit II  32.48 
 
 		 370 aa  53.5  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.22857 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0146  cytochrome c class I  34.31 
 
 		 115 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2263  cytochrome c oxidase, subunit II  33.33 
 
 		 367 aa  52  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0175262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1922  sulfur oxidation protein SoxX  28.07 
 
 		 115 aa  47  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.113133  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0811  sulfur oxidation protein SoxX  26.55 
 
 		 115 aa  46.2  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000641747  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0697  putative cytochrome C  31.63 
 
 		 97 aa  46.6  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3043  cytochrome c, class I  29.46 
 
 		 114 aa  45.8  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.372249  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1229  cytochrome c class I  32.56 
 
 		 98 aa  45.8  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3763  cytochrome c class I  30.08 
 
 		 155 aa  43.1  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3450  monoheme cytochrome SoxX (sulfur oxidation)  32.43 
 
 		 184 aa  42.7  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0828  cytochrome c-550  37.31 
 
 		 118 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000131619  hitchhiker  6.35976e-19 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3676  cytochrome c, class I  29.29 
 
 		 123 aa  42.4  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.848793  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4408  cytochrome c-550  36.23 
 
 		 118 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000137345  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4371  cytochrome c-550  36.23 
 
 		 118 aa  42.4  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00063902  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3452  monoheme cytochrome SoxX (sulfur oxidation)  33.01 
 
 		 190 aa  42.4  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4425  cytochrome c-550  36.23 
 
 		 118 aa  42.4  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000170237  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0697  cytochrome c oxidase, subunit II  27.32 
 
 		 322 aa  42  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4143  cytochrome c class I  34.78 
 
 		 118 aa  41.6  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000375642  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4031  cytochrome c-550  35.82 
 
 		 118 aa  41.6  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000040592  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6286  cytochrome c oxidase, subunit II  28.42 
 
 		 352 aa  41.2  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.257472  normal  0.0263748 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0917  monoheme cytochrome SoxX (sulfur oxidation)  25.98 
 
 		 121 aa  41.2  0.008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.613288  normal  0.828483 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4041  cytochrome c-550  34.78 
 
 		 118 aa  41.2  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000123285  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0604  cytochrome c, class I  26.23 
 
 		 124 aa  40.8  0.01  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.24563  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>