102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1229 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_1229  cytochrome c class I  100 
 
 		 98 aa  202  2e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3334  cytochrome c family protein, putative  51.85 
 
 		 104 aa  88.6  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.115462  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0910  cytochrome c class I  41.77 
 
 		 117 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.58157e-33 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3336  cytochrome c class I  39.24 
 
 		 117 aa  70.5  0.000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0198059  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0118  cytochrome c oxidase, subunit IIC  33.71 
 
 		 324 aa  55.5  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.134505  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1767  cytochrome c oxidase, subunit II  34.09 
 
 		 352 aa  55.1  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.204958  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3892  cytochrome c oxidase subunit II  33.72 
 
 		 345 aa  54.7  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.740774  normal  0.178097 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1754  cytochrome c, monohaem  33.71 
 
 		 324 aa  53.5  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0628  cytochrome c oxidase, subunit II  33.33 
 
 		 351 aa  53.1  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.197881 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5826  cytochrome c oxidase, subunit II  35.96 
 
 		 330 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3379  cytochrome c oxidase, subunit II  36.26 
 
 		 318 aa  51.6  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3540  cytochrome c oxidase, subunit II  35.23 
 
 		 311 aa  50.8  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3544  cytochrome b/b6 domain-containing protein  37.18 
 
 		 488 aa  50.8  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.148449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2347  cytochrome c oxidase, subunit II  37.08 
 
 		 334 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4792  cytochrome c oxidase, subunit II  35.23 
 
 		 354 aa  50.4  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0280165  normal  0.517537 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3480  cytochrome c, class I  31.48 
 
 		 127 aa  50.1  0.000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1993  cytochrome c oxidase, subunit II  34.48 
 
 		 314 aa  49.7  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0975891  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6354  cytochrome c oxidase subunit II  32.56 
 
 		 334 aa  49.3  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2759  cytochrome c class I  32.05 
 
 		 253 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0096  cytochrome c oxidase, subunit II  37.08 
 
 		 334 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.296292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7668  cytochrome c class I  34.88 
 
 		 181 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0697  cytochrome c oxidase, subunit II  34.44 
 
 		 322 aa  48.9  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0945  cytochrome oxidase subunit II  33.71 
 
 		 372 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.891376  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0771  cytochrome c oxidase, subunit II  33.71 
 
 		 381 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0315373  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0783  cytochrome c oxidase, subunit II  33.71 
 
 		 372 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1705  cytochrome c, monohaem  33.33 
 
 		 324 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.829367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2545  putative cytochrome c  31.25 
 
 		 350 aa  48.1  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4760  cytochrome c oxidase subunit II  35.96 
 
 		 327 aa  48.1  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.723293  normal  0.0836993 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2254  hypothetical protein  34.18 
 
 		 133 aa  47.8  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0965  heme-binding protein  31.03 
 
 		 902 aa  47.8  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.632027  normal  0.0425648 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5244  cytochrome c oxidase, subunit II  33.71 
 
 		 326 aa  47.4  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0788277  normal  0.868201 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1438  hypothetical protein  45.28 
 
 		 828 aa  47.4  0.00007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.45862  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09091  cytochrome cM  39.47 
 
 		 125 aa  47  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.670452 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5502  cytochrome c oxidase, subunit II  39.76 
 
 		 370 aa  47  0.00009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.535121  normal  0.0572426 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6572  cytochrome c, monohaem  34.48 
 
 		 352 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.381109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2991  cytochrome c oxidase, subunit II  34.83 
 
 		 338 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.336386  normal  0.0255364 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6146  cytochrome c oxidase, subunit II  34.48 
 
 		 353 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.870856  normal  0.304247 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0328  cytochrome c, class I  41.18 
 
 		 262 aa  45.1  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000605449  hitchhiker  0.0000000937241 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0460  cytochrome c oxidase, subunit II  36.78 
 
 		 353 aa  45.1  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.354816  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2183  putative cytochrome c oxidase polypeptide II precursor  31.46 
 
 		 338 aa  45.4  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0732382 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6539  cytochrome c, monohaem  34.88 
 
 		 434 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.537411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6956  cytochrome c class I  32.56 
 
 		 180 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0327018 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6286  cytochrome c oxidase, subunit II  36.05 
 
 		 352 aa  45.1  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.257472  normal  0.0263748 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5491  cytochrome c oxidase, subunit II  36.36 
 
 		 355 aa  45.4  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31459  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1775  cytochrome c family protein  33.33 
 
 		 272 aa  44.3  0.0005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.579886  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2549  hypothetical protein  37.18 
 
 		 419 aa  44.3  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000354774  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2792  cytochrome c oxidase, subunit II  35.23 
 
 		 330 aa  44.7  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.625738  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1249  cytochrome c class I  28.21 
 
 		 238 aa  44.3  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3033  cytochrome c class I  28.21 
 
 		 238 aa  44.3  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5485  cytochrome c class I  35.11 
 
 		 561 aa  44.3  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.233629 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0709  cytochrome c oxidase subunit II  26.97 
 
 		 355 aa  43.9  0.0007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.669005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1292  cytochrome c oxidase, subunit II  36.05 
 
 		 354 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.493898  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0697  putative cytochrome C  34.12 
 
 		 97 aa  43.9  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0243  hypothetical protein  36.36 
 
 		 409 aa  43.9  0.0008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1449  cytochrome c oxidase, subunit II  32.61 
 
 		 346 aa  43.1  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.015711 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1601  cytochrome c, class I  28.07 
 
 		 125 aa  43.5  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.402085 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3671  monoheme cytochrome SoxX (sulfur oxidation)  30.63 
 
 		 135 aa  43.5  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2083  hypothetical protein  37.5 
 
 		 278 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00771953 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2218  cytochrome c class I  27.87 
 
 		 132 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.925658 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3991  cytochrome c oxidase, subunit II  31.11 
 
 		 349 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3856  cytochrome c oxidase subunit II  31.11 
 
 		 349 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.15254  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3687  cytochrome c oxidase, subunit II  31.11 
 
 		 349 aa  42.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3704  cytochrome c oxidase, subunit II  31.11 
 
 		 349 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.136015  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4154  cytochrome c oxidase subunit II  31.11 
 
 		 349 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1719  hypothetical protein  41.51 
 
 		 308 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1589  hypothetical protein  33.73 
 
 		 162 aa  42.7  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3029  cytochrome d1 heme subunit  36.49 
 
 		 527 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.612791  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3770  cytochrome c oxidase subunit II  31.11 
 
 		 349 aa  42.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1416  hypothetical protein  31.31 
 
 		 252 aa  42.4  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0461  cytochrome d1 heme region  27.91 
 
 		 556 aa  42.7  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00181768  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1455  cytochrome c class I  27.47 
 
 		 278 aa  42.4  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000371587  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4062  cytochrome c oxidase, subunit II  31.11 
 
 		 349 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4046  cytochrome c oxidase, subunit II  31.11 
 
 		 349 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1193  cytochrome c oxidase, subunit II  31.11 
 
 		 349 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3959  cytochrome c oxidase, subunit II  31.11 
 
 		 349 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3190  cytochrome c, class I  33.75 
 
 		 142 aa  42  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2129  hypothetical protein  39.62 
 
 		 282 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2219  hypothetical protein  39.62 
 
 		 251 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.474068  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2850  cytochrome c class I  29.03 
 
 		 312 aa  42  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3707  membrane-bound dehydrogenase domain protein  38.78 
 
 		 968 aa  42  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3450  cytochrome c, class I  27.83 
 
 		 326 aa  41.6  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.60831  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1460  hypothetical protein  33.77 
 
 		 428 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1555  hypothetical protein  33.77 
 
 		 428 aa  41.2  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2650  cytochrome c, class I  35.71 
 
 		 225 aa  41.2  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2403  hypothetical protein  33.77 
 
 		 428 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.102339  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0079  putative cytochrome c oxidase subunit II  31.82 
 
 		 342 aa  41.2  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.917681  hitchhiker  0.00234837 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4339  cytochrome c, class I  32.58 
 
 		 393 aa  40.8  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0695  cytochrome c  33.33 
 
 		 129 aa  40.8  0.006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0651  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  29.47 
 
 		 308 aa  40.8  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15291  cytochrome cM  33.33 
 
 		 129 aa  40.8  0.006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.427205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3918  hypothetical protein  31.96 
 
 		 156 aa  40.8  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.32539 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4608  cytochrome c class I  25.86 
 
 		 120 aa  40.8  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0752945 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11631  cytochrome cM  30 
 
 		 100 aa  40.4  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.362816  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6323  cytochrome c class I  26.55 
 
 		 130 aa  40.8  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2862  cytochrome c, class I  32.14 
 
 		 268 aa  40.4  0.009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0699705 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0620  cytochrome c, class I  34.69 
 
 		 147 aa  40  0.009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.363015  normal  0.813784 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4137  cytochrome c class I  31.96 
 
 		 320 aa  40.4  0.009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3308  heme-binding protein  40.82 
 
 		 924 aa  40.4  0.009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1068  cytochrome cM  30.38 
 
 		 128 aa  40  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3283  cytochrome c, class I  34.29 
 
 		 225 aa  40  0.01  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.86015  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>