34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3671 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3671  monoheme cytochrome SoxX (sulfur oxidation)  100 
 
 		 135 aa  278  2e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4156  cytochrome c class I  60.56 
 
 		 158 aa  167  6e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4150  cytochrome c, class I  50.76 
 
 		 157 aa  127  7.000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3918  hypothetical protein  50 
 
 		 156 aa  124  6e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.32539 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2807  cytochrome c  50 
 
 		 160 aa  121  3e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.294735 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2764  putative cytochrome c, putative soxX protein  43.28 
 
 		 138 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0066  putative cytochrome c, putative SoxX protein  39.52 
 
 		 147 aa  100  6e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1157  hypothetical protein  38.84 
 
 		 150 aa  95.5  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6956  cytochrome c class I  37.07 
 
 		 180 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0327018 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7668  cytochrome c class I  37.93 
 
 		 181 aa  83.6  8e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1909  monoheme cytochrome SoxX (sulfur oxidation)  41.32 
 
 		 150 aa  81.6  0.000000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00277827  normal  0.155687 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3717  monoheme cytochrome SoxX (sulfur oxidation)  38.66 
 
 		 144 aa  75.5  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000435088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1907  cytochrome c, class I  33.33 
 
 		 126 aa  57.4  0.00000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000266985  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3676  cytochrome c, class I  35.58 
 
 		 123 aa  57.4  0.00000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.848793  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0697  putative cytochrome C  33 
 
 		 97 aa  57  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0604  cytochrome c, class I  31.13 
 
 		 124 aa  54.3  0.0000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.24563  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0146  cytochrome c class I  38.96 
 
 		 115 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3043  cytochrome c, class I  33.06 
 
 		 114 aa  51.2  0.000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.372249  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0567  monoheme cytochrome SoxX (sulfur oxidation)  28.57 
 
 		 120 aa  46.2  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000813905  normal  0.590405 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3763  cytochrome c class I  35.43 
 
 		 155 aa  45.1  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0811  sulfur oxidation protein SoxX  29.52 
 
 		 115 aa  45.4  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000641747  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2621  cytochrome c family protein  29.31 
 
 		 157 aa  45.1  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0723278  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0314  hypothetical protein  26.72 
 
 		 169 aa  45.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.600566  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3336  cytochrome c class I  28.7 
 
 		 117 aa  44.3  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0198059  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1922  sulfur oxidation protein SoxX  30.51 
 
 		 115 aa  43.9  0.0007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.113133  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1229  cytochrome c class I  31.37 
 
 		 98 aa  43.9  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0910  cytochrome c class I  25.56 
 
 		 117 aa  43.9  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.58157e-33 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4962  hypothetical protein  34.48 
 
 		 247 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.640591  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4373  hypothetical protein  33.33 
 
 		 245 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0434  hypothetical protein  30.93 
 
 		 227 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3251  hypothetical protein  32.61 
 
 		 224 aa  41.6  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0774405  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4620  heme-binding protein  32.2 
 
 		 1143 aa  41.2  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4257  hypothetical protein  32.61 
 
 		 256 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.629836  normal  0.422459 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3450  monoheme cytochrome SoxX (sulfur oxidation)  43.48 
 
 		 184 aa  40.8  0.007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>