52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_4143 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_4143  cytochrome c class I  100 
 
 
118 aa  236  5.999999999999999e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000375642  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4371  cytochrome c-550  98.31 
 
 
118 aa  235  2e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00063902  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4425  cytochrome c-550  98.31 
 
 
118 aa  235  2e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000170237  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4041  cytochrome c-550  98.31 
 
 
118 aa  234  3e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000123285  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4313  cytochrome c-550  97.46 
 
 
118 aa  233  7e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.74805e-54 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4193  cytochrome c-550  97.46 
 
 
118 aa  233  7e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000176262  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4514  cytochrome c-550  97.46 
 
 
118 aa  233  7e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000708555  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4408  cytochrome c-550  97.46 
 
 
118 aa  233  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000137345  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4031  cytochrome c-550  97.46 
 
 
118 aa  231  2.0000000000000002e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000040592  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0828  cytochrome c-550  96.61 
 
 
118 aa  231  3e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000131619  hitchhiker  6.35976e-19 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3018  cytochrome c class I  92.37 
 
 
118 aa  222  1e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0223373  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0159  cytochrome c class I  52.99 
 
 
120 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2412  cytochrome c class I  50 
 
 
120 aa  117  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000673714  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3190  cytochrome c class I  47.12 
 
 
111 aa  97.1  8e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3005  cytochrome c class I  61.76 
 
 
110 aa  94  7e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000505825  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5303  cytochrome c-551  39.81 
 
 
107 aa  80.1  0.000000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5653  cytochrome c-551  39.81 
 
 
107 aa  80.1  0.000000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.432356 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5348  cytochrome c-551  40.74 
 
 
107 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5291  cytochrome c-551  40.74 
 
 
107 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4979  cytochrome c-551  39.81 
 
 
107 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5417  cytochrome c-551  39.81 
 
 
107 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4880  cytochrome c-551  39.81 
 
 
107 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5273  cytochrome c-551  39.81 
 
 
107 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.717075 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4865  cytochrome c-551  39.81 
 
 
107 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5035  cytochrome c-551  39.81 
 
 
107 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3724  cytochrome c-551  36.11 
 
 
112 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0490  cytochrome c class I  51.11 
 
 
254 aa  52.4  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1378  Quinoprotein glucose dehydrogenase  36.92 
 
 
769 aa  46.2  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.618452 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0843  TPR repeat-containing protein  37.74 
 
 
330 aa  45.1  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11331  cytochrome cM  28.42 
 
 
130 aa  44.3  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.969799 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2129  cytochrome c class I  47.83 
 
 
255 aa  43.9  0.0007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000120589  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1449  cytochrome c class I  42.86 
 
 
255 aa  43.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.150697  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1687  menaquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b/c subunit  42.86 
 
 
255 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.615326  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1580  menaquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b/c subunit  42.86 
 
 
255 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1248  cytochrome c class I  35.38 
 
 
255 aa  43.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.254815  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1406  menaquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c subunit  42.86 
 
 
255 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.118842  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3765  menaquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b/c subunit  42.86 
 
 
255 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2618  cytochrome c-555  47.83 
 
 
123 aa  43.5  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1651  menaquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b/c subunit  42.86 
 
 
255 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0942  cytochrome c class I  30.3 
 
 
329 aa  42.7  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.240089 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1618  menaquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b/c subunit  36.92 
 
 
255 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.117912 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0062  Pyrrolo-quinoline quinone  37.5 
 
 
704 aa  42.7  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.387664 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0848  cytochrome c class I  35.29 
 
 
121 aa  42.7  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1546  menaquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b/c subunit  36.92 
 
 
255 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1406  menaquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c subunit  36.92 
 
 
255 aa  42.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1434  menaquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b/c subunit  36.92 
 
 
255 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0832764  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2077  cytochrome c class I  30.77 
 
 
153 aa  41.2  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1651  hypothetical protein  29.41 
 
 
109 aa  41.6  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3662  cytochrome c class I  34.38 
 
 
124 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1014  Quinoprotein glucose dehydrogenase  29.07 
 
 
732 aa  40.8  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.101534  normal  0.630139 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6956  cytochrome c class I  35.82 
 
 
180 aa  40.8  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0327018 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1088  cytochrome c, class I  40.35 
 
 
143 aa  40.8  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000582284  hitchhiker  0.0000137635 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>