58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0159 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_0159  cytochrome c class I  100 
 
 		 120 aa  249  1e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2412  cytochrome c class I  82.5 
 
 		 120 aa  206  1e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000673714  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4143  cytochrome c class I  52.99 
 
 		 118 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000375642  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3018  cytochrome c class I  52.99 
 
 		 118 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0223373  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4371  cytochrome c-550  51.28 
 
 		 118 aa  130  6e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00063902  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4425  cytochrome c-550  51.28 
 
 		 118 aa  130  6e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000170237  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4193  cytochrome c-550  52.14 
 
 		 118 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000176262  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4313  cytochrome c-550  52.14 
 
 		 118 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.74805e-54 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4514  cytochrome c-550  52.14 
 
 		 118 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000708555  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4041  cytochrome c-550  51.28 
 
 		 118 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000123285  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0828  cytochrome c-550  50.43 
 
 		 118 aa  127  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000131619  hitchhiker  6.35976e-19 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4408  cytochrome c-550  50.43 
 
 		 118 aa  127  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000137345  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4031  cytochrome c-550  50.43 
 
 		 118 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000040592  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3190  cytochrome c class I  40.38 
 
 		 111 aa  89.4  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3005  cytochrome c class I  47.83 
 
 		 110 aa  82  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000505825  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5417  cytochrome c-551  35.19 
 
 		 107 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5035  cytochrome c-551  35.19 
 
 		 107 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5273  cytochrome c-551  35.19 
 
 		 107 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.717075 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4880  cytochrome c-551  35.19 
 
 		 107 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4865  cytochrome c-551  35.19 
 
 		 107 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3724  cytochrome c-551  35.45 
 
 		 112 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4979  cytochrome c-551  34.26 
 
 		 107 aa  75.5  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5653  cytochrome c-551  33.33 
 
 		 107 aa  73.6  0.0000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.432356 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5303  cytochrome c-551  33.33 
 
 		 107 aa  73.6  0.0000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5348  cytochrome c-551  33.33 
 
 		 107 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5291  cytochrome c-551  33.33 
 
 		 107 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0490  cytochrome c class I  30.08 
 
 		 254 aa  58.5  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0942  cytochrome c class I  31.52 
 
 		 329 aa  55.1  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.240089 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0062  Pyrrolo-quinoline quinone  42.86 
 
 		 704 aa  53.5  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.387664 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0848  cytochrome c class I  43.75 
 
 		 121 aa  51.6  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2961  cytochrome c, class I  37.68 
 
 		 108 aa  50.4  0.000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.428474  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0843  TPR repeat-containing protein  27.37 
 
 		 330 aa  50.1  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2129  cytochrome c class I  39.39 
 
 		 255 aa  47.4  0.00006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000120589  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1985  nitrite reductase NirS  32.5 
 
 		 546 aa  46.2  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.0000493691  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3172  nitrite reductase protein N  35.21 
 
 		 517 aa  45.8  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.854794 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1378  Quinoprotein glucose dehydrogenase  35.53 
 
 		 769 aa  45.8  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.618452 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2650  hypothetical protein  39.13 
 
 		 97 aa  45.8  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1132  PQQ-dependent enzyme-like protein  33.33 
 
 		 701 aa  45.1  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0946665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4957  Pyrrolo-quinoline quinone  46 
 
 		 698 aa  45.4  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.897916 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2450  PQQ-dependent enzyme-like protein  42 
 
 		 718 aa  44.7  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.264561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1651  hypothetical protein  28.16 
 
 		 109 aa  44.3  0.0006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2618  cytochrome c-555  43.75 
 
 		 123 aa  43.1  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1045  cytochrome c class I  42 
 
 		 98 aa  43.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3662  cytochrome c class I  37.31 
 
 		 124 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3169  cytochrome d1, heme region  33.8 
 
 		 493 aa  42  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3132  hydroxylamine reductase  38.98 
 
 		 504 aa  42  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1441  Pyrrolo-quinoline quinone  35 
 
 		 708 aa  41.6  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0121309 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1678  cytochrome c class I  35.24 
 
 		 289 aa  41.6  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.250223 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3942  cytochrome c class I  40 
 
 		 109 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.914915 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0952  cytochrome c, class I  37.7 
 
 		 192 aa  41.2  0.005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000198815  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1374  cytochrome c class I  33.8 
 
 		 270 aa  41.2  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.317055  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4020  cytochrome c, class I  33 
 
 		 124 aa  41.2  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.442148  normal  0.970341 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2545  putative cytochrome c  32.39 
 
 		 350 aa  40.8  0.006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11331  cytochrome cM  29.13 
 
 		 130 aa  40.8  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.969799 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1406  hypothetical protein  25 
 
 		 291 aa  40.4  0.008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1443  hypothetical protein  34.33 
 
 		 109 aa  40.4  0.008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0610  putative c-type cytochrome  44.44 
 
 		 493 aa  40  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.221994  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1450  cytochrome d1 heme region  32.93 
 
 		 525 aa  40  0.01  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.593871 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>