120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1985 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_1985  nitrite reductase NirS  100 
 
 		 546 aa  1123    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.0000493691  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4220  nitrite reductase  30.81 
 
 		 542 aa  219  7.999999999999999e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0434848  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0462  Hydroxylamine reductase  28.78 
 
 		 553 aa  166  1.0000000000000001e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000301578  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3132  hydroxylamine reductase  26.21 
 
 		 504 aa  162  1e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3430  hydroxylamine reductase  30.81 
 
 		 690 aa  162  1e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.133713  decreased coverage  0.000818462 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0610  putative c-type cytochrome  26.8 
 
 		 493 aa  157  4e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.221994  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0652  Nitrite reductase (NO-forming)  27.27 
 
 		 565 aa  156  1e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2618  Nitrite reductase (NO-forming)  27.62 
 
 		 560 aa  150  8e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0412143  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0070  nitrite reductase (NO-forming)  27.36 
 
 		 517 aa  149  2.0000000000000003e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.532245  normal  0.428629 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4229  heme-binding protein NirN  23.05 
 
 		 542 aa  147  5e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5010  hydroxylamine reductase  27.75 
 
 		 567 aa  147  5e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.824886  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3172  cytochrome d1, heme region  28.06 
 
 		 549 aa  147  6e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06650  putative c-type cytochrome  26.94 
 
 		 493 aa  146  8.000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0252622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3323  cytochrome c, class I:cytochrome d1, heme region  29.14 
 
 		 576 aa  143  6e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000018049 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2487  hydroxylamine reductase  27.1 
 
 		 596 aa  143  7e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.756283 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3260  cytochrome d1, heme region  26.37 
 
 		 528 aa  143  9e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3029  cytochrome d1 heme subunit  28.38 
 
 		 527 aa  143  9e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.612791  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5018  nitrite reductase (NO-forming)  28.08 
 
 		 503 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3172  nitrite reductase protein N  24.47 
 
 		 517 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.854794 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3274  cytochrome d1, heme region  26.36 
 
 		 561 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.825394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3169  cytochrome d1, heme region  25.62 
 
 		 493 aa  138  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3180  nitrite reductase precursor  27.73 
 
 		 583 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.795013  normal  0.689934 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2608  cytochrome d1 heme region  26.34 
 
 		 547 aa  137  4e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.213874  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2495  cytochrome d1, heme region  25.33 
 
 		 484 aa  137  6.0000000000000005e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.399935 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1442  hydroxylamine reductase  28.98 
 
 		 573 aa  134  3e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0077  nitrite reductase (NO-forming)  28.84 
 
 		 575 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.157876  normal  0.459085 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3125  hydroxylamine reductase  26.98 
 
 		 574 aa  134  3.9999999999999996e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.74527  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06750  nitrite reductase precursor  27.19 
 
 		 568 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1912  nitrite reductase (NO-forming)  28.57 
 
 		 574 aa  131  3e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1717  Hydroxylamine reductase  28.57 
 
 		 574 aa  131  3e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0620  nitrite reductase precursor  26.71 
 
 		 568 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3331  cytochrome d1, heme region  25.23 
 
 		 519 aa  124  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0339  Hydroxylamine reductase  25.55 
 
 		 548 aa  120  7e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000373839  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1450  cytochrome d1 heme region  23.96 
 
 		 525 aa  115  1.0000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.593871 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1710  cytochrome d1 heme region  24.34 
 
 		 566 aa  112  2.0000000000000002e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.111193  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1905  cytochrome d1, heme region  24.34 
 
 		 542 aa  111  3e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.275872  normal  0.619697 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0591  cytochrome d1, heme region  31.43 
 
 		 538 aa  92.4  2e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1921  cytochrome d1, heme region  29.66 
 
 		 541 aa  91.7  3e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0461  cytochrome d1 heme region  23 
 
 		 556 aa  89  2e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00181768  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2080  cytochrome d1, heme region  34.88 
 
 		 390 aa  87.4  6e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.79845  normal  0.193812 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06720  heme d1 biosynthesis protein NirF  30.66 
 
 		 392 aa  85.9  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.729227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0617  heme d1 biosynthesis protein NirF  30.19 
 
 		 392 aa  85.9  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1444  cytochrome d1 heme region  32.85 
 
 		 397 aa  84.3  0.000000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0340  cytochrome d1 heme region  22.28 
 
 		 557 aa  83.6  0.000000000000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000596399  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1910  cytochrome d1, heme region  30.84 
 
 		 404 aa  83.6  0.000000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1715  cytochrome d1 heme region  30.84 
 
 		 404 aa  83.2  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.792941  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0075  heme d1 biosynthesis protein NirF  30.05 
 
 		 391 aa  81.6  0.00000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.61983 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3123  cytochrome d1, heme region  32.56 
 
 		 400 aa  78.6  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.475371  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5013  cytochrome d1, heme region  30.7 
 
 		 413 aa  77.8  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4223  nirF protein  23.79 
 
 		 413 aa  75.9  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2490  cytochrome d1, heme region  30.16 
 
 		 384 aa  73.9  0.000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.697669 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3270  cytochrome d1, heme region  28.44 
 
 		 387 aa  72  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3177  cytochrome cd1  29.38 
 
 		 388 aa  66.6  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.976412 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2613  cytochrome d1 heme region  28.84 
 
 		 402 aa  64.3  0.000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.683986  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0076  hypothetical protein  43.08 
 
 		 98 aa  60.5  0.00000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.518394 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2079  hypothetical protein  38.24 
 
 		 129 aa  57.8  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.236411  normal  0.167695 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0458  cytochrome d1 heme region  23.4 
 
 		 353 aa  56.2  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000480254  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2489  cytochrome c (c55X)  35.94 
 
 		 103 aa  54.7  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.607101 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5012  c-type cytochrome precursor  35.29 
 
 		 109 aa  53.5  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.375656  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3178  putative cytochrome c  33.33 
 
 		 103 aa  53.9  0.000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.733909  normal  0.809001 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4222  c-type cytochrome c55x  30.56 
 
 		 123 aa  52.4  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0814  glucose sorbosone dehydrogenase  30.23 
 
 		 462 aa  51.6  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00498666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3271  hypothetical protein  40.32 
 
 		 110 aa  50.1  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2545  putative cytochrome c  32.65 
 
 		 350 aa  50.1  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1892  hypothetical protein  25 
 
 		 334 aa  49.3  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.181009  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06730  putative c-type cytochrome precursor  38.71 
 
 		 119 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0618  putative c-type cytochrome precursor  38.71 
 
 		 119 aa  48.9  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2720  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.23 
 
 		 327 aa  48.5  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.441743  normal  0.222343 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2102  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  27.75 
 
 		 357 aa  48.1  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1583  cytochrome c class I  31.17 
 
 		 152 aa  48.1  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.889837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2496  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  24.13 
 
 		 357 aa  47.8  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.431237  normal  0.565249 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3190  cytochrome c class I  38.57 
 
 		 111 aa  47.4  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1903  hypothetical protein  34.67 
 
 		 110 aa  47.8  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.172183  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5291  cytochrome c-551  34.57 
 
 		 107 aa  47.4  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2614  hypothetical protein  32.84 
 
 		 139 aa  47.4  0.0007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.537147  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5348  cytochrome c-551  34.57 
 
 		 107 aa  47.4  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2412  cytochrome c class I  33.75 
 
 		 120 aa  47.4  0.0008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000673714  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2669  YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  28.3 
 
 		 329 aa  46.6  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5653  cytochrome c-551  34.57 
 
 		 107 aa  47  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.432356 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5303  cytochrome c-551  34.57 
 
 		 107 aa  47  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1947  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  32.97 
 
 		 321 aa  46.6  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.107167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3094  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.3 
 
 		 329 aa  46.6  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3724  cytochrome c-551  34.57 
 
 		 112 aa  46.2  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2665  hypothetical protein  26.02 
 
 		 325 aa  47  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.320211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8029  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  28.57 
 
 		 314 aa  45.8  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.882346  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1440  glucose sorbosone dehydrogenase  29.25 
 
 		 530 aa  46.2  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00453751 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1847  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  23.74 
 
 		 328 aa  45.8  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0159  cytochrome c class I  32.5 
 
 		 120 aa  46.2  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1798  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  24.12 
 
 		 328 aa  46.2  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.178604 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0154  cytochrome c oxidase, subunit II  33.67 
 
 		 518 aa  45.1  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4112  cytochrome c oxidase, subunit II  33.67 
 
 		 518 aa  45.1  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4979  cytochrome c-551  34.57 
 
 		 107 aa  45.4  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3134  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.3 
 
 		 329 aa  45.1  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1279  hypothetical protein  25.38 
 
 		 329 aa  44.7  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4606  cytochrome c oxidase, subunit II  35.71 
 
 		 513 aa  44.7  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1651  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  24.06 
 
 		 366 aa  44.7  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0495995  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3791  cytochrome c oxidase, subunit II  37.14 
 
 		 513 aa  44.7  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04013  Cytochrome c oxidase, subunit II  34.72 
 
 		 387 aa  45.1  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.94805  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1913  hypothetical protein  35.71 
 
 		 154 aa  44.7  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000530569  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4311  cytochrome c oxidase, subunit II  33.67 
 
 		 518 aa  44.7  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.997623  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>