55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_3942 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_3942  cytochrome c class I  100 
 
 		 109 aa  224  4e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.914915 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2140  cytochrome c class I  61.11 
 
 		 124 aa  136  8.999999999999999e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.986487  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4020  cytochrome c, class I  59.26 
 
 		 124 aa  133  7.000000000000001e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.442148  normal  0.970341 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2103  cytochrome c class I  52.78 
 
 		 124 aa  120  7e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2147  cytochrome c class I  52.78 
 
 		 124 aa  120  7e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.620434 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1478  cytochrome CytM  53.27 
 
 		 145 aa  117  6e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.611234 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3662  cytochrome c class I  53.76 
 
 		 124 aa  110  6e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09091  cytochrome cM  52.94 
 
 		 125 aa  106  9.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.670452 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0717  cytochrome cM  52.94 
 
 		 129 aa  99  2e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1948  cytochrome cM  51.76 
 
 		 137 aa  98.6  2e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2140  cytochrome c, class I  50.57 
 
 		 87 aa  97.8  4e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0189398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11331  cytochrome cM  41.28 
 
 		 130 aa  90.5  6e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.969799 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11621  hypothetical protein  41.86 
 
 		 100 aa  87.8  4e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11631  cytochrome cM  41.86 
 
 		 100 aa  87  7e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.362816  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1068  cytochrome cM  40.7 
 
 		 128 aa  85.1  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0695  cytochrome c  40 
 
 		 129 aa  82.8  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15291  cytochrome cM  40 
 
 		 129 aa  82.4  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.427205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0062  Pyrrolo-quinoline quinone  36.05 
 
 		 704 aa  47  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.387664 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0656  cytochrome c, class I  31.76 
 
 		 283 aa  46.6  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.93712 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0902  heme-binding protein  36.62 
 
 		 1139 aa  46.2  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2102  cytochrome c, class I  32.91 
 
 		 268 aa  45.8  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.895116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1088  cytochrome c, class I  42.59 
 
 		 143 aa  46.2  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000582284  hitchhiker  0.0000137635 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1583  cytochrome c class I  28.1 
 
 		 152 aa  45.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.889837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1358  cb-type cytochrome c oxidase subunit III  26.05 
 
 		 152 aa  44.3  0.0006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.112598  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1280  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  33.33 
 
 		 296 aa  43.5  0.0009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2566  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  32.38 
 
 		 415 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.79853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3190  cytochrome c class I  44.68 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2387  hypothetical protein  42.86 
 
 		 671 aa  42.7  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0416918 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1925  hypothetical protein  27.59 
 
 		 108 aa  42.7  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.671288  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3043  cytochrome c class I  37.5 
 
 		 163 aa  42.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2070  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  38.55 
 
 		 317 aa  42.4  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.542754  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2538  cytochrome c, class I  36.51 
 
 		 313 aa  42  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.663631  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1234  cytochrome c class I  37.5 
 
 		 163 aa  41.6  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.5253  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1378  Quinoprotein glucose dehydrogenase  37.68 
 
 		 769 aa  42  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.618452 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6928  cytochrome c class I  27.03 
 
 		 112 aa  41.6  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.405337 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6572  cytochrome c, monohaem  31.11 
 
 		 352 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.381109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1913  hypothetical protein  33.33 
 
 		 154 aa  41.6  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000530569  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1360  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  30.56 
 
 		 308 aa  41.6  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.240618 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0328  cytochrome c, class I  51.28 
 
 		 262 aa  41.6  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000605449  hitchhiker  0.0000000937241 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4047  cytochrome c family protein  45 
 
 		 351 aa  41.2  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0159  cytochrome c class I  40 
 
 		 120 aa  41.2  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0462  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  31.58 
 
 		 294 aa  41.2  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.528353  normal  0.120204 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5502  cytochrome c oxidase, subunit II  32.14 
 
 		 370 aa  41.2  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.535121  normal  0.0572426 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0848  cytochrome c class I  28.12 
 
 		 121 aa  40.8  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1809  cytochrome c class I  31.51 
 
 		 153 aa  40.8  0.006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1900  quinoprotein glucose dehydrogenase  39.44 
 
 		 720 aa  40.8  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1301  cytochrome c class I  34.15 
 
 		 121 aa  40.4  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  hitchhiker  0.00128002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3606  cytochrome c family protein  45 
 
 		 352 aa  40.4  0.008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0522212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0018  cytochrome c, class I  36.07 
 
 		 138 aa  40.4  0.008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1045  cytochrome c class I  34.72 
 
 		 98 aa  40.4  0.009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2563  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  30.48 
 
 		 415 aa  40  0.01  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151427 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3334  cytochrome c family protein, putative  32 
 
 		 104 aa  40  0.01  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.115462  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0456  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  30.56 
 
 		 312 aa  40  0.01  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.844005  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6146  cytochrome c oxidase, subunit II  30.77 
 
 		 353 aa  40  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.870856  normal  0.304247 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2312  cytochrome c, class I  28.24 
 
 		 177 aa  40  0.01  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0109584  hitchhiker  0.000159385 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>