57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0717 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0717  cytochrome cM  100 
 
 		 129 aa  261  2e-69  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1948  cytochrome cM  74.45 
 
 		 137 aa  208  2e-53  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09091  cytochrome cM  58.14 
 
 		 125 aa  162  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.670452 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11331  cytochrome cM  46.72 
 
 		 130 aa  131  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.969799 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0695  cytochrome c  40.48 
 
 		 129 aa  122  2e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15291  cytochrome cM  40.48 
 
 		 129 aa  122  2e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.427205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1478  cytochrome CytM  50.48 
 
 		 145 aa  110  5e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.611234 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2140  cytochrome c class I  48.18 
 
 		 124 aa  110  8.000000000000001e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.986487  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1068  cytochrome cM  39.84 
 
 		 128 aa  108  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11621  hypothetical protein  43.43 
 
 		 100 aa  104  4e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2147  cytochrome c class I  46.96 
 
 		 124 aa  99.8  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.620434 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3942  cytochrome c class I  52.94 
 
 		 109 aa  100  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.914915 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2103  cytochrome c class I  46.96 
 
 		 124 aa  99.8  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11631  cytochrome cM  41.84 
 
 		 100 aa  99.4  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.362816  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4020  cytochrome c, class I  51.76 
 
 		 124 aa  98.6  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.442148  normal  0.970341 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3662  cytochrome c class I  48.24 
 
 		 124 aa  89.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2140  cytochrome c, class I  45.88 
 
 		 87 aa  89.4  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0189398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16190  cytochrome c, mono- and diheme variants family  37.93 
 
 		 263 aa  51.2  0.000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.188569  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1374  cytochrome c class I  31.65 
 
 		 270 aa  49.7  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.317055  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0317  cytochrome c, class I  43.4 
 
 		 285 aa  46.6  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00320646 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14180  cytochrome c, mono- and diheme variants family  33.73 
 
 		 266 aa  46.6  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.616928  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2002  electron transport protein SCO1/SenC  28.26 
 
 		 363 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3292  cytochrome c, class I  31.94 
 
 		 272 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.250177  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3303  cytochrome c, class I  31.94 
 
 		 272 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.227675 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10680  cytochrome c, mono- and diheme variants family  31.25 
 
 		 275 aa  45.4  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0523281  normal  0.768267 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3354  cytochrome c, class I  31.94 
 
 		 272 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0582943  normal  0.0591201 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2210  cytochrome c, class I  31.03 
 
 		 262 aa  44.7  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0119453  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0018  cytochrome c, class I  41.67 
 
 		 138 aa  43.1  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0942  cytochrome c class I  34.57 
 
 		 329 aa  42.7  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.240089 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12130  cytochrome c, mono- and diheme variants family  33 
 
 		 256 aa  43.1  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.298886  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0435  hypothetical protein  33.68 
 
 		 314 aa  43.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0471891 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0340  cytochrome d1 heme region  33.33 
 
 		 557 aa  43.5  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000596399  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3334  cytochrome c family protein, putative  34.18 
 
 		 104 aa  42.7  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.115462  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7193  cytochrome c class I  31.52 
 
 		 409 aa  42.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.99524  normal  0.500209 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2955  cytochrome c, class I  30.14 
 
 		 278 aa  42.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.136352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4492  cytochrome c, class I  26.36 
 
 		 127 aa  42.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.540606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0963  cytochrome c, class I  35.44 
 
 		 268 aa  42  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0745087 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2655  cytochrome c class I  32.35 
 
 		 144 aa  42  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0990  cytochrome c, class I  33.33 
 
 		 159 aa  42  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0328  cytochrome c, class I  32.56 
 
 		 262 aa  42  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000605449  hitchhiker  0.0000000937241 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0529  cytochrome c class I  32.69 
 
 		 400 aa  42  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1301  cytochrome c class I  31.01 
 
 		 121 aa  41.6  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  hitchhiker  0.00128002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4119  cytochrome c class I  27.85 
 
 		 271 aa  41.6  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.83541 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0843  TPR repeat-containing protein  32.88 
 
 		 330 aa  41.2  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0462  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  34.21 
 
 		 294 aa  41.2  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.528353  normal  0.120204 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3558  cytochrome c, class I  30.77 
 
 		 273 aa  41.2  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0912153 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0058  hypothetical protein  33.01 
 
 		 137 aa  40.8  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.771056 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0771  cytochrome c oxidase, subunit II  31.31 
 
 		 381 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0315373  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0783  cytochrome c oxidase, subunit II  31.31 
 
 		 372 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1903  hypothetical protein  31.19 
 
 		 110 aa  40.8  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.172183  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0945  cytochrome oxidase subunit II  31.31 
 
 		 372 aa  40.8  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.891376  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3135  cytochrome c, class I  29.11 
 
 		 289 aa  40.8  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1678  cytochrome c class I  36 
 
 		 289 aa  40.4  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.250223 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0683  cytochrome c class I  51.28 
 
 		 381 aa  40.4  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3249  cytochrome c class I  34.67 
 
 		 255 aa  40.4  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00726195  hitchhiker  0.0000284914 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1360  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  27.66 
 
 		 308 aa  40.4  0.009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.240618 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1769  c553-type monoheme cytochrome c  55.56 
 
 		 432 aa  40  0.01  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>