62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_1068 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007577  PMT9312_1068  cytochrome cM  100 
 
 		 128 aa  263  5e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11621  hypothetical protein  93 
 
 		 100 aa  199  8e-51  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11631  cytochrome cM  91 
 
 		 100 aa  196  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.362816  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15291  cytochrome cM  47.66 
 
 		 129 aa  129  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.427205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11331  cytochrome cM  52.54 
 
 		 130 aa  129  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.969799 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0695  cytochrome c  46.09 
 
 		 129 aa  125  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09091  cytochrome cM  46.3 
 
 		 125 aa  114  6e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.670452 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1948  cytochrome cM  36.51 
 
 		 137 aa  114  6e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0717  cytochrome cM  37.8 
 
 		 129 aa  107  6e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1478  cytochrome CytM  35.61 
 
 		 145 aa  103  8e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.611234 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2147  cytochrome c class I  38.33 
 
 		 124 aa  94  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.620434 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2103  cytochrome c class I  38.33 
 
 		 124 aa  94  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2140  cytochrome c class I  36.44 
 
 		 124 aa  91.3  4e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.986487  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3942  cytochrome c class I  37.62 
 
 		 109 aa  85.5  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.914915 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4020  cytochrome c, class I  35.09 
 
 		 124 aa  84.7  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.442148  normal  0.970341 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3662  cytochrome c class I  43.02 
 
 		 124 aa  82.8  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2140  cytochrome c, class I  40.7 
 
 		 87 aa  76.6  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0189398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1556  cytochrome c class I  31.03 
 
 		 108 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0799874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1356  cytochrome c class I  31.03 
 
 		 111 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.361491 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1301  cytochrome c class I  29.89 
 
 		 121 aa  47  0.00008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  hitchhiker  0.00128002  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5653  cytochrome c-551  25.47 
 
 		 107 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.432356 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5303  cytochrome c-551  25.47 
 
 		 107 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2794  cytochrome-c oxidase fixP chain  31.65 
 
 		 290 aa  45.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.40028  normal  0.764362 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2575  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  36.59 
 
 		 307 aa  45.4  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.991261  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1913  hypothetical protein  32.61 
 
 		 154 aa  45.1  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000530569  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0428  cytochrome c class I  30.49 
 
 		 111 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0062  Pyrrolo-quinoline quinone  30.77 
 
 		 704 aa  44.7  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.387664 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2618  cytochrome c class I  29.11 
 
 		 110 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.235794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0018  cytochrome c, class I  40.68 
 
 		 138 aa  44.3  0.0006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1814  hypothetical protein  34.52 
 
 		 151 aa  43.9  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4979  cytochrome c-551  24.44 
 
 		 107 aa  43.9  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3724  cytochrome c-551  25.25 
 
 		 112 aa  43.5  0.0009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2412  cytochrome c class I  26.67 
 
 		 120 aa  43.1  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000673714  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5273  cytochrome c-551  23.33 
 
 		 107 aa  42.7  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.717075 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4880  cytochrome c-551  23.33 
 
 		 107 aa  42.7  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5348  cytochrome c-551  25 
 
 		 107 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4865  cytochrome c-551  23.33 
 
 		 107 aa  42.7  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5035  cytochrome c-551  23.33 
 
 		 107 aa  42.7  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5417  cytochrome c-551  23.33 
 
 		 107 aa  42.7  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5291  cytochrome c-551  25 
 
 		 107 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3273  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  32.5 
 
 		 293 aa  42.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.288519  normal  0.62826 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2114  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  34.21 
 
 		 293 aa  42.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5233  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  34.21 
 
 		 293 aa  42.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.558245  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1358  cb-type cytochrome c oxidase subunit III  31.08 
 
 		 152 aa  42.7  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.112598  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1304  cytochrome c class I  25.3 
 
 		 112 aa  42  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.286942  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0942  cytochrome c class I  28.57 
 
 		 112 aa  42  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.312729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3018  cytochrome c class I  25.25 
 
 		 118 aa  41.6  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0223373  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6928  cytochrome c class I  27.16 
 
 		 112 aa  41.6  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.405337 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0017  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  34.21 
 
 		 293 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5100  cytochrome c class I  33.72 
 
 		 284 aa  41.6  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.449412  normal  0.538396 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3770  cytochrome c oxidase subunit II  23.3 
 
 		 349 aa  41.2  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1903  hypothetical protein  41.54 
 
 		 110 aa  41.2  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.172183  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0656  cytochrome c, class I  50 
 
 		 283 aa  40.8  0.006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.93712 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3331  cytochrome d1, heme region  34.21 
 
 		 519 aa  40.8  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6158  cytochrome c class I  25.32 
 
 		 112 aa  40.8  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0014  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  31.51 
 
 		 293 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4143  cytochrome c class I  25.74 
 
 		 118 aa  40.4  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000375642  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4193  cytochrome c-550  25.26 
 
 		 118 aa  40  0.01  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000176262  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4313  cytochrome c-550  25.26 
 
 		 118 aa  40  0.01  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.74805e-54 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2730  cytochrome c550, putative  31.94 
 
 		 148 aa  40  0.01  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0787829  normal  0.668449 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1229  cytochrome c class I  30.77 
 
 		 98 aa  40  0.01  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4514  cytochrome c-550  25.26 
 
 		 118 aa  40  0.01  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000708555  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>