135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3135 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3135  cytochrome c, class I  100 
 
 		 289 aa  587  1e-167  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14180  cytochrome c, mono- and diheme variants family  51.31 
 
 		 266 aa  267  1e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.616928  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16190  cytochrome c, mono- and diheme variants family  48.16 
 
 		 263 aa  262  6e-69  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.188569  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1678  cytochrome c class I  45.36 
 
 		 289 aa  257  2e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.250223 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0963  cytochrome c, class I  50 
 
 		 268 aa  251  9.000000000000001e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0745087 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1447  cytochrome c class I  47.31 
 
 		 284 aa  249  5e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0356963  normal  0.171198 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1891  cytochrome c class I  47.41 
 
 		 259 aa  234  1.0000000000000001e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.527374  hitchhiker  0.000337472 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1295  cytochrome c class I  44.52 
 
 		 276 aa  233  3e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.669902 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15700  cytochrome c, mono- and diheme variants family  49.4 
 
 		 259 aa  233  3e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.871134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2676  hypothetical protein  46.95 
 
 		 269 aa  231  1e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.543217 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12130  cytochrome c, mono- and diheme variants family  50 
 
 		 256 aa  229  5e-59  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.298886  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3251  cytochrome c class I  47.83 
 
 		 277 aa  228  1e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0775555 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2210  cytochrome c, class I  47.99 
 
 		 262 aa  226  3e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0119453  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1374  cytochrome c class I  47.58 
 
 		 270 aa  220  1.9999999999999999e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.317055  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1810  cytochrome c class I  44.53 
 
 		 294 aa  216  4e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.780394  normal  0.101949 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1947  cytochrome c class I  46.52 
 
 		 262 aa  214  1.9999999999999998e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000151337 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3526  cytochrome c class I  44.92 
 
 		 277 aa  213  3.9999999999999995e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021541 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1021  ubiquinol-cytochrome c reductase cytochrome c subunit  41.61 
 
 		 307 aa  210  2e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.121328  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3294  cytochrome c, class I  43.93 
 
 		 277 aa  207  1e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.79873  normal  0.176806 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3062  cytochrome c class I  44.48 
 
 		 303 aa  206  3e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0184477  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3107  cytochrome c, class I  42.19 
 
 		 305 aa  206  4e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.510771  normal  0.352992 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2076  cytochrome c class I  50.66 
 
 		 261 aa  205  8e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3341  cytochrome c class I  43.02 
 
 		 295 aa  204  2e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10680  cytochrome c, mono- and diheme variants family  44.2 
 
 		 275 aa  203  3e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0523281  normal  0.768267 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12222  ubiquinol-cytochrome C reductase qcrC (cytochrome C subunit)  42.37 
 
 		 280 aa  203  3e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4119  cytochrome c class I  44.32 
 
 		 271 aa  200  1.9999999999999998e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.83541 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2009  cytochrome c class I  48.59 
 
 		 259 aa  200  3e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3292  cytochrome c, class I  44.36 
 
 		 272 aa  195  8.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.250177  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3354  cytochrome c, class I  44.36 
 
 		 272 aa  195  8.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0582943  normal  0.0591201 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3303  cytochrome c, class I  44.36 
 
 		 272 aa  195  8.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.227675 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2955  cytochrome c, class I  44.49 
 
 		 278 aa  189  5e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.136352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3558  cytochrome c, class I  43.51 
 
 		 273 aa  186  4e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0912153 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2693  cytochrome c class I  42.55 
 
 		 306 aa  185  9e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.714589  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3134  cytochrome c class I  35.62 
 
 		 311 aa  181  1e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3056  cytochrome c class I  46.26 
 
 		 295 aa  176  3e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.294486  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3249  cytochrome c class I  40.95 
 
 		 255 aa  161  1e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00726195  hitchhiker  0.0000284914 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1827  cytochrome c class I  38.43 
 
 		 280 aa  149  6e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0377  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  27.75 
 
 		 292 aa  59.3  0.00000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0590381  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2377  cytochrome c, class I  25.52 
 
 		 224 aa  54.3  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000176036  hitchhiker  0.0000215746 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0905  cytochrome c oxidase, Cbb3-type, subunit III  26.6 
 
 		 287 aa  53.9  0.000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.269734  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0178  cytochrome c oxidase, subunit II  24.42 
 
 		 513 aa  53.5  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1916  cytochrome c oxidase, Cbb3-type, subunit III  27.55 
 
 		 282 aa  53.1  0.000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4253  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  28.66 
 
 		 313 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.49464  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1660  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  26.53 
 
 		 287 aa  52  0.00001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0290388  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1479  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  26.53 
 
 		 287 aa  52  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1615  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  28.66 
 
 		 313 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0748863  normal  0.0271548 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1108  hypothetical protein  26.64 
 
 		 248 aa  51.6  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1968  cytochrome c class I  27.92 
 
 		 238 aa  51.2  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000548419  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2214  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  25.81 
 
 		 322 aa  50.8  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2217  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  26.97 
 
 		 318 aa  51.6  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.04222  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1610  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  28.66 
 
 		 325 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00269268  hitchhiker  0.0066634 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1396  cb-type cytochrome c oxidase subunit III  23.33 
 
 		 304 aa  50.8  0.00003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4258  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  29.56 
 
 		 325 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.816603 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1848  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  26.32 
 
 		 318 aa  49.7  0.00005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0149886  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1988  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  27.45 
 
 		 323 aa  49.7  0.00005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0201798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0456  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  25.7 
 
 		 312 aa  50.1  0.00005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.844005  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1833  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  26.02 
 
 		 287 aa  50.1  0.00005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.432152  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0161  cytochrome c class I  24.58 
 
 		 254 aa  49.3  0.00007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000207523  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0084  Cbb3-type cytochrome c oxidase subunit III  25.51 
 
 		 307 aa  49.3  0.00008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000832498  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2739  cytochrome c, class I  28.26 
 
 		 218 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.437808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4490  hypothetical protein  27.45 
 
 		 322 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2204  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  27.45 
 
 		 322 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000397613  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2167  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  27.45 
 
 		 322 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0262117  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2217  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  27.45 
 
 		 322 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.106993  normal  0.268308 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3576  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  27.39 
 
 		 326 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2217  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  27.45 
 
 		 322 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000127298  normal  0.441817 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0129  cytochrome c-type protein  31.02 
 
 		 213 aa  48.1  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.19667  normal  0.20244 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1909  cytochrome c, class I  31.16 
 
 		 206 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2009  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  26.28 
 
 		 322 aa  47.8  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0902386  hitchhiker  0.0000000272898 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1966  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  26.28 
 
 		 322 aa  47.8  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00926304  hitchhiker  0.00889683 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2110  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  26.28 
 
 		 322 aa  47.8  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0408813  normal  0.504179 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1956  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  27.45 
 
 		 322 aa  47.8  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5923  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  26.56 
 
 		 293 aa  47.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.123388  normal  0.389873 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3999  cytochrome c oxidase subunit II  22.65 
 
 		 524 aa  48.1  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4355  cytochrome c, class I  29.51 
 
 		 223 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1358  cb-type cytochrome c oxidase subunit III  33.33 
 
 		 152 aa  47.4  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.112598  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3572  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  27.39 
 
 		 313 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1360  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  25.12 
 
 		 308 aa  47.4  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.240618 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0726  cytochrome c oxidase, Cbb3-type, subunit III  25.13 
 
 		 287 aa  46.6  0.0004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0229  cytochrome c  29.3 
 
 		 205 aa  47  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.779368  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3823  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  28.66 
 
 		 325 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.85561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1455  cytochrome c class I  22.69 
 
 		 278 aa  46.6  0.0005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000371587  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2361  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  26.28 
 
 		 322 aa  46.2  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1587  cytochrome c, class I  25.24 
 
 		 220 aa  46.2  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0500716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1948  cytochrome cM  30.23 
 
 		 137 aa  46.2  0.0006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2077  cytochrome c class I  30.85 
 
 		 153 aa  45.8  0.0007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1526  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  27.52 
 
 		 311 aa  45.8  0.0008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2422  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  24.34 
 
 		 325 aa  45.8  0.0008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000195931  hitchhiker  0.0000802746 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6158  cytochrome c class I  35.29 
 
 		 112 aa  45.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2013  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  28.57 
 
 		 324 aa  45.4  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00187341  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44360  putative cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  25.16 
 
 		 308 aa  45.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.922379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1787  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  24.88 
 
 		 296 aa  45.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.832372  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2602  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  25.16 
 
 		 308 aa  45.4  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000191523  normal  0.411563 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1003  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  27.52 
 
 		 304 aa  45.1  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0942  cytochrome c class I  36.47 
 
 		 112 aa  45.4  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.312729  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0327  cytochrome c class I  27.74 
 
 		 269 aa  45.4  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5347  putative cytochrome c  28.06 
 
 		 272 aa  44.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.118303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3776  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit III  25.16 
 
 		 308 aa  45.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5004  hypothetical protein  31.18 
 
 		 1010 aa  44.3  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3780  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit III  26.32 
 
 		 318 aa  44.3  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>