60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_3292 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008705  Mkms_3354  cytochrome c, class I  100 
 
 		 272 aa  553  1e-156  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0582943  normal  0.0591201 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3303  cytochrome c, class I  100 
 
 		 272 aa  553  1e-156  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.227675 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3292  cytochrome c, class I  100 
 
 		 272 aa  553  1e-156  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.250177  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3558  cytochrome c, class I  82.05 
 
 		 273 aa  411  1e-114  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0912153 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2955  cytochrome c, class I  84.62 
 
 		 278 aa  396  1e-109  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.136352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12222  ubiquinol-cytochrome C reductase qcrC (cytochrome C subunit)  74.12 
 
 		 280 aa  380  1e-105  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2693  cytochrome c class I  57.04 
 
 		 306 aa  307  9e-83  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.714589  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1374  cytochrome c class I  60.31 
 
 		 270 aa  305  7e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.317055  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10680  cytochrome c, mono- and diheme variants family  61.74 
 
 		 275 aa  298  7e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0523281  normal  0.768267 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3056  cytochrome c class I  61.51 
 
 		 295 aa  278  1e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.294486  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3341  cytochrome c class I  52.8 
 
 		 295 aa  263  2e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3294  cytochrome c, class I  51.32 
 
 		 277 aa  254  1.0000000000000001e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.79873  normal  0.176806 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3526  cytochrome c class I  51.37 
 
 		 277 aa  243  1.9999999999999999e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021541 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3249  cytochrome c class I  54.27 
 
 		 255 aa  236  3e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00726195  hitchhiker  0.0000284914 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16190  cytochrome c, mono- and diheme variants family  46.18 
 
 		 263 aa  233  3e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.188569  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1891  cytochrome c class I  48.65 
 
 		 259 aa  228  1e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.527374  hitchhiker  0.000337472 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4119  cytochrome c class I  47.08 
 
 		 271 aa  227  2e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.83541 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1295  cytochrome c class I  46.52 
 
 		 276 aa  225  5.0000000000000005e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.669902 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1447  cytochrome c class I  47.51 
 
 		 284 aa  225  6e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0356963  normal  0.171198 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15700  cytochrome c, mono- and diheme variants family  48.66 
 
 		 259 aa  224  1e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.871134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0963  cytochrome c, class I  46.07 
 
 		 268 aa  221  7e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0745087 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2676  hypothetical protein  52.07 
 
 		 269 aa  220  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.543217 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12130  cytochrome c, mono- and diheme variants family  49.32 
 
 		 256 aa  219  5e-56  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.298886  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14180  cytochrome c, mono- and diheme variants family  46.56 
 
 		 266 aa  216  2.9999999999999998e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.616928  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1678  cytochrome c class I  46.3 
 
 		 289 aa  214  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.250223 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3107  cytochrome c, class I  44.44 
 
 		 305 aa  211  7.999999999999999e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.510771  normal  0.352992 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1810  cytochrome c class I  45.42 
 
 		 294 aa  208  7e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.780394  normal  0.101949 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3062  cytochrome c class I  46.59 
 
 		 303 aa  202  4e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0184477  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3251  cytochrome c class I  46.02 
 
 		 277 aa  201  7e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0775555 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2210  cytochrome c, class I  47.91 
 
 		 262 aa  200  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0119453  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2076  cytochrome c class I  52.51 
 
 		 261 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1947  cytochrome c class I  46.05 
 
 		 262 aa  191  8e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000151337 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3135  cytochrome c, class I  46.38 
 
 		 289 aa  189  2.9999999999999997e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2009  cytochrome c class I  47.52 
 
 		 259 aa  190  2.9999999999999997e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1021  ubiquinol-cytochrome c reductase cytochrome c subunit  36.15 
 
 		 307 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.121328  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3134  cytochrome c class I  33.11 
 
 		 311 aa  162  8.000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1827  cytochrome c class I  36.11 
 
 		 280 aa  154  2e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2545  putative cytochrome c  28.45 
 
 		 350 aa  52.8  0.000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0161  cytochrome c class I  22.32 
 
 		 254 aa  47  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000207523  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0624  cytochrome c, class I  25.82 
 
 		 211 aa  47  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1916  cytochrome c oxidase, Cbb3-type, subunit III  26.84 
 
 		 282 aa  46.2  0.0005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0456  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  26.92 
 
 		 312 aa  45.8  0.0007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.844005  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1360  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  27.07 
 
 		 308 aa  45.8  0.0008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.240618 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1968  cytochrome c class I  25.91 
 
 		 238 aa  45.8  0.0008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000548419  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0084  Cbb3-type cytochrome c oxidase subunit III  27 
 
 		 307 aa  45.1  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000832498  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1948  cytochrome cM  32.91 
 
 		 137 aa  45.4  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09091  cytochrome cM  32.89 
 
 		 125 aa  44.3  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.670452 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0717  cytochrome cM  31.94 
 
 		 129 aa  44.3  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3841  cytochrome c variant  30.3 
 
 		 230 aa  43.5  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5347  putative cytochrome c  25.82 
 
 		 272 aa  43.9  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.118303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5485  cytochrome c class I  35.05 
 
 		 561 aa  43.5  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.233629 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6817  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  30.05 
 
 		 474 aa  43.1  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166846  normal  0.164997 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1569  cytochrome c, class I  29.86 
 
 		 141 aa  43.1  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.832933  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1673  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  27.43 
 
 		 307 aa  43.1  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.528501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3138  cytochrome c, class I  26.67 
 
 		 205 aa  43.1  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0726  cytochrome c oxidase, Cbb3-type, subunit III  25.93 
 
 		 287 aa  42.7  0.006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0543  cytochrome c family protein  31.16 
 
 		 208 aa  42.7  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1358  cb-type cytochrome c oxidase subunit III  32.53 
 
 		 152 aa  42.7  0.007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.112598  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3662  cytochrome c class I  31.08 
 
 		 124 aa  42.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0957  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  26.19 
 
 		 723 aa  42  0.01  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.12457  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>