162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3251 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_3251  cytochrome c class I  100 
 
 
277 aa  556  1e-157  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0775555 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16190  cytochrome c, mono- and diheme variants family  55.31 
 
 
263 aa  295  5e-79  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.188569  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14180  cytochrome c, mono- and diheme variants family  57.88 
 
 
266 aa  294  9e-79  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.616928  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15700  cytochrome c, mono- and diheme variants family  58.97 
 
 
259 aa  291  1e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.871134  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1447  cytochrome c class I  55.07 
 
 
284 aa  289  3e-77  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0356963  normal  0.171198 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1891  cytochrome c class I  55.11 
 
 
259 aa  277  1e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.527374  hitchhiker  0.000337472 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1678  cytochrome c class I  51.82 
 
 
289 aa  269  4e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.250223 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1295  cytochrome c class I  48.91 
 
 
276 aa  269  4e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.669902 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12130  cytochrome c, mono- and diheme variants family  59.03 
 
 
256 aa  265  4e-70  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.298886  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2210  cytochrome c, class I  53.65 
 
 
262 aa  265  5e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0119453  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1947  cytochrome c class I  52.92 
 
 
262 aa  257  2e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000151337 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2676  hypothetical protein  50.55 
 
 
269 aa  255  7e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.543217 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0963  cytochrome c, class I  49.63 
 
 
268 aa  254  8e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0745087 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2076  cytochrome c class I  57.14 
 
 
261 aa  238  5.999999999999999e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2009  cytochrome c class I  55.47 
 
 
259 aa  234  1.0000000000000001e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3135  cytochrome c, class I  47.83 
 
 
289 aa  229  4e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3107  cytochrome c, class I  47.66 
 
 
305 aa  221  9e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.510771  normal  0.352992 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1374  cytochrome c class I  44.52 
 
 
270 aa  219  3e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.317055  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1810  cytochrome c class I  46.88 
 
 
294 aa  218  1e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.780394  normal  0.101949 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3062  cytochrome c class I  44.59 
 
 
303 aa  217  2e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0184477  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3294  cytochrome c, class I  44.2 
 
 
277 aa  216  2e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.79873  normal  0.176806 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3341  cytochrome c class I  44.84 
 
 
295 aa  209  3e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12222  ubiquinol-cytochrome C reductase qcrC (cytochrome C subunit)  44.79 
 
 
280 aa  208  9e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3526  cytochrome c class I  45.59 
 
 
277 aa  207  2e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0021541 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1021  ubiquinol-cytochrome c reductase cytochrome c subunit  39.54 
 
 
307 aa  205  5e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.121328  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4119  cytochrome c class I  44.44 
 
 
271 aa  204  1e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.83541 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2955  cytochrome c, class I  45.06 
 
 
278 aa  198  7e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.136352  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10680  cytochrome c, mono- and diheme variants family  44.15 
 
 
275 aa  197  1.0000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0523281  normal  0.768267 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3134  cytochrome c class I  37.99 
 
 
311 aa  190  2e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3558  cytochrome c, class I  43.63 
 
 
273 aa  189  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0912153 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3292  cytochrome c, class I  43.35 
 
 
272 aa  188  9e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.250177  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3354  cytochrome c, class I  43.35 
 
 
272 aa  188  9e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0582943  normal  0.0591201 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3303  cytochrome c, class I  43.35 
 
 
272 aa  188  9e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.227675 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3056  cytochrome c class I  44.64 
 
 
295 aa  180  2.9999999999999997e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.294486  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3249  cytochrome c class I  42.74 
 
 
255 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00726195  hitchhiker  0.0000284914 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2693  cytochrome c class I  37.63 
 
 
306 aa  168  8e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.714589  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1827  cytochrome c class I  39.11 
 
 
280 aa  152  5e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1360  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  29.44 
 
 
308 aa  63.2  0.000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.240618 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0456  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  28.16 
 
 
312 aa  62.8  0.000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.844005  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5923  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  27.78 
 
 
293 aa  58.5  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.123388  normal  0.389873 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19980  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  30.47 
 
 
306 aa  57.4  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.181448  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1798  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  27.78 
 
 
292 aa  58.2  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0775  cytochrome c oxidase cbb3-type, subunit III  34.25 
 
 
374 aa  57  0.0000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0709529  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2602  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  30.61 
 
 
308 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000191523  normal  0.411563 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0781  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  33.56 
 
 
382 aa  55.8  0.0000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.279912  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1279  cytochrome C oxidase subunit III  28.93 
 
 
326 aa  54.7  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.55862 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1587  cytochrome c, class I  27.08 
 
 
220 aa  54.3  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0500716  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1003  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  30.34 
 
 
304 aa  53.9  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0634  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  30.3 
 
 
304 aa  53.9  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1526  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  30.86 
 
 
311 aa  53.9  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2041  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit III  26.21 
 
 
304 aa  53.1  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.112855  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1200  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  27.67 
 
 
307 aa  52.4  0.000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.944048  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3953  Quinoprotein glucose dehydrogenase  37.65 
 
 
747 aa  52.4  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1107  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  27.18 
 
 
307 aa  50.8  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.1867  normal  0.890058 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2253  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  31.47 
 
 
298 aa  51.2  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.168664  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44400  putative cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  28.37 
 
 
318 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0377  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  25.77 
 
 
292 aa  51.2  0.00002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0590381  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3819  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  26.95 
 
 
313 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.718495 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3780  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit III  28.37 
 
 
318 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1794  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  29.79 
 
 
325 aa  50.4  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.448855  normal  0.0580758 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2038  cytochrome c oxidase cbb3-type, subunit III  26.6 
 
 
304 aa  50.1  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0645844  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3802  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  24.64 
 
 
455 aa  50.1  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.503165 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4253  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  26.24 
 
 
313 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.49464  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1848  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  26.67 
 
 
318 aa  49.7  0.00005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0149886  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44360  putative cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  33.71 
 
 
308 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.922379  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1968  cytochrome c class I  27.65 
 
 
238 aa  49.7  0.00005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000548419  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1455  cytochrome c class I  24.8 
 
 
278 aa  49.7  0.00005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000371587  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1956  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  28.37 
 
 
322 aa  49.7  0.00005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5018  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  29.24 
 
 
287 aa  49.3  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5932  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  27.69 
 
 
289 aa  49.7  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.322856  normal  0.495001 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6265  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  27.69 
 
 
289 aa  49.7  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.142904 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0161  cytochrome c class I  21.93 
 
 
254 aa  49.3  0.00007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000207523  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1087  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  31.28 
 
 
304 aa  49.3  0.00007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.497321  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2001  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  26.06 
 
 
325 aa  48.9  0.00009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.659912  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0683  cytochrome c class I  34.62 
 
 
381 aa  48.9  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3776  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit III  26.24 
 
 
308 aa  48.9  0.00009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2217  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  26.67 
 
 
318 aa  48.9  0.00009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.04222  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2778  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  30.32 
 
 
305 aa  48.5  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.452004  normal  0.247491 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2009  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  28.37 
 
 
322 aa  48.9  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0902386  hitchhiker  0.0000000272898 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1966  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  28.37 
 
 
322 aa  48.9  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00926304  hitchhiker  0.00889683 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2110  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  28.37 
 
 
322 aa  48.5  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0408813  normal  0.504179 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1787  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  26.32 
 
 
296 aa  48.9  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.832372  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02300  hypothetical protein  28.49 
 
 
324 aa  48.5  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3572  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  25 
 
 
313 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4258  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  26.24 
 
 
325 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.816603 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4229  heme-binding protein NirN  26.97 
 
 
542 aa  47.8  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2361  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  28.37 
 
 
322 aa  47.8  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3416  cytochrome c oxidase cbb3-type, subunit III  27.66 
 
 
325 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0306402 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1933  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  26.62 
 
 
305 aa  47.8  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0570892  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4302  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  28.57 
 
 
305 aa  47.8  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0300725  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1140  cytochrome c, mono- and diheme variant  30.95 
 
 
269 aa  48.1  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.000421025  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2607  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  27.81 
 
 
332 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00078494  normal  0.780558 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003470  cytochrome c oxidase subunit CcoP  28.44 
 
 
324 aa  47.8  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.204703  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1615  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  25.53 
 
 
313 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0748863  normal  0.0271548 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1820  cytochrome c oxidase cbb3-type, subunit III  26.24 
 
 
327 aa  47  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.700431  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1019  hypothetical protein  26 
 
 
296 aa  47  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.166316 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2217  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  28.37 
 
 
322 aa  47.4  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.106993  normal  0.268308 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2204  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  28.37 
 
 
322 aa  47.4  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000397613  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0376  cytochrome c oxidase, Cbb3-type, subunit III  27.54 
 
 
287 aa  47  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2167  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  28.37 
 
 
322 aa  47.4  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0262117  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>