65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3526 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_3526  cytochrome c class I  100 
 
 
277 aa  560  1.0000000000000001e-159  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0021541 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3294  cytochrome c, class I  91.34 
 
 
277 aa  509  1e-143  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.79873  normal  0.176806 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4119  cytochrome c class I  60.62 
 
 
271 aa  299  4e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.83541 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3341  cytochrome c class I  58.37 
 
 
295 aa  278  6e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1374  cytochrome c class I  53.99 
 
 
270 aa  259  4e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.317055  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1295  cytochrome c class I  50.77 
 
 
276 aa  251  7e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.669902 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10680  cytochrome c, mono- and diheme variants family  53.03 
 
 
275 aa  250  2e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0523281  normal  0.768267 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12222  ubiquinol-cytochrome C reductase qcrC (cytochrome C subunit)  50.59 
 
 
280 aa  241  9e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2676  hypothetical protein  55.46 
 
 
269 aa  241  1e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.543217 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3292  cytochrome c, class I  51.36 
 
 
272 aa  231  9e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.250177  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3303  cytochrome c, class I  51.36 
 
 
272 aa  231  9e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.227675 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3354  cytochrome c, class I  51.36 
 
 
272 aa  231  9e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0582943  normal  0.0591201 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0963  cytochrome c, class I  47.37 
 
 
268 aa  230  2e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0745087 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2955  cytochrome c, class I  49.8 
 
 
278 aa  227  2e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.136352  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15700  cytochrome c, mono- and diheme variants family  48.05 
 
 
259 aa  224  1e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.871134  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3558  cytochrome c, class I  47.84 
 
 
273 aa  224  2e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0912153 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3249  cytochrome c class I  54.26 
 
 
255 aa  223  4e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00726195  hitchhiker  0.0000284914 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1891  cytochrome c class I  47.04 
 
 
259 aa  222  6e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.527374  hitchhiker  0.000337472 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1678  cytochrome c class I  42.75 
 
 
289 aa  218  6e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.250223 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1447  cytochrome c class I  43.53 
 
 
284 aa  216  2e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0356963  normal  0.171198 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16190  cytochrome c, mono- and diheme variants family  43.7 
 
 
263 aa  217  2e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.188569  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14180  cytochrome c, mono- and diheme variants family  45.64 
 
 
266 aa  215  5e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.616928  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2210  cytochrome c, class I  47.64 
 
 
262 aa  214  9.999999999999999e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0119453  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1810  cytochrome c class I  46.56 
 
 
294 aa  214  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.780394  normal  0.101949 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2693  cytochrome c class I  43.46 
 
 
306 aa  213  3.9999999999999995e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.714589  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3107  cytochrome c, class I  47.77 
 
 
305 aa  212  4.9999999999999996e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.510771  normal  0.352992 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12130  cytochrome c, mono- and diheme variants family  48.84 
 
 
256 aa  211  1e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.298886  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3056  cytochrome c class I  49.81 
 
 
295 aa  204  1e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.294486  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1947  cytochrome c class I  48.58 
 
 
262 aa  204  1e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000151337 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3062  cytochrome c class I  48.35 
 
 
303 aa  203  3e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0184477  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3251  cytochrome c class I  46.64 
 
 
277 aa  202  4e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0775555 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3135  cytochrome c, class I  45.31 
 
 
289 aa  198  9e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2009  cytochrome c class I  45.19 
 
 
259 aa  187  2e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2076  cytochrome c class I  46.23 
 
 
261 aa  177  1e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1021  ubiquinol-cytochrome c reductase cytochrome c subunit  36.12 
 
 
307 aa  171  2e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.121328  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3134  cytochrome c class I  35.76 
 
 
311 aa  167  1e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1827  cytochrome c class I  41.31 
 
 
280 aa  157  2e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2602  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  31.15 
 
 
308 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000191523  normal  0.411563 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09091  cytochrome cM  32.97 
 
 
125 aa  47  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.670452 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0159  cytochrome c, class I  28.57 
 
 
256 aa  46.6  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2542  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  28.57 
 
 
294 aa  46.2  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.854548 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0456  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  26.46 
 
 
312 aa  45.8  0.0007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.844005  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1172  putative bifunctional cbb3-type cytochrome c oxidase subunit II/cytochrome c  49.25 
 
 
339 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44360  putative cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  26.18 
 
 
308 aa  45.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.922379  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1333  putative bifunctional cbb3-type cytochrome c oxidase subunit II/cytochrome c  49.25 
 
 
339 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3776  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit III  26.18 
 
 
308 aa  45.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1231  putative bifunctional cbb3-type cytochrome c oxidase subunit II/cytochrome c  49.25 
 
 
339 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1360  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  26.23 
 
 
308 aa  45.1  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.240618 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0105  putative cytochrome c, class I precursor  48.89 
 
 
144 aa  44.3  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.366787 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0014  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  28.06 
 
 
293 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3854  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  26.19 
 
 
292 aa  44.7  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0084  Cbb3-type cytochrome c oxidase subunit III  22.61 
 
 
307 aa  44.3  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000832498  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0360  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  29.37 
 
 
287 aa  44.7  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2696  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  36.14 
 
 
726 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0312  putative cytochrome c4 precursor  31.16 
 
 
193 aa  44.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.717329 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0376  cytochrome c oxidase, Cbb3-type, subunit III  29.37 
 
 
287 aa  44.7  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2630  cytochrome c, class I  25 
 
 
220 aa  43.9  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.930488  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0698  cytochrome c class I  36.71 
 
 
189 aa  43.1  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1003  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  28.57 
 
 
304 aa  43.1  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2545  putative cytochrome c  25 
 
 
350 aa  43.1  0.006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2739  cytochrome c, class I  31.13 
 
 
218 aa  42.7  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.437808  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5932  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  31.03 
 
 
289 aa  42.4  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.322856  normal  0.495001 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6265  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  31.03 
 
 
289 aa  42.4  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.142904 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1798  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  21.2 
 
 
292 aa  42  0.01  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3273  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  27.27 
 
 
293 aa  42  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.288519  normal  0.62826 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>