More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1968 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_1968  cytochrome c class I  100 
 
 		 238 aa  474  1e-133  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000548419  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0123  cytochrome c class I  64.06 
 
 		 418 aa  240  2e-62  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.266844  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2170  cytochrome c class I  30.4 
 
 		 221 aa  88.6  9e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0013  cytochrome c, class I  32.44 
 
 		 229 aa  85.5  6e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.741785  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0210  cytochrome c, class I  31.68 
 
 		 200 aa  83.6  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.478667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001915  cytochrome c4  32.5 
 
 		 205 aa  80.9  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.352914  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1068  cytochrome c family protein  30.49 
 
 		 206 aa  80.1  0.00000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.230608  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00575  cytochrome c553  31.68 
 
 		 205 aa  79.7  0.00000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0229  cytochrome c  29.17 
 
 		 205 aa  78.6  0.00000000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.779368  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00014  cytochrome c4 cytochrome C, class I in atlantica  31.98 
 
 		 207 aa  77.4  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0264  cytochrome c class I  51.9 
 
 		 112 aa  76.6  0.0000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.453378  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2406  cytochrome c4  32.5 
 
 		 223 aa  75.9  0.0000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0129  cytochrome c-type protein  32.38 
 
 		 213 aa  75.1  0.0000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.19667  normal  0.20244 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1848  cytochrome c class I  31.84 
 
 		 238 aa  74.7  0.000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.298737  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3622  cytochrome c, class I  29.69 
 
 		 206 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00635609  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3716  cytochrome c, class I  30.49 
 
 		 206 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000156417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3945  cytochrome c, class I  31.58 
 
 		 207 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.405176  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0283  cytochrome c family protein  30.45 
 
 		 318 aa  72.8  0.000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0091  cytochrome c, class I  29.67 
 
 		 206 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000145105  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2853  cytochrome c, class I  29.95 
 
 		 205 aa  72.4  0.000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.530376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2038  cytochrome c oxidase cbb3-type, subunit III  31.47 
 
 		 304 aa  71.2  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0645844  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2776  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  31.05 
 
 		 310 aa  71.6  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000169467 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2414  putative cytochrome c  30.49 
 
 		 206 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.281547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1223  cytochrome c, class I  30.43 
 
 		 221 aa  70.1  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.153054  normal  0.842605 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0089  cytochrome c class I  28.92 
 
 		 205 aa  68.9  0.00000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2603  cytochrome c family protein  27.86 
 
 		 202 aa  67.8  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.44743  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1279  cytochrome C oxidase subunit III  31.66 
 
 		 326 aa  67.4  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.55862 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2881  cytochrome c, class I  46.59 
 
 		 103 aa  67.4  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1721  cytochrome c, class I  28.5 
 
 		 204 aa  67.4  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1185  cytochrome c family protein  29.44 
 
 		 214 aa  67  0.0000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.472956  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4347  cytochrome c class I  27.4 
 
 		 207 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000402028  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4292  cytochrome c class I  27.4 
 
 		 207 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000136847  unclonable  0.00000000000512206 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0051  cytochrome c class I  27.4 
 
 		 207 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00284279  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4487  cytochrome c class I  27.4 
 
 		 207 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000352733  normal  0.0165724 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0100  cytochrome c class I  27.15 
 
 		 206 aa  65.9  0.0000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1200  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  31.94 
 
 		 307 aa  65.9  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.944048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2778  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  29.5 
 
 		 305 aa  65.5  0.0000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.452004  normal  0.247491 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3779  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  29.77 
 
 		 306 aa  65.5  0.0000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1167  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  29.44 
 
 		 304 aa  65.5  0.0000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1107  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  32.11 
 
 		 307 aa  65.5  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.1867  normal  0.890058 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2041  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit III  29.95 
 
 		 304 aa  65.1  0.0000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.112855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1095  cytochrome c553-like protein  31.25 
 
 		 220 aa  64.7  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3776  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit III  31.16 
 
 		 308 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0687  cytochrome c class I  27.67 
 
 		 225 aa  65.1  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1087  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  29.95 
 
 		 304 aa  64.7  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.497321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1794  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  29.85 
 
 		 325 aa  64.3  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.448855  normal  0.0580758 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4302  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  30.37 
 
 		 305 aa  64.7  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0300725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44360  putative cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  31.16 
 
 		 308 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.922379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1589  class I diheme cytochrome c4  28.76 
 
 		 191 aa  64.3  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3951  cytochrome c, class I  29.05 
 
 		 221 aa  64.3  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.2644 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0861  cytochrome c, class I  26.78 
 
 		 225 aa  63.9  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4466  cytochrome c class I  27.66 
 
 		 230 aa  63.2  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.657614  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1003  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  29.44 
 
 		 304 aa  63.5  0.000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0149  cytochrome c class I  38.3 
 
 		 287 aa  63.5  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.481052  normal  0.118184 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0057  cytochrome c class I  27.59 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.53791  hitchhiker  0.00143417 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2821  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  30.37 
 
 		 303 aa  62.8  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.106321  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2739  cytochrome c, class I  30.37 
 
 		 218 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.437808  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0138  hypothetical protein  28.06 
 
 		 200 aa  62.4  0.000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0040  cytochrome c class I  24.38 
 
 		 207 aa  62.4  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2793  cytochrome c, class I  31.18 
 
 		 379 aa  62.4  0.000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0531198  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2361  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  28.36 
 
 		 322 aa  62  0.000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0552  cytochrome c, class I  27.68 
 
 		 209 aa  62  0.000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4666  cytochrome c  25.6 
 
 		 207 aa  61.6  0.000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1933  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  29.8 
 
 		 305 aa  61.6  0.000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0570892  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2217  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  28.08 
 
 		 322 aa  61.6  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.106993  normal  0.268308 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4111  cytochrome c, class I  26.44 
 
 		 207 aa  61.6  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.148177  normal  0.590499 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5102  cytochrome c class I  28.36 
 
 		 205 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0768786 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2204  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  28.36 
 
 		 322 aa  61.6  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000397613  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1764  cytochrome c, class I  29.74 
 
 		 382 aa  61.6  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000218169  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0094  cytochrome c, class I  26.22 
 
 		 206 aa  61.6  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00310871  decreased coverage  0.00000781089 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3908  cytochrome c, class I  25.6 
 
 		 207 aa  61.2  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2475  putative cytochrome C oxidase (subunit III) transmembrane protein  30.1 
 
 		 307 aa  61.6  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.48971  normal  0.0879223 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4490  hypothetical protein  28.36 
 
 		 322 aa  61.6  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2217  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  28.36 
 
 		 322 aa  61.6  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000127298  normal  0.441817 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3403  cytochrome c class I  27.19 
 
 		 266 aa  61.6  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.670594  normal  0.50409 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3907  cytochrome c, class I  26.44 
 
 		 207 aa  61.2  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0045605  normal  0.272938 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3999  cytochrome c, class I  26.44 
 
 		 207 aa  61.2  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.898029  normal  0.022349 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2167  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  28.08 
 
 		 322 aa  61.6  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0262117  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1360  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  31.91 
 
 		 308 aa  60.8  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.240618 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0123  hypothetical protein  27.55 
 
 		 200 aa  60.8  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1587  cytochrome c, class I  26.34 
 
 		 220 aa  60.5  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0500716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2807  cytochrome c class I  30.69 
 
 		 217 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.988864 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1770  cytochrome c553-like protein  26.75 
 
 		 195 aa  60.5  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.290935 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2110  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  28.36 
 
 		 322 aa  60.5  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0408813  normal  0.504179 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1956  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  28.36 
 
 		 322 aa  60.5  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0281  cytochrome c class I  30.05 
 
 		 217 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.174718  normal  0.337626 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2009  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  28.36 
 
 		 322 aa  60.5  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0902386  hitchhiker  0.0000000272898 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1966  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  28.36 
 
 		 322 aa  60.5  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00926304  hitchhiker  0.00889683 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3416  cytochrome c oxidase cbb3-type, subunit III  30.81 
 
 		 325 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0306402 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2356  cytochrome c, class I  28.43 
 
 		 222 aa  60.1  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2878  cytochrome c class I  29.33 
 
 		 219 aa  60.1  0.00000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2395  cytochrome c family protein  29.9 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.510701  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0346  cytochrome c, class I  31.75 
 
 		 217 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0101877 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3555  cytochrome c, class I  28.85 
 
 		 219 aa  59.3  0.00000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.411936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1988  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  28.86 
 
 		 323 aa  59.3  0.00000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0201798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1526  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  30 
 
 		 311 aa  58.9  0.00000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2081  putative cytochrome c  29.66 
 
 		 194 aa  58.9  0.00000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3049  cytochrome c, class I  42.55 
 
 		 113 aa  58.9  0.00000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000419911  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1615  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  27.72 
 
 		 313 aa  58.9  0.00000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0748863  normal  0.0271548 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3958  cytochrome c, class I  45.56 
 
 		 108 aa  58.9  0.00000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.990396  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>