93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3249 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3249  cytochrome c class I  100 
 
 		 255 aa  513  1.0000000000000001e-145  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00726195  hitchhiker  0.0000284914 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1374  cytochrome c class I  56.2 
 
 		 270 aa  273  2.0000000000000002e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.317055  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3341  cytochrome c class I  62.2 
 
 		 295 aa  269  2.9999999999999997e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10680  cytochrome c, mono- and diheme variants family  56.59 
 
 		 275 aa  263  1e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0523281  normal  0.768267 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12222  ubiquinol-cytochrome C reductase qcrC (cytochrome C subunit)  50.97 
 
 		 280 aa  260  2e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3558  cytochrome c, class I  54.75 
 
 		 273 aa  256  2e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0912153 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2693  cytochrome c class I  53.82 
 
 		 306 aa  256  3e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.714589  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3294  cytochrome c, class I  52.14 
 
 		 277 aa  254  1.0000000000000001e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.79873  normal  0.176806 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2955  cytochrome c, class I  57.02 
 
 		 278 aa  246  2e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.136352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3303  cytochrome c, class I  50.95 
 
 		 272 aa  243  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.227675 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3354  cytochrome c, class I  50.95 
 
 		 272 aa  243  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0582943  normal  0.0591201 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3292  cytochrome c, class I  50.95 
 
 		 272 aa  243  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.250177  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3526  cytochrome c class I  50.8 
 
 		 277 aa  238  6.999999999999999e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021541 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3056  cytochrome c class I  59.35 
 
 		 295 aa  231  9e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.294486  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4119  cytochrome c class I  47.53 
 
 		 271 aa  225  5.0000000000000005e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.83541 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0963  cytochrome c, class I  45.74 
 
 		 268 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0745087 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3107  cytochrome c, class I  45.38 
 
 		 305 aa  213  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.510771  normal  0.352992 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1295  cytochrome c class I  44.84 
 
 		 276 aa  209  3e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.669902 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1678  cytochrome c class I  42.06 
 
 		 289 aa  207  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.250223 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16190  cytochrome c, mono- and diheme variants family  43.15 
 
 		 263 aa  207  2e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.188569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1810  cytochrome c class I  42.97 
 
 		 294 aa  206  4e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.780394  normal  0.101949 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2676  hypothetical protein  46.22 
 
 		 269 aa  203  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.543217 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2210  cytochrome c, class I  45.49 
 
 		 262 aa  201  8e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0119453  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3062  cytochrome c class I  44.63 
 
 		 303 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0184477  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1447  cytochrome c class I  41.02 
 
 		 284 aa  191  8e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0356963  normal  0.171198 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1891  cytochrome c class I  40.23 
 
 		 259 aa  191  1e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.527374  hitchhiker  0.000337472 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3251  cytochrome c class I  42.86 
 
 		 277 aa  191  1e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0775555 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1947  cytochrome c class I  44.21 
 
 		 262 aa  189  5e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000151337 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15700  cytochrome c, mono- and diheme variants family  43.81 
 
 		 259 aa  186  2e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.871134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14180  cytochrome c, mono- and diheme variants family  38.98 
 
 		 266 aa  182  4.0000000000000006e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.616928  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12130  cytochrome c, mono- and diheme variants family  42.13 
 
 		 256 aa  179  4.999999999999999e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.298886  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2076  cytochrome c class I  48.37 
 
 		 261 aa  172  5e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1021  ubiquinol-cytochrome c reductase cytochrome c subunit  35.05 
 
 		 307 aa  170  2e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.121328  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3135  cytochrome c, class I  40.95 
 
 		 289 aa  163  2.0000000000000002e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3134  cytochrome c class I  33.9 
 
 		 311 aa  163  2.0000000000000002e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2009  cytochrome c class I  45 
 
 		 259 aa  155  4e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1827  cytochrome c class I  39.91 
 
 		 280 aa  152  4e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0624  cytochrome c, class I  28.57 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2918  cytochrome c class I  24.12 
 
 		 219 aa  52  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00059713 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3265  cytochrome c class I  24.56 
 
 		 219 aa  52  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.838246  normal  0.141063 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05464  cytochrome c  25.68 
 
 		 718 aa  51.6  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1360  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  27.03 
 
 		 308 aa  50.1  0.00004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.240618 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0957  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  27.52 
 
 		 723 aa  49.7  0.00005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.12457  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0456  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  25 
 
 		 312 aa  49.3  0.00006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.844005  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6265  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  24.15 
 
 		 289 aa  48.9  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.142904 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5932  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  24.15 
 
 		 289 aa  48.9  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.322856  normal  0.495001 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1149  Pyrrolo-quinoline quinone  37.5 
 
 		 678 aa  48.9  0.00008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.261687  normal  0.842615 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2440  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  29.79 
 
 		 288 aa  48.9  0.00008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.132686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0281  cytochrome c class I  29.77 
 
 		 217 aa  47  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.174718  normal  0.337626 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4079  putative cytochrome c, class I  31.78 
 
 		 269 aa  46.2  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2602  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  25.2 
 
 		 308 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000191523  normal  0.411563 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3147  cytochrome c, class I  28.82 
 
 		 219 aa  45.8  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1569  cytochrome c, class I  27.98 
 
 		 241 aa  46.2  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0100945  normal  0.526038 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2096  cytochrome c oxidase cbb3-type subunit III  27.34 
 
 		 287 aa  45.8  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.04303  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3819  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  26.4 
 
 		 313 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.718495 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09091  cytochrome cM  32.98 
 
 		 125 aa  45.8  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.670452 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1739  cytochrome c, class I  38.2 
 
 		 146 aa  45.8  0.0007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2773  hypothetical protein  33.33 
 
 		 151 aa  45.4  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000119865  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11331  cytochrome cM  33 
 
 		 130 aa  45.8  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.969799 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2542  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  24.34 
 
 		 294 aa  45.1  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.854548 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2987  oxidoreductase cytochrome C-type signal peptide protein  27.7 
 
 		 219 aa  45.4  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1848  cytochrome c class I  29.89 
 
 		 238 aa  44.3  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.298737  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2986  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  26.79 
 
 		 447 aa  44.7  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.47949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3607  cytochrome c family protein  27.35 
 
 		 208 aa  44.3  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0102183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0466  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  24.79 
 
 		 287 aa  44.3  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00151581  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0013  cytochrome c, class I  25.17 
 
 		 229 aa  44.3  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.741785  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0537  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  28.99 
 
 		 292 aa  44.3  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.931468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5973  cytochrome c class I  35.16 
 
 		 412 aa  43.5  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0365316 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1820  cytochrome c oxidase cbb3-type, subunit III  25.73 
 
 		 327 aa  43.5  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.700431  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1916  cytochrome c oxidase, Cbb3-type, subunit III  24.71 
 
 		 282 aa  43.5  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1948  cytochrome cM  35.16 
 
 		 137 aa  43.1  0.004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1469  cytochrome c, class I  30.89 
 
 		 226 aa  43.1  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0501042 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0089  cytochrome c class I  27.34 
 
 		 205 aa  43.5  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3138  cytochrome c, class I  30.43 
 
 		 205 aa  43.1  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0376  cytochrome c oxidase, Cbb3-type, subunit III  23.14 
 
 		 287 aa  43.1  0.004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1003  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  26.04 
 
 		 304 aa  42.7  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2778  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  25.37 
 
 		 305 aa  43.1  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.452004  normal  0.247491 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0519  cytochrome c family protein  26.5 
 
 		 208 aa  42.7  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.135917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3572  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  24.64 
 
 		 313 aa  42.7  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3786  cytochrome c class I  32.76 
 
 		 160 aa  42.7  0.006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.117464  normal  0.511619 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3953  Quinoprotein glucose dehydrogenase  34.15 
 
 		 747 aa  42.7  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3818  cytochrome c oxidase, subunit II  30.34 
 
 		 388 aa  42.7  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.198752 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4062  cytochrome c class I  32.76 
 
 		 160 aa  42.7  0.006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44360  putative cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  24.64 
 
 		 308 aa  42.7  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.922379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1358  cb-type cytochrome c oxidase subunit III  34.12 
 
 		 152 aa  42.7  0.006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.112598  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2376  hypothetical protein  23.32 
 
 		 224 aa  42.4  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0256417  normal  0.420009 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3352  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  35.16 
 
 		 707 aa  42.4  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.32899  normal  0.291074 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3776  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit III  24.64 
 
 		 308 aa  42.4  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3931  hypothetical protein  26.83 
 
 		 212 aa  42.4  0.008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.119057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2704  Quinoprotein glucose dehydrogenase  34.41 
 
 		 731 aa  42  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5018  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  26.19 
 
 		 287 aa  42  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0307  putative cytochrome c  32.95 
 
 		 410 aa  42  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0124667  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0360  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  23.14 
 
 		 287 aa  42  0.009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>