171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1455 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1455  cytochrome c class I  100 
 
 
278 aa  574  1.0000000000000001e-163  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000371587  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1833  cytochrome c subfamily protein  43.94 
 
 
288 aa  254  1.0000000000000001e-66  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.135185  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0742  cytochrome c subfamily protein  43.94 
 
 
288 aa  254  1.0000000000000001e-66  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1919  cytochrome c subfamily protein  35.55 
 
 
346 aa  216  4e-55  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1450  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome c1 subunit  34.02 
 
 
341 aa  214  1.9999999999999998e-54  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.20363  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1816  hypothetical protein  36.1 
 
 
349 aa  213  1.9999999999999998e-54  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000760007  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1919  ubiquinol cytochrome c oxidoreductase, cytochrome C1 subunit  38.34 
 
 
315 aa  206  2e-52  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000233751  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1199  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome c1 subunit  32.01 
 
 
374 aa  198  1.0000000000000001e-49  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0545  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome c1 subunit  30.69 
 
 
374 aa  195  5.000000000000001e-49  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1318  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome c1 subunit  30.69 
 
 
374 aa  195  7e-49  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1236  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome c1 subunit  37.66 
 
 
367 aa  193  3e-48  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1095  ubiquinol cytochrome c oxidoreductase, cytochrome c1 subunit  31.58 
 
 
375 aa  184  1.0000000000000001e-45  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1535  ubiquinol-cytochrome c reductase cytochrome c1 subunit  26.29 
 
 
236 aa  63.2  0.000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000513902  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2660  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome C1  20.49 
 
 
245 aa  58.9  0.00000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0667489  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3019  ubiquinol-cytochrome c reductase cytochrome c1 subunit  23.53 
 
 
232 aa  56.6  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00018062  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0610  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c1  23.21 
 
 
231 aa  55.8  0.0000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3274  cytochrome c1  20.94 
 
 
232 aa  55.5  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0283583  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4489  cytochrome c class I  32.71 
 
 
280 aa  54.3  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.519402 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3199  cytochrome c1  23.77 
 
 
231 aa  54.7  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.663491  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0603  cytochrome c1  20.63 
 
 
232 aa  53.5  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0224721  hitchhiker  0.00000571786 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0604  cytochrome c1  20.63 
 
 
232 aa  53.5  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000593  normal  0.0809473 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3426  cytochrome c1  20.63 
 
 
232 aa  53.5  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0003058  normal  0.104383 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2107  cytochrome c1  21.72 
 
 
242 aa  52.8  0.000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0560179  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3887  cytochrome c1  20.42 
 
 
232 aa  52.4  0.000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.312992  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3761  cytochrome c1  20.42 
 
 
232 aa  52.4  0.000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000196164  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0107  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome c1  20.68 
 
 
245 aa  52.4  0.000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00110393  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3704  cytochrome c1  20.42 
 
 
231 aa  52  0.000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00197574  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0564  cytochrome c1  20.42 
 
 
231 aa  52.4  0.000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000336048  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1634  cytochrome c, class I  34.55 
 
 
444 aa  52.4  0.000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4164  cytochrome c1  20.65 
 
 
233 aa  51.6  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0116839  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2731  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome c1 subunit  24.29 
 
 
233 aa  51.6  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0309003  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0297  cytochrome c1  22.22 
 
 
240 aa  51.6  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.434279  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3228  cytochrome c1  27.22 
 
 
247 aa  51.6  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2353  cytochrome c1  24.29 
 
 
233 aa  51.6  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.922589  hitchhiker  0.000000000801731 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3471  cytochrome c, class I  33.02 
 
 
199 aa  52  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3992  cytochrome c class I  31.48 
 
 
278 aa  50.8  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.08341  normal  0.223364 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0803  cytochrome c1  22.4 
 
 
233 aa  51.2  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000755074  hitchhiker  0.00778647 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0709  cytochrome c oxidase subunit II  32.08 
 
 
355 aa  51.2  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.669005  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3204  cytochrome c1  22.69 
 
 
247 aa  50.4  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.831263 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2099  cytochrome c, class I  31.53 
 
 
123 aa  50.4  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3091  cytochrome c1  24.42 
 
 
247 aa  50.1  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3534  cytochrome c1  21.99 
 
 
231 aa  49.7  0.00005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000922213  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0200  cytochrome c class I  25.49 
 
 
743 aa  49.7  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0628  cytochrome c oxidase, subunit II  35.51 
 
 
351 aa  49.7  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.197881 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0127  cytochrome c1  23.3 
 
 
257 aa  49.3  0.00007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0525293  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004507  ubiquinol cytochrome C oxidoreductase cytochrome C1 subunit  22.44 
 
 
245 aa  48.9  0.00008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000302738  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2696  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c1  23.53 
 
 
252 aa  48.9  0.00009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3673  cytochrome c1 precursor  25 
 
 
252 aa  48.9  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.276349  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3258  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c1  23.53 
 
 
252 aa  48.9  0.00009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3648  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c1  25 
 
 
252 aa  48.9  0.00009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3705  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c1  25 
 
 
252 aa  48.9  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2746  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c1  23.53 
 
 
252 aa  48.9  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1947  cytochrome c class I  26.01 
 
 
262 aa  48.1  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000151337 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1201  cytochrome c1  37.25 
 
 
689 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1807  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c1  23.53 
 
 
259 aa  48.9  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.216061  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0572  cytochrome c1  21.65 
 
 
233 aa  48.5  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00834423  normal  0.355949 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3251  cytochrome c class I  25.21 
 
 
277 aa  48.5  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0775555 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2975  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c1  22.93 
 
 
252 aa  47.8  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.674351  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0137  cytochrome c1  23.3 
 
 
257 aa  48.1  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.148946 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1447  cytochrome c class I  23.69 
 
 
284 aa  48.1  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0356963  normal  0.171198 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1831  ubiquinol-cytochrome c reductase cytochrome c1 subunit  24.62 
 
 
241 aa  47.4  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.188895 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1946  cytochrome c, class I  29.52 
 
 
277 aa  47  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.166629  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4268  cytochrome c, class I  34.29 
 
 
278 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3509  cytochrome c, class I  29.52 
 
 
278 aa  47  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4098  cytochrome c, class I  34.29 
 
 
278 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.982454  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0751  cytochrome c1  20.27 
 
 
250 aa  47.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0945236  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3425  cytochrome c class I  29.52 
 
 
278 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5485  cytochrome c class I  27.18 
 
 
561 aa  47  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.233629 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00885  ubiquinol-cytochrome c reductase  20.98 
 
 
245 aa  47  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0656  cytochrome c, class I  32.67 
 
 
283 aa  46.6  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.93712 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2210  cytochrome c, class I  26.23 
 
 
262 aa  46.6  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0119453  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2857  cytochrome c1  23.65 
 
 
247 aa  46.6  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.453799 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3819  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  30 
 
 
313 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.718495 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0249  cytochrome c family protein  30.11 
 
 
432 aa  46.2  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.767699  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0915  cytochrome C  30.11 
 
 
432 aa  46.2  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.136594  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0608  cytochrome c family protein  29.13 
 
 
432 aa  46.2  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2561  iron permease FTR1  29.75 
 
 
647 aa  46.6  0.0005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2741  cytochrome c1  24.51 
 
 
251 aa  46.6  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1402  hypothetical protein  30.77 
 
 
170 aa  46.6  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.781476  normal  0.402158 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2697  cytochrome c family protein  30.11 
 
 
432 aa  46.2  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2380  cytochrome c family protein  30.11 
 
 
432 aa  46.2  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0736  cytochrome c family protein  30.11 
 
 
432 aa  46.2  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0749  cytochrome c family protein  30.11 
 
 
432 aa  46.2  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2461  cytochrome c family protein  30.11 
 
 
432 aa  46.2  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03038  major anaerobically induced outer membrane transmembrane protein  34.09 
 
 
510 aa  46.2  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.490138  normal  0.0661846 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0811  cytochrome c1  21.79 
 
 
239 aa  46.2  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000393598  hitchhiker  0.0000113285 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3305  cytochrome c1  20.43 
 
 
244 aa  46.2  0.0006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2424  cytochrome c class I  30.39 
 
 
132 aa  46.2  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.385069 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3699  cytochrome c1  21.08 
 
 
244 aa  46.2  0.0007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.201159  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2922  cytochrome c, class I  28.85 
 
 
133 aa  45.8  0.0008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2297  hypothetical protein  22.8 
 
 
302 aa  45.8  0.0008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0292911 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1363  cytochrome c1  23.65 
 
 
249 aa  45.8  0.0008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0920969  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2872  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome c1  20.98 
 
 
243 aa  45.8  0.0009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0293144  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3352  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  28.85 
 
 
707 aa  45.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.32899  normal  0.291074 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6817  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  31 
 
 
474 aa  45.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166846  normal  0.164997 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3107  cytochrome c, class I  26.5 
 
 
305 aa  45.4  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.510771  normal  0.352992 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1303  cytochrome c1  32.08 
 
 
689 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3135  cytochrome c, class I  22.69 
 
 
289 aa  45.4  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3572  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  28.57 
 
 
313 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1295  cytochrome c class I  22.96 
 
 
276 aa  45.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.669902 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>