69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12222 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_12222  ubiquinol-cytochrome C reductase qcrC (cytochrome C subunit)  100 
 
 		 280 aa  567  1e-161  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2955  cytochrome c, class I  78.05 
 
 		 278 aa  372  1e-102  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.136352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3558  cytochrome c, class I  73.7 
 
 		 273 aa  374  1e-102  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0912153 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3303  cytochrome c, class I  74.22 
 
 		 272 aa  359  3e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.227675 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3354  cytochrome c, class I  74.22 
 
 		 272 aa  359  3e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0582943  normal  0.0591201 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3292  cytochrome c, class I  74.22 
 
 		 272 aa  359  3e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.250177  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2693  cytochrome c class I  58.72 
 
 		 306 aa  319  3.9999999999999996e-86  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.714589  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3056  cytochrome c class I  62.69 
 
 		 295 aa  295  6e-79  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.294486  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1374  cytochrome c class I  58.02 
 
 		 270 aa  292  4e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.317055  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10680  cytochrome c, mono- and diheme variants family  58.71 
 
 		 275 aa  286  2e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0523281  normal  0.768267 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3341  cytochrome c class I  50.8 
 
 		 295 aa  258  7e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3294  cytochrome c, class I  51.14 
 
 		 277 aa  251  1e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.79873  normal  0.176806 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3526  cytochrome c class I  50.59 
 
 		 277 aa  235  7e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021541 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3249  cytochrome c class I  53.68 
 
 		 255 aa  233  3e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00726195  hitchhiker  0.0000284914 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4119  cytochrome c class I  48.39 
 
 		 271 aa  231  8.000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.83541 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16190  cytochrome c, mono- and diheme variants family  46.03 
 
 		 263 aa  218  6e-56  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.188569  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1891  cytochrome c class I  47.1 
 
 		 259 aa  216  5e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.527374  hitchhiker  0.000337472 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0963  cytochrome c, class I  46.01 
 
 		 268 aa  216  5e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0745087 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3107  cytochrome c, class I  45.82 
 
 		 305 aa  212  3.9999999999999995e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.510771  normal  0.352992 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1810  cytochrome c class I  44.62 
 
 		 294 aa  202  4e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.780394  normal  0.101949 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1295  cytochrome c class I  43.56 
 
 		 276 aa  202  5e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.669902 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1678  cytochrome c class I  45.25 
 
 		 289 aa  201  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.250223 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15700  cytochrome c, mono- and diheme variants family  46.36 
 
 		 259 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.871134  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12130  cytochrome c, mono- and diheme variants family  47.03 
 
 		 256 aa  198  7e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.298886  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14180  cytochrome c, mono- and diheme variants family  44.53 
 
 		 266 aa  195  8.000000000000001e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.616928  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2676  hypothetical protein  48.85 
 
 		 269 aa  195  8.000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.543217 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3251  cytochrome c class I  44.49 
 
 		 277 aa  194  9e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0775555 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1447  cytochrome c class I  43.89 
 
 		 284 aa  191  1e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0356963  normal  0.171198 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2210  cytochrome c, class I  44.04 
 
 		 262 aa  181  1e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0119453  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3135  cytochrome c, class I  43.33 
 
 		 289 aa  179  2.9999999999999997e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2076  cytochrome c class I  45.57 
 
 		 261 aa  175  9e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3062  cytochrome c class I  41.11 
 
 		 303 aa  172  7.999999999999999e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0184477  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1947  cytochrome c class I  43.06 
 
 		 262 aa  171  1e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000151337 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2009  cytochrome c class I  41.74 
 
 		 259 aa  163  2.0000000000000002e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1021  ubiquinol-cytochrome c reductase cytochrome c subunit  35.14 
 
 		 307 aa  160  3e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.121328  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3134  cytochrome c class I  32.67 
 
 		 311 aa  145  8.000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1827  cytochrome c class I  36.65 
 
 		 280 aa  135  6.0000000000000005e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05464  cytochrome c  28.36 
 
 		 718 aa  58.5  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0456  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  26.77 
 
 		 312 aa  51.2  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.844005  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1360  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  27.18 
 
 		 308 aa  50.8  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.240618 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1916  cytochrome c oxidase, Cbb3-type, subunit III  27.32 
 
 		 282 aa  48.9  0.00009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2545  putative cytochrome c  26.89 
 
 		 350 aa  47.8  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8114  cytochrome c class I  33 
 
 		 419 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.719165  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0377  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  27.62 
 
 		 292 aa  46.6  0.0004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0590381  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2602  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  29.03 
 
 		 308 aa  47  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000191523  normal  0.411563 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0017  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  36.26 
 
 		 293 aa  45.8  0.0008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1673  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  27.84 
 
 		 307 aa  45.8  0.0008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.528501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2794  cytochrome-c oxidase fixP chain  28.39 
 
 		 290 aa  45.8  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.40028  normal  0.764362 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5923  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  25.25 
 
 		 293 aa  45.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.123388  normal  0.389873 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2780  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 164 aa  44.3  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0624  cytochrome c, class I  26.49 
 
 		 211 aa  44.3  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0014  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  25.81 
 
 		 293 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1149  Pyrrolo-quinoline quinone  33.73 
 
 		 678 aa  44.7  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.261687  normal  0.842615 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0537  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  25.94 
 
 		 292 aa  44.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.931468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1900  quinoprotein glucose dehydrogenase  32.86 
 
 		 720 aa  44.3  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09091  cytochrome cM  33.33 
 
 		 125 aa  43.9  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.670452 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2392  cytochrome c, class I  28.9 
 
 		 214 aa  43.9  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3841  cytochrome c variant  29.29 
 
 		 230 aa  43.9  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0733  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  37.36 
 
 		 293 aa  43.9  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.647452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0084  Cbb3-type cytochrome c oxidase subunit III  23.67 
 
 		 307 aa  43.9  0.003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000832498  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3273  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  25.64 
 
 		 293 aa  43.5  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.288519  normal  0.62826 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0161  cytochrome c class I  24.26 
 
 		 254 aa  43.5  0.004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000207523  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2213  cytochrome c, mono- and diheme variant  25.87 
 
 		 435 aa  42.7  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44360  putative cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  25.39 
 
 		 308 aa  42.7  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.922379  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19980  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  25.87 
 
 		 306 aa  42.7  0.007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.181448  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5932  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  37.11 
 
 		 289 aa  42.7  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.322856  normal  0.495001 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6265  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  37.11 
 
 		 289 aa  42.7  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.142904 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0013  cytochrome c, class I  28.57 
 
 		 229 aa  42.4  0.009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.741785  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3776  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit III  27.56 
 
 		 308 aa  42  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>