133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2009 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_2009  cytochrome c class I  100 
 
 		 259 aa  518  1e-146  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1447  cytochrome c class I  69.5 
 
 		 284 aa  370  1e-101  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0356963  normal  0.171198 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15700  cytochrome c, mono- and diheme variants family  71.81 
 
 		 259 aa  363  2e-99  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.871134  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1891  cytochrome c class I  69.11 
 
 		 259 aa  361  7.0000000000000005e-99  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.527374  hitchhiker  0.000337472 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2076  cytochrome c class I  72.41 
 
 		 261 aa  325  3e-88  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14180  cytochrome c, mono- and diheme variants family  58.27 
 
 		 266 aa  293  1e-78  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.616928  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2210  cytochrome c, class I  60.08 
 
 		 262 aa  290  2e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0119453  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16190  cytochrome c, mono- and diheme variants family  56.65 
 
 		 263 aa  285  5.999999999999999e-76  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.188569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1947  cytochrome c class I  60.46 
 
 		 262 aa  278  4e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000151337 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1295  cytochrome c class I  54.55 
 
 		 276 aa  268  5.9999999999999995e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.669902 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12130  cytochrome c, mono- and diheme variants family  60.83 
 
 		 256 aa  266  2e-70  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.298886  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2676  hypothetical protein  52.45 
 
 		 269 aa  250  2e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.543217 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1678  cytochrome c class I  49.81 
 
 		 289 aa  241  7.999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.250223 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3251  cytochrome c class I  55.47 
 
 		 277 aa  241  9e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0775555 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0963  cytochrome c, class I  52.16 
 
 		 268 aa  239  2e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0745087 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3062  cytochrome c class I  48.98 
 
 		 303 aa  215  5e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0184477  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1374  cytochrome c class I  46.58 
 
 		 270 aa  207  1e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.317055  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3341  cytochrome c class I  48.19 
 
 		 295 aa  205  7e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3292  cytochrome c, class I  48.81 
 
 		 272 aa  204  1e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.250177  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3354  cytochrome c, class I  48.81 
 
 		 272 aa  204  1e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0582943  normal  0.0591201 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3303  cytochrome c, class I  48.81 
 
 		 272 aa  204  1e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.227675 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2955  cytochrome c, class I  47.97 
 
 		 278 aa  204  1e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.136352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3135  cytochrome c, class I  47.76 
 
 		 289 aa  203  2e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3526  cytochrome c class I  46.75 
 
 		 277 aa  202  3e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021541 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3294  cytochrome c, class I  45.31 
 
 		 277 aa  202  5e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.79873  normal  0.176806 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3558  cytochrome c, class I  46.43 
 
 		 273 aa  198  7.999999999999999e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0912153 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1810  cytochrome c class I  45.08 
 
 		 294 aa  198  9e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.780394  normal  0.101949 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10680  cytochrome c, mono- and diheme variants family  45.21 
 
 		 275 aa  197  1.0000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0523281  normal  0.768267 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3107  cytochrome c, class I  44.67 
 
 		 305 aa  197  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.510771  normal  0.352992 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1021  ubiquinol-cytochrome c reductase cytochrome c subunit  39.74 
 
 		 307 aa  196  3e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.121328  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12222  ubiquinol-cytochrome C reductase qcrC (cytochrome C subunit)  44.84 
 
 		 280 aa  196  3e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4119  cytochrome c class I  42.23 
 
 		 271 aa  186  4e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.83541 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2693  cytochrome c class I  40.86 
 
 		 306 aa  180  2e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.714589  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3134  cytochrome c class I  38.24 
 
 		 311 aa  176  3e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3056  cytochrome c class I  45 
 
 		 295 aa  164  9e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.294486  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3249  cytochrome c class I  42.61 
 
 		 255 aa  161  8.000000000000001e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00726195  hitchhiker  0.0000284914 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1827  cytochrome c class I  40.09 
 
 		 280 aa  152  7e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2545  putative cytochrome c  32.68 
 
 		 350 aa  56.6  0.0000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1360  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  28.64 
 
 		 308 aa  56.2  0.0000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.240618 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1988  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  28.64 
 
 		 323 aa  56.2  0.0000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0201798  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4253  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  28.57 
 
 		 313 aa  55.8  0.0000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.49464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2038  cytochrome c oxidase cbb3-type, subunit III  28.02 
 
 		 304 aa  55.5  0.0000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0645844  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4258  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  28.57 
 
 		 325 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.816603 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1820  cytochrome c oxidase cbb3-type, subunit III  30.34 
 
 		 327 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.700431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0456  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  28.65 
 
 		 312 aa  54.3  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.844005  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1108  hypothetical protein  29.56 
 
 		 248 aa  54.7  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3823  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  30.34 
 
 		 325 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.85561  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1279  cytochrome C oxidase subunit III  29.05 
 
 		 326 aa  53.5  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.55862 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2041  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit III  28.57 
 
 		 304 aa  53.9  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.112855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1615  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  27.89 
 
 		 313 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0748863  normal  0.0271548 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1200  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  29.05 
 
 		 307 aa  53.5  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.944048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1848  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  27.78 
 
 		 318 aa  52.8  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0149886  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1107  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  29.05 
 
 		 307 aa  53.1  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.1867  normal  0.890058 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2001  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  28.19 
 
 		 325 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.659912  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1610  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  27.89 
 
 		 325 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00269268  hitchhiker  0.0066634 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2217  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  27.66 
 
 		 318 aa  52.4  0.000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.04222  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3819  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  28.28 
 
 		 313 aa  52.4  0.000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.718495 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1587  cytochrome c, class I  26.14 
 
 		 220 aa  52  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0500716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2009  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  29.7 
 
 		 322 aa  51.6  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0902386  hitchhiker  0.0000000272898 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1966  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  29.7 
 
 		 322 aa  51.6  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00926304  hitchhiker  0.00889683 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2110  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  29.7 
 
 		 322 aa  51.6  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0408813  normal  0.504179 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3572  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  28.97 
 
 		 313 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3576  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  28.19 
 
 		 326 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2422  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  27.89 
 
 		 325 aa  51.6  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000195931  hitchhiker  0.0000802746 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2361  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  29.63 
 
 		 322 aa  51.2  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4490  hypothetical protein  28.14 
 
 		 322 aa  50.8  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2204  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  28.14 
 
 		 322 aa  50.8  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000397613  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2602  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  28.19 
 
 		 308 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000191523  normal  0.411563 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3416  cytochrome c oxidase cbb3-type, subunit III  28.47 
 
 		 325 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0306402 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2167  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  28.14 
 
 		 322 aa  50.4  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0262117  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2217  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  28.14 
 
 		 322 aa  50.4  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.106993  normal  0.268308 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2217  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  28.14 
 
 		 322 aa  50.4  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000127298  normal  0.441817 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0775  cytochrome c oxidase cbb3-type, subunit III  31.91 
 
 		 374 aa  49.7  0.00004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0709529  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19980  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  28.08 
 
 		 306 aa  50.1  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.181448  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2214  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  26.52 
 
 		 322 aa  49.3  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0781  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  30.07 
 
 		 382 aa  49.3  0.00006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.279912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1794  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  29.71 
 
 		 325 aa  48.5  0.00009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.448855  normal  0.0580758 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1824  cytochrome c oxidase cbb3-type, subunit III  27.03 
 
 		 317 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2419  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  30.3 
 
 		 298 aa  48.1  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.203271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2377  cytochrome c, class I  26.9 
 
 		 224 aa  48.5  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000176036  hitchhiker  0.0000215746 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2013  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  27.54 
 
 		 324 aa  48.5  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00187341  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0683  cytochrome c class I  34 
 
 		 381 aa  47.4  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1956  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  28.15 
 
 		 322 aa  48.1  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1798  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  27.84 
 
 		 292 aa  47  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2365  cytochrome c class I  30.23 
 
 		 107 aa  46.2  0.0005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.956584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2542  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  30.71 
 
 		 294 aa  46.2  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.854548 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2335  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  27.72 
 
 		 426 aa  46.2  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000000130755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1747  cytochrome c, class I  29.48 
 
 		 372 aa  45.8  0.0007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0188659 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2776  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  28.21 
 
 		 310 aa  45.4  0.0008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000169467 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0376  cytochrome c oxidase, Cbb3-type, subunit III  29.84 
 
 		 287 aa  45.4  0.0009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5923  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  26.89 
 
 		 293 aa  45.4  0.0009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.123388  normal  0.389873 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1470  cytochrome c, class I  36.79 
 
 		 428 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.212518  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5233  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  31.06 
 
 		 293 aa  44.7  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.558245  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0184  cytochrome c, class I  29.31 
 
 		 220 aa  45.1  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6358  cytochrome c, class I  36.79 
 
 		 428 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0883371  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0327  cytochrome c class I  25.93 
 
 		 269 aa  45.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2114  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  31.06 
 
 		 293 aa  44.7  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0360  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  29.03 
 
 		 287 aa  44.3  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0634  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  33.33 
 
 		 304 aa  44.3  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44400  putative cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  26.17 
 
 		 318 aa  44.3  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>