71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2955 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_2955  cytochrome c, class I  100 
 
 
278 aa  563  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.136352  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3558  cytochrome c, class I  92.55 
 
 
273 aa  442  1e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0912153 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3303  cytochrome c, class I  83.92 
 
 
272 aa  410  1e-113  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.227675 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3292  cytochrome c, class I  83.92 
 
 
272 aa  410  1e-113  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.250177  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3354  cytochrome c, class I  83.92 
 
 
272 aa  410  1e-113  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0582943  normal  0.0591201 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12222  ubiquinol-cytochrome C reductase qcrC (cytochrome C subunit)  76.47 
 
 
280 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1374  cytochrome c class I  61.89 
 
 
270 aa  320  9.999999999999999e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.317055  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2693  cytochrome c class I  58.55 
 
 
306 aa  318  5e-86  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.714589  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10680  cytochrome c, mono- and diheme variants family  59.71 
 
 
275 aa  305  4.0000000000000004e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0523281  normal  0.768267 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3056  cytochrome c class I  64.81 
 
 
295 aa  292  4e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.294486  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3341  cytochrome c class I  53.6 
 
 
295 aa  278  6e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3294  cytochrome c, class I  49.47 
 
 
277 aa  256  3e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.79873  normal  0.176806 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3249  cytochrome c class I  57.51 
 
 
255 aa  246  2e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00726195  hitchhiker  0.0000284914 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3526  cytochrome c class I  51.37 
 
 
277 aa  246  3e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0021541 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1295  cytochrome c class I  49.06 
 
 
276 aa  235  5.0000000000000005e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.669902 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4119  cytochrome c class I  47.81 
 
 
271 aa  233  3e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.83541 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0963  cytochrome c, class I  46.21 
 
 
268 aa  230  2e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0745087 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16190  cytochrome c, mono- and diheme variants family  45.1 
 
 
263 aa  229  4e-59  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.188569  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2676  hypothetical protein  53.46 
 
 
269 aa  228  6e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.543217 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12130  cytochrome c, mono- and diheme variants family  50.23 
 
 
256 aa  229  6e-59  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.298886  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15700  cytochrome c, mono- and diheme variants family  48.66 
 
 
259 aa  228  7e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.871134  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1891  cytochrome c class I  46.84 
 
 
259 aa  228  1e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.527374  hitchhiker  0.000337472 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14180  cytochrome c, mono- and diheme variants family  46.15 
 
 
266 aa  221  9.999999999999999e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.616928  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1447  cytochrome c class I  45.8 
 
 
284 aa  219  3.9999999999999997e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0356963  normal  0.171198 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3251  cytochrome c class I  44.9 
 
 
277 aa  216  4e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0775555 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1678  cytochrome c class I  45.22 
 
 
289 aa  214  9.999999999999999e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.250223 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3107  cytochrome c, class I  45.24 
 
 
305 aa  212  7e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.510771  normal  0.352992 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1810  cytochrome c class I  42.46 
 
 
294 aa  209  3e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.780394  normal  0.101949 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2210  cytochrome c, class I  47.91 
 
 
262 aa  209  4e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0119453  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3062  cytochrome c class I  47.79 
 
 
303 aa  209  6e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0184477  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2009  cytochrome c class I  47.93 
 
 
259 aa  198  7e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1947  cytochrome c class I  46.05 
 
 
262 aa  198  7e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000151337 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2076  cytochrome c class I  51.14 
 
 
261 aa  194  2e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3135  cytochrome c, class I  45.5 
 
 
289 aa  186  3e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1021  ubiquinol-cytochrome c reductase cytochrome c subunit  35.14 
 
 
307 aa  176  4e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.121328  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3134  cytochrome c class I  35.33 
 
 
311 aa  169  6e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1827  cytochrome c class I  39.82 
 
 
280 aa  154  1e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2545  putative cytochrome c  28 
 
 
350 aa  58.2  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1916  cytochrome c oxidase, Cbb3-type, subunit III  27.72 
 
 
282 aa  55.8  0.0000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1360  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  29.56 
 
 
308 aa  53.1  0.000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.240618 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0456  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  28.08 
 
 
312 aa  53.1  0.000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.844005  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05464  cytochrome c  28.35 
 
 
718 aa  51.2  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09091  cytochrome cM  34.62 
 
 
125 aa  48.1  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.670452 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2780  cytochrome c class I  33.82 
 
 
164 aa  46.2  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0161  cytochrome c class I  24.79 
 
 
254 aa  45.8  0.0009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000207523  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1149  Pyrrolo-quinoline quinone  38.96 
 
 
678 aa  45.1  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.261687  normal  0.842615 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5136  Pyrrolo-quinoline quinone  33.98 
 
 
709 aa  45.4  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.388908  normal  0.506379 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2214  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  27.72 
 
 
689 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.143053  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1569  cytochrome c, class I  32.87 
 
 
141 aa  44.7  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.832933  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1200  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  25.79 
 
 
307 aa  43.9  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.944048  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0377  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  25.26 
 
 
292 aa  43.9  0.003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0590381  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1107  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  26.06 
 
 
307 aa  43.9  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.1867  normal  0.890058 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0624  cytochrome c, class I  23.2 
 
 
211 aa  43.9  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2744  cytochrome c, class I  34.09 
 
 
121 aa  43.5  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.865497  normal  0.40097 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0656  cytochrome c, class I  36.36 
 
 
283 aa  43.5  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.93712 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0905  cytochrome c oxidase, Cbb3-type, subunit III  23.94 
 
 
287 aa  43.5  0.004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.269734  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3841  cytochrome c variant  29.29 
 
 
230 aa  43.5  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0084  Cbb3-type cytochrome c oxidase subunit III  22.92 
 
 
307 aa  43.1  0.005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000832498  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3891  cytochrome c class I  32.14 
 
 
113 aa  43.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0499798 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1529  cytochrome c6  32.53 
 
 
111 aa  43.1  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.389738  normal  0.935702 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3572  hypothetical protein  29.03 
 
 
272 aa  43.1  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3841  cytochrome c class I  32.14 
 
 
113 aa  43.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0824  cytochrome c class I  24.69 
 
 
296 aa  43.1  0.005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000780419  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1279  cytochrome C oxidase subunit III  25.82 
 
 
326 aa  42.7  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.55862 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1900  quinoprotein glucose dehydrogenase  30 
 
 
720 aa  42.7  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0205  cytochrome c class I  29.52 
 
 
647 aa  42.4  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.844315 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1968  cytochrome c class I  26.11 
 
 
238 aa  42.4  0.009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000548419  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2392  cytochrome c, class I  27.27 
 
 
214 aa  42.4  0.009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4431  hypothetical protein  32.58 
 
 
195 aa  42.4  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.074977  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3931  hypothetical protein  28.05 
 
 
212 aa  42.4  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.119057  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42120  hypothetical protein  27.17 
 
 
273 aa  42  0.01  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>