72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4119 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_4119  cytochrome c class I  100 
 
 		 271 aa  549  1e-155  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.83541 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3294  cytochrome c, class I  59.25 
 
 		 277 aa  303  2.0000000000000002e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.79873  normal  0.176806 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3526  cytochrome c class I  60.31 
 
 		 277 aa  288  8e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021541 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1374  cytochrome c class I  52.03 
 
 		 270 aa  254  9e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.317055  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3341  cytochrome c class I  49.61 
 
 		 295 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12222  ubiquinol-cytochrome C reductase qcrC (cytochrome C subunit)  48.39 
 
 		 280 aa  230  2e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10680  cytochrome c, mono- and diheme variants family  47.21 
 
 		 275 aa  230  2e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0523281  normal  0.768267 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1295  cytochrome c class I  48.86 
 
 		 276 aa  224  1e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.669902 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2676  hypothetical protein  52.73 
 
 		 269 aa  220  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.543217 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3558  cytochrome c, class I  47.01 
 
 		 273 aa  215  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0912153 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16190  cytochrome c, mono- and diheme variants family  42.37 
 
 		 263 aa  212  3.9999999999999995e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.188569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2955  cytochrome c, class I  46.96 
 
 		 278 aa  209  3e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.136352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3292  cytochrome c, class I  46.69 
 
 		 272 aa  208  7e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.250177  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3354  cytochrome c, class I  46.69 
 
 		 272 aa  208  7e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0582943  normal  0.0591201 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3303  cytochrome c, class I  46.69 
 
 		 272 aa  208  7e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.227675 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0963  cytochrome c, class I  44.28 
 
 		 268 aa  208  8e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0745087 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3056  cytochrome c class I  45.11 
 
 		 295 aa  207  1e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.294486  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2693  cytochrome c class I  42.91 
 
 		 306 aa  205  5e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.714589  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14180  cytochrome c, mono- and diheme variants family  45.38 
 
 		 266 aa  202  5e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.616928  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1447  cytochrome c class I  43.51 
 
 		 284 aa  201  9.999999999999999e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0356963  normal  0.171198 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12130  cytochrome c, mono- and diheme variants family  47.25 
 
 		 256 aa  201  1.9999999999999998e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.298886  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3249  cytochrome c class I  51.61 
 
 		 255 aa  199  3e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00726195  hitchhiker  0.0000284914 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1891  cytochrome c class I  43.85 
 
 		 259 aa  199  5e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.527374  hitchhiker  0.000337472 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15700  cytochrome c, mono- and diheme variants family  43.89 
 
 		 259 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.871134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1678  cytochrome c class I  41.76 
 
 		 289 aa  196  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.250223 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3251  cytochrome c class I  46.43 
 
 		 277 aa  196  4.0000000000000005e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0775555 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1810  cytochrome c class I  43.2 
 
 		 294 aa  195  5.000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.780394  normal  0.101949 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3062  cytochrome c class I  46.96 
 
 		 303 aa  195  8.000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0184477  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3107  cytochrome c, class I  43.14 
 
 		 305 aa  192  4e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.510771  normal  0.352992 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2210  cytochrome c, class I  44.59 
 
 		 262 aa  188  5.999999999999999e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0119453  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3135  cytochrome c, class I  44.94 
 
 		 289 aa  182  5.0000000000000004e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1947  cytochrome c class I  42.66 
 
 		 262 aa  177  2e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000151337 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2009  cytochrome c class I  44.24 
 
 		 259 aa  169  5e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2076  cytochrome c class I  45.62 
 
 		 261 aa  167  1e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1021  ubiquinol-cytochrome c reductase cytochrome c subunit  33.11 
 
 		 307 aa  158  9e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.121328  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3134  cytochrome c class I  33.44 
 
 		 311 aa  152  4e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1827  cytochrome c class I  37.45 
 
 		 280 aa  152  5e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0456  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  25.93 
 
 		 312 aa  60.8  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.844005  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1360  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  26.19 
 
 		 308 aa  55.5  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.240618 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2038  cytochrome c oxidase cbb3-type, subunit III  28.5 
 
 		 304 aa  52  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0645844  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1968  cytochrome c class I  30.54 
 
 		 238 aa  49.3  0.00006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000548419  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0178  cytochrome c oxidase, subunit II  25.89 
 
 		 513 aa  46.6  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2545  putative cytochrome c  26.07 
 
 		 350 aa  45.8  0.0007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1916  cytochrome c oxidase, Cbb3-type, subunit III  26.94 
 
 		 282 aa  45.8  0.0007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3999  cytochrome c oxidase subunit II  25 
 
 		 524 aa  44.3  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2041  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit III  27.86 
 
 		 304 aa  44.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.112855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2794  cytochrome-c oxidase fixP chain  29.71 
 
 		 290 aa  44.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.40028  normal  0.764362 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1455  cytochrome c class I  24.05 
 
 		 278 aa  43.9  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000371587  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09091  cytochrome cM  31.58 
 
 		 125 aa  43.9  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.670452 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0557  cytochrome c, class I  20.36 
 
 		 683 aa  43.9  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1814  hypothetical protein  24.6 
 
 		 151 aa  43.9  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0377  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  25.64 
 
 		 292 aa  43.9  0.003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0590381  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8114  cytochrome c class I  34.92 
 
 		 419 aa  43.9  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.719165  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2776  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  26.94 
 
 		 310 aa  43.5  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000169467 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0249  cytochrome c family protein  28.33 
 
 		 432 aa  43.5  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.767699  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0915  cytochrome C  28.33 
 
 		 432 aa  43.5  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.136594  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2542  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  26.46 
 
 		 294 aa  43.5  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.854548 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0736  cytochrome c family protein  28.33 
 
 		 432 aa  43.5  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2697  cytochrome c family protein  28.33 
 
 		 432 aa  43.5  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2380  cytochrome c family protein  28.33 
 
 		 432 aa  43.5  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0749  cytochrome c family protein  28.33 
 
 		 432 aa  43.5  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2461  cytochrome c family protein  28.33 
 
 		 432 aa  43.5  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4453  cytochrome c class I  26.32 
 
 		 226 aa  43.1  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12029  normal  0.150095 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0084  glutamate racemase 2  36.14 
 
 		 100 aa  43.1  0.005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.0000295238  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0527  cytochrome c family protein  32.58 
 
 		 352 aa  42.7  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000661478  normal  0.247272 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1948  cytochrome cM  27.16 
 
 		 137 aa  42.7  0.006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2392  cytochrome c, class I  28.42 
 
 		 214 aa  42.4  0.007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1422  hypothetical protein  25.83 
 
 		 177 aa  42.7  0.007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000667886  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1108  hypothetical protein  29.17 
 
 		 248 aa  42.7  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0634  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  29.27 
 
 		 304 aa  42.4  0.008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0574  cytochrome C oxidase mono-heme subunit/FixO  28.72 
 
 		 615 aa  42  0.01  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.76534 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0726  cytochrome c oxidase, Cbb3-type, subunit III  29.63 
 
 		 287 aa  42  0.01  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>