55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1948 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_1948  cytochrome cM  100 
 
 		 137 aa  277  3e-74  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0717  cytochrome cM  74.45 
 
 		 129 aa  182  1.0000000000000001e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09091  cytochrome cM  58.41 
 
 		 125 aa  152  1e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.670452 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11331  cytochrome cM  52.07 
 
 		 130 aa  147  4e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.969799 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0695  cytochrome c  48.15 
 
 		 129 aa  130  5e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15291  cytochrome cM  48.15 
 
 		 129 aa  130  5e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.427205  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2140  cytochrome c class I  47.15 
 
 		 124 aa  115  3e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.986487  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1068  cytochrome cM  36.51 
 
 		 128 aa  108  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1478  cytochrome CytM  47.66 
 
 		 145 aa  108  4.0000000000000004e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.611234 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11621  hypothetical protein  42.42 
 
 		 100 aa  107  6e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11631  cytochrome cM  42.42 
 
 		 100 aa  105  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.362816  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4020  cytochrome c, class I  54.12 
 
 		 124 aa  102  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.442148  normal  0.970341 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2103  cytochrome c class I  45.22 
 
 		 124 aa  100  7e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2147  cytochrome c class I  45.22 
 
 		 124 aa  100  7e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.620434 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3942  cytochrome c class I  51.76 
 
 		 109 aa  98.6  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.914915 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3662  cytochrome c class I  49.41 
 
 		 124 aa  91.3  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2140  cytochrome c, class I  48.24 
 
 		 87 aa  89.7  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0189398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16190  cytochrome c, mono- and diheme variants family  37.93 
 
 		 263 aa  52  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.188569  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1374  cytochrome c class I  32.5 
 
 		 270 aa  48.9  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.317055  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12130  cytochrome c, mono- and diheme variants family  35.05 
 
 		 256 aa  48.1  0.00004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.298886  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3135  cytochrome c, class I  30.23 
 
 		 289 aa  47  0.00008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0317  cytochrome c, class I  41.51 
 
 		 285 aa  46.6  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00320646 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3354  cytochrome c, class I  32.91 
 
 		 272 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0582943  normal  0.0591201 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3292  cytochrome c, class I  32.91 
 
 		 272 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.250177  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7193  cytochrome c class I  35.06 
 
 		 409 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.99524  normal  0.500209 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3303  cytochrome c, class I  32.91 
 
 		 272 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.227675 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0843  TPR repeat-containing protein  36.99 
 
 		 330 aa  45.1  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0340  cytochrome d1 heme region  35.21 
 
 		 557 aa  44.7  0.0004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000596399  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14180  cytochrome c, mono- and diheme variants family  32.53 
 
 		 266 aa  44.3  0.0005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.616928  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0990  cytochrome c, class I  32.5 
 
 		 159 aa  43.9  0.0008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0692  cytochrome c class I  38.71 
 
 		 153 aa  43.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.189823  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3249  cytochrome c class I  35.16 
 
 		 255 aa  43.5  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00726195  hitchhiker  0.0000284914 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0435  hypothetical protein  30.61 
 
 		 314 aa  43.5  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0471891 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1903  hypothetical protein  34.58 
 
 		 110 aa  43.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.172183  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0307  putative cytochrome c  33.78 
 
 		 410 aa  43.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0124667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4119  cytochrome c class I  27.16 
 
 		 271 aa  42.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.83541 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1358  cb-type cytochrome c oxidase subunit III  27.96 
 
 		 152 aa  42.7  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.112598  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0018  cytochrome c, class I  38.33 
 
 		 138 aa  42.7  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3558  cytochrome c, class I  32.91 
 
 		 273 aa  42.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0912153 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1678  cytochrome c class I  38.16 
 
 		 289 aa  42.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.250223 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1301  cytochrome c class I  30.16 
 
 		 121 aa  42.7  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  hitchhiker  0.00128002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10680  cytochrome c, mono- and diheme variants family  29.55 
 
 		 275 aa  42.7  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0523281  normal  0.768267 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0942  cytochrome c class I  36.23 
 
 		 329 aa  42  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.240089 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0462  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  34.21 
 
 		 294 aa  42  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.528353  normal  0.120204 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4492  cytochrome c, class I  33.73 
 
 		 127 aa  41.6  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.540606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2955  cytochrome c, class I  31.65 
 
 		 278 aa  41.6  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.136352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0529  cytochrome c class I  38.1 
 
 		 400 aa  41.2  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0963  cytochrome c, class I  29.13 
 
 		 268 aa  40.8  0.006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0745087 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2655  cytochrome c class I  32.35 
 
 		 144 aa  40.8  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2002  electron transport protein SCO1/SenC  29.35 
 
 		 363 aa  40.8  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0656  cytochrome c, class I  34.15 
 
 		 283 aa  40.8  0.007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.93712 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6211  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  35.56 
 
 		 448 aa  40.8  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.783844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0328  cytochrome c, class I  32.56 
 
 		 262 aa  40.4  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000605449  hitchhiker  0.0000000937241 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0902  heme-binding protein  34.25 
 
 		 1139 aa  40.4  0.008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1019  hypothetical protein  34.88 
 
 		 296 aa  40  0.01  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.166316 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>