40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0692 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_0692  cytochrome c class I  100 
 
 
153 aa  322  1e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.189823  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0446  cytochrome c class I  46.15 
 
 
169 aa  116  9e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000163065  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2011  hypothetical protein  31.08 
 
 
152 aa  89.4  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1274  cytochrome c class I  28.66 
 
 
166 aa  78.2  0.00000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1019  hypothetical protein  32.97 
 
 
296 aa  62.4  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.166316 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0944  mulitcopper oxidase domain-containing protein  32.58 
 
 
487 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0202  cytochrome c class I  32.58 
 
 
264 aa  60.1  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0477  mulitcopper oxidase domain-containing protein  32.26 
 
 
487 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3477  cytochrome c class I  36.05 
 
 
425 aa  58.9  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.333881  normal  0.501976 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0798  mulitcopper oxidase domain-containing protein  32.26 
 
 
535 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1613  multicopper oxidase domain-containing protein  32.26 
 
 
535 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2061  multicopper oxidase domain-containing protein  32.26 
 
 
535 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.429703  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0659  mulitcopper oxidase domain-containing protein  32.26 
 
 
535 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.870882  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0548  mulitcopper oxidase domain-containing protein  32.26 
 
 
487 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.181487  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1966  multicopper oxidase domain-containing protein  32.26 
 
 
535 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.328521  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0328  cytochrome c, class I  31.33 
 
 
262 aa  57.4  0.00000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000605449  hitchhiker  0.0000000937241 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0773  cytochrome c, class I  35.29 
 
 
326 aa  56.2  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3450  cytochrome c, class I  36.47 
 
 
326 aa  55.5  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.60831  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0010  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  32.26 
 
 
863 aa  55.1  0.0000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0271061  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1770  nitrous-oxide reductase NosZ  29.35 
 
 
864 aa  53.9  0.0000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1298  nitrous-oxide reductase  26.73 
 
 
865 aa  53.9  0.0000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.0000502464  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1729  methyl-accepting chemotaxis protein  31.18 
 
 
862 aa  52  0.000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.371209  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2666  electron transport protein SCO1/SenC  30.43 
 
 
327 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.239586  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0440  nitrous-oxide reductase  29.17 
 
 
864 aa  50.4  0.000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.136119  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3183  electron transport protein SCO1/SenC  29.35 
 
 
327 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.106344  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1634  cytochrome c, class I  43.4 
 
 
444 aa  50.4  0.000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2533  electron transport protein SCO1/SenC  29.35 
 
 
327 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2002  electron transport protein SCO1/SenC  30.84 
 
 
363 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5664  cytochrome c class I  31.11 
 
 
443 aa  48.5  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.239336  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0650  electron transport protein SCO1/SenC  31.18 
 
 
340 aa  46.2  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2297  hypothetical protein  30.43 
 
 
302 aa  44.7  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0292911 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4298  electron transport protein SCO1/SenC  27.47 
 
 
356 aa  44.3  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.576554  normal  0.116198 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0408  hypothetical protein  34.62 
 
 
149 aa  44.3  0.0007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0357243  normal  0.780002 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1948  cytochrome cM  38.71 
 
 
137 aa  43.1  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01315  Cytochrome c3  29.21 
 
 
427 aa  42  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5485  cytochrome c class I  33.9 
 
 
561 aa  41.6  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.233629 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2213  cytochrome c, mono- and diheme variant  39.53 
 
 
435 aa  41.6  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2655  cytochrome c class I  25.17 
 
 
144 aa  40.4  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2549  hypothetical protein  27.06 
 
 
419 aa  40.4  0.008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000354774  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0902  heme-binding protein  36.67 
 
 
1139 aa  40.4  0.009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>