28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0307 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0307  putative cytochrome c  100 
 
 		 410 aa  834    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0124667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7193  cytochrome c class I  59.8 
 
 		 409 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.99524  normal  0.500209 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5973  cytochrome c class I  59.15 
 
 		 412 aa  435  1e-121  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0365316 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5894  cytochrome c class I  57.35 
 
 		 421 aa  433  1e-120  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.18364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5154  extracellular solute-binding protein  55.85 
 
 		 401 aa  428  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3241  extracellular solute-binding protein  55.15 
 
 		 415 aa  422  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0294244  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5127  extracellular solute-binding protein  55.15 
 
 		 415 aa  422  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.600349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6161  cytochrome c, class I  56.22 
 
 		 424 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.969705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3640  cytochrome c class I  30.2 
 
 		 417 aa  134  3.9999999999999996e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.102782  normal  0.70332 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1739  cytochrome c, class I  39.81 
 
 		 146 aa  89  1e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2798  cytochrome c, class I  40.74 
 
 		 410 aa  85.5  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.228923  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1149  Pyrrolo-quinoline quinone  38.54 
 
 		 678 aa  77  0.0000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.261687  normal  0.842615 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1569  cytochrome c, class I  39.8 
 
 		 141 aa  69.7  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.832933  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3472  hypothetical protein  34.65 
 
 		 131 aa  68.9  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2891  cytochrome c, class I  35.23 
 
 		 201 aa  62.4  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2838  quinoprotein glucose dehydrogenase  32.61 
 
 		 126 aa  58.2  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.158282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4887  putative cytochrome c region protein  32.35 
 
 		 179 aa  50.8  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.362181 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0560  sulfite oxidase cytochrome subunit  32.18 
 
 		 209 aa  49.3  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.876942 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1441  Pyrrolo-quinoline quinone  32.95 
 
 		 708 aa  49.3  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0121309 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2378  cytochrome c, class I  32.94 
 
 		 282 aa  47.4  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000643985  hitchhiker  0.0000202689 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0152  putative sulfite oxidase cytochrome subunit  32.63 
 
 		 195 aa  47  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4156  cytochrome c, class I  27.59 
 
 		 382 aa  45.1  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.1533  normal  0.864347 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1188  cytochrome c, class I  30.69 
 
 		 139 aa  45.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5347  putative cytochrome c  29.81 
 
 		 272 aa  44.3  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.118303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1895  putative cytochrome c  26.56 
 
 		 181 aa  43.9  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1616  cytochrome c class I  26.67 
 
 		 171 aa  43.9  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.986895 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1948  cytochrome cM  33.78 
 
 		 137 aa  43.1  0.009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3677  putative sulfite oxidase cytochrome subunit (SoxD)  29.41 
 
 		 252 aa  42.7  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.699117  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>