30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2798 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_2798  cytochrome c, class I  100 
 
 		 410 aa  825    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.228923  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1739  cytochrome c, class I  45.28 
 
 		 146 aa  93.6  6e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7193  cytochrome c class I  44 
 
 		 409 aa  92.4  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.99524  normal  0.500209 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3640  cytochrome c class I  49.46 
 
 		 417 aa  90.9  4e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.102782  normal  0.70332 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5973  cytochrome c class I  42.86 
 
 		 412 aa  88.6  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0365316 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0307  putative cytochrome c  40.74 
 
 		 410 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0124667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6161  cytochrome c, class I  46.15 
 
 		 424 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.969705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1149  Pyrrolo-quinoline quinone  41.05 
 
 		 678 aa  81.6  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.261687  normal  0.842615 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5894  cytochrome c class I  44.23 
 
 		 421 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.18364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5154  extracellular solute-binding protein  37.5 
 
 		 401 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3241  extracellular solute-binding protein  36.54 
 
 		 415 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0294244  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5127  extracellular solute-binding protein  36.54 
 
 		 415 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.600349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1569  cytochrome c, class I  37.36 
 
 		 141 aa  72  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.832933  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2891  cytochrome c, class I  37.5 
 
 		 201 aa  61.2  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3472  hypothetical protein  32.22 
 
 		 131 aa  60.1  0.00000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1441  Pyrrolo-quinoline quinone  34.67 
 
 		 708 aa  54.7  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0121309 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2838  quinoprotein glucose dehydrogenase  32.61 
 
 		 126 aa  53.9  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.158282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1616  cytochrome c class I  31.09 
 
 		 171 aa  48.9  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.986895 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4887  putative cytochrome c region protein  34.31 
 
 		 179 aa  48.5  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.362181 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2987  cytochrome c, class I  33.71 
 
 		 188 aa  48.5  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.29363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2868  cytochrome c class I  35.29 
 
 		 187 aa  48.5  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3392  glucose sorbosone dehydrogenase  32.32 
 
 		 476 aa  47.8  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.428431  normal  0.278741 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3340  cytochrome c, class I  34.52 
 
 		 194 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.147633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1094  cytochrome c, class I  33.71 
 
 		 188 aa  45.4  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3665  cytochrome c, class I  33.33 
 
 		 194 aa  43.9  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.514371  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3973  cytochrome c class I  32.14 
 
 		 132 aa  43.9  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.558222  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0341  putative cytochrome c, class I precursor  34.83 
 
 		 186 aa  43.5  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0147  cytochrome c, class I  34.52 
 
 		 222 aa  43.1  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2087  putative sulfite oxidase cytochrome subunit  31.82 
 
 		 180 aa  43.1  0.009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.829458 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0879  cytochrome c oxidase, subunit II  34.92 
 
 		 373 aa  43.1  0.009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>