35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5894 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010557  BamMC406_5894  cytochrome c class I  100 
 
 		 421 aa  847    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.18364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6161  cytochrome c, class I  96.93 
 
 		 424 aa  800    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.969705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5973  cytochrome c class I  79.07 
 
 		 412 aa  610  1e-173  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0365316 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5154  extracellular solute-binding protein  62.14 
 
 		 401 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3241  extracellular solute-binding protein  61.41 
 
 		 415 aa  503  1e-141  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0294244  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5127  extracellular solute-binding protein  61.41 
 
 		 415 aa  503  1e-141  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.600349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7193  cytochrome c class I  57.91 
 
 		 409 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.99524  normal  0.500209 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0307  putative cytochrome c  56.76 
 
 		 410 aa  428  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0124667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3640  cytochrome c class I  28.94 
 
 		 417 aa  119  9.999999999999999e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.102782  normal  0.70332 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1739  cytochrome c, class I  42.45 
 
 		 146 aa  89.7  9e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2798  cytochrome c, class I  44.23 
 
 		 410 aa  84  0.000000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.228923  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2891  cytochrome c, class I  42.5 
 
 		 201 aa  73.2  0.000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1149  Pyrrolo-quinoline quinone  33.33 
 
 		 678 aa  72.8  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.261687  normal  0.842615 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1569  cytochrome c, class I  38.78 
 
 		 141 aa  68.9  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.832933  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3472  hypothetical protein  35.92 
 
 		 131 aa  66.6  0.0000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2838  quinoprotein glucose dehydrogenase  36.96 
 
 		 126 aa  58.2  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.158282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2734  cytochrome c class I  31.4 
 
 		 200 aa  55.1  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.207547  hitchhiker  0.0000919605 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0560  sulfite oxidase cytochrome subunit  35.2 
 
 		 209 aa  51.6  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.876942 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1616  cytochrome c class I  35.04 
 
 		 171 aa  49.3  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.986895 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1441  Pyrrolo-quinoline quinone  32.95 
 
 		 708 aa  45.8  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0121309 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0152  putative sulfite oxidase cytochrome subunit  30.91 
 
 		 195 aa  46.2  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2167  putative sulfite oxidase cytochrome c subunit, SoxD  32.73 
 
 		 180 aa  45.8  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8678  cytochrome c class I  30.34 
 
 		 185 aa  45.8  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00176651  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3677  putative sulfite oxidase cytochrome subunit (SoxD)  32.98 
 
 		 252 aa  45.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.699117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1094  cytochrome c, class I  28.93 
 
 		 188 aa  44.7  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4887  putative cytochrome c region protein  30.77 
 
 		 179 aa  44.7  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.362181 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0776  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  33.33 
 
 		 270 aa  44.7  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.616971 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5018  nitrite reductase (NO-forming)  42.65 
 
 		 503 aa  44.3  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2987  cytochrome c, class I  30.1 
 
 		 188 aa  44.3  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.29363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2285  cytochrome c, class I  26.79 
 
 		 346 aa  44.3  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00711214  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32540  hypothetical protein  32.99 
 
 		 293 aa  44.3  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.277482 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2757  hypothetical protein  32.63 
 
 		 291 aa  43.9  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0570414  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2087  putative sulfite oxidase cytochrome subunit  33.33 
 
 		 180 aa  43.9  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.829458 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2868  cytochrome c class I  29.2 
 
 		 187 aa  43.5  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1590  cytochrome c class I  25.89 
 
 		 344 aa  43.1  0.009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.960712  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>