44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_5127 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_5154  extracellular solute-binding protein  97.76 
 
 		 401 aa  769    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3241  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 415 aa  847    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0294244  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5127  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 415 aa  847    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.600349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5894  cytochrome c class I  62.23 
 
 		 421 aa  509  1e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.18364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6161  cytochrome c, class I  62.02 
 
 		 424 aa  496  1e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.969705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5973  cytochrome c class I  62.23 
 
 		 412 aa  478  1e-134  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0365316 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7193  cytochrome c class I  55.61 
 
 		 409 aa  426  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.99524  normal  0.500209 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0307  putative cytochrome c  54.3 
 
 		 410 aa  419  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0124667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3640  cytochrome c class I  28.95 
 
 		 417 aa  129  7.000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.102782  normal  0.70332 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1739  cytochrome c, class I  39.62 
 
 		 146 aa  82  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3472  hypothetical protein  37.84 
 
 		 131 aa  77  0.0000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2798  cytochrome c, class I  36.54 
 
 		 410 aa  75.9  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.228923  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1149  Pyrrolo-quinoline quinone  32.09 
 
 		 678 aa  73.6  0.000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.261687  normal  0.842615 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1569  cytochrome c, class I  33.9 
 
 		 141 aa  67.4  0.0000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.832933  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2891  cytochrome c, class I  36.25 
 
 		 201 aa  62  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2838  quinoprotein glucose dehydrogenase  35.23 
 
 		 126 aa  58.9  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.158282  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3203  Mo-co oxidoreductase dimerization domain protein  32.8 
 
 		 182 aa  53.9  0.000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.595677  hitchhiker  0.0000523602 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4887  putative cytochrome c region protein  29.73 
 
 		 179 aa  53.5  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.362181 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3444  hypothetical protein  32.8 
 
 		 182 aa  53.9  0.000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.568465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0560  sulfite oxidase cytochrome subunit  29.6 
 
 		 209 aa  51.6  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.876942 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0152  putative sulfite oxidase cytochrome subunit  33.03 
 
 		 195 aa  50.4  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3677  putative sulfite oxidase cytochrome subunit (SoxD)  30.83 
 
 		 252 aa  48.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.699117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2167  putative sulfite oxidase cytochrome c subunit, SoxD  29.69 
 
 		 180 aa  47.8  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1616  cytochrome c class I  27.97 
 
 		 171 aa  47.4  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.986895 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3211  putative sulfite oxidase cytochrome subunit  27.21 
 
 		 206 aa  47  0.0007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4156  cytochrome c, class I  32 
 
 		 382 aa  46.6  0.0009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.1533  normal  0.864347 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2734  cytochrome c class I  27.87 
 
 		 200 aa  45.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.207547  hitchhiker  0.0000919605 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1188  cytochrome c, class I  35 
 
 		 139 aa  45.1  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3191  cytochrome c class I  30.53 
 
 		 304 aa  45.8  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3665  cytochrome c, class I  30.95 
 
 		 194 aa  45.1  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.514371  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8678  cytochrome c class I  30 
 
 		 185 aa  44.7  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00176651  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0341  putative cytochrome c, class I precursor  28.16 
 
 		 186 aa  44.7  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2868  cytochrome c class I  28.69 
 
 		 187 aa  44.7  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3537  cytochrome c class I  28 
 
 		 304 aa  44.3  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.429309  normal  0.0523965 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3392  glucose sorbosone dehydrogenase  32.05 
 
 		 476 aa  44.3  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.428431  normal  0.278741 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1441  Pyrrolo-quinoline quinone  29.87 
 
 		 708 aa  44.3  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0121309 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2087  putative sulfite oxidase cytochrome subunit  27.12 
 
 		 180 aa  44.3  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.829458 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1948  cytochrome c, class I  28 
 
 		 304 aa  43.9  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.510162  normal  0.709424 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2227  Pyrrolo-quinoline quinone  36.25 
 
 		 705 aa  43.9  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.580603 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3822  cytochrome c family protein  28 
 
 		 304 aa  43.9  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.445859  normal  0.312064 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7231  cytochrome c class I  28.12 
 
 		 200 aa  43.5  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.77975  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2693  cytochrome c class I  30.4 
 
 		 306 aa  43.5  0.007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.714589  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2757  hypothetical protein  29 
 
 		 291 aa  43.1  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0570414  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1895  putative cytochrome c  28.81 
 
 		 181 aa  43.1  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>