56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1569 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_1569  cytochrome c, class I  100 
 
 		 141 aa  281  2.0000000000000002e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.832933  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1149  Pyrrolo-quinoline quinone  42 
 
 		 678 aa  77  0.00000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.261687  normal  0.842615 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3640  cytochrome c class I  40 
 
 		 417 aa  75.9  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.102782  normal  0.70332 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5973  cytochrome c class I  40.82 
 
 		 412 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0365316 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2798  cytochrome c, class I  37.36 
 
 		 410 aa  72.8  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.228923  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3472  hypothetical protein  38.84 
 
 		 131 aa  72  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1739  cytochrome c, class I  44.09 
 
 		 146 aa  70.9  0.000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0307  putative cytochrome c  39.8 
 
 		 410 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0124667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5894  cytochrome c class I  38.78 
 
 		 421 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.18364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3241  extracellular solute-binding protein  33.9 
 
 		 415 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0294244  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5127  extracellular solute-binding protein  33.9 
 
 		 415 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.600349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5154  extracellular solute-binding protein  36.27 
 
 		 401 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7193  cytochrome c class I  36.7 
 
 		 409 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.99524  normal  0.500209 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6161  cytochrome c, class I  35.56 
 
 		 424 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.969705  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2838  quinoprotein glucose dehydrogenase  36.36 
 
 		 126 aa  59.3  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.158282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2167  putative sulfite oxidase cytochrome c subunit, SoxD  36.79 
 
 		 180 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2891  cytochrome c, class I  39.56 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0152  putative sulfite oxidase cytochrome subunit  36.79 
 
 		 195 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7231  cytochrome c class I  31.45 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.77975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1895  putative cytochrome c  35.24 
 
 		 181 aa  53.5  0.0000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6197  cytochrome c class I  31.71 
 
 		 174 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5874  cytochrome c class I  31.43 
 
 		 180 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.362058  normal  0.18158 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6593  cytochrome c, class I  30.89 
 
 		 174 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.263002 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1239  cytochrome c, class I  30.89 
 
 		 174 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2868  cytochrome c class I  29.81 
 
 		 187 aa  49.3  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8678  cytochrome c class I  31.43 
 
 		 185 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00176651  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1616  cytochrome c class I  29.52 
 
 		 171 aa  48.1  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.986895 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1441  Pyrrolo-quinoline quinone  35.78 
 
 		 708 aa  47.4  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0121309 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3042  cytochrome c, class I  33.96 
 
 		 259 aa  47  0.00009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.909018  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4887  putative cytochrome c region protein  31.73 
 
 		 179 aa  46.6  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.362181 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2734  cytochrome c class I  29.52 
 
 		 200 aa  46.6  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.207547  hitchhiker  0.0000919605 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2059  diheme cytochrome c SoxD  30.77 
 
 		 382 aa  45.8  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173988  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2987  cytochrome c, class I  28.57 
 
 		 188 aa  45.4  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.29363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2087  putative sulfite oxidase cytochrome subunit  30.19 
 
 		 180 aa  45.1  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.829458 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3133  cytochrome c, class I  29.06 
 
 		 348 aa  44.7  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.460697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5485  cytochrome c class I  35.85 
 
 		 561 aa  45.1  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.233629 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2955  cytochrome c, class I  35.11 
 
 		 278 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.136352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3211  putative sulfite oxidase cytochrome subunit  28.03 
 
 		 206 aa  44.3  0.0006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3665  cytochrome c, class I  29.13 
 
 		 194 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.514371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3677  putative sulfite oxidase cytochrome subunit (SoxD)  31.87 
 
 		 252 aa  43.5  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.699117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0560  sulfite oxidase cytochrome subunit  30.56 
 
 		 209 aa  43.5  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.876942 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3303  cytochrome c, class I  31.06 
 
 		 272 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.227675 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3340  cytochrome c, class I  28.16 
 
 		 194 aa  42.4  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.147633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3292  cytochrome c, class I  31.06 
 
 		 272 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.250177  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3354  cytochrome c, class I  31.06 
 
 		 272 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0582943  normal  0.0591201 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2704  Quinoprotein glucose dehydrogenase  34.34 
 
 		 731 aa  42  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2285  cytochrome c, class I  26.55 
 
 		 346 aa  41.6  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00711214  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2693  cytochrome c class I  28.47 
 
 		 306 aa  41.6  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.714589  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1590  cytochrome c class I  26.55 
 
 		 344 aa  41.6  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.960712  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1094  cytochrome c, class I  27.59 
 
 		 188 aa  41.2  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1666  cytochrome c class I  25.66 
 
 		 344 aa  40.4  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.185876  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4119  cytochrome c class I  33.67 
 
 		 271 aa  40.4  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.83541 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3203  Mo-co oxidoreductase dimerization domain protein  27.78 
 
 		 182 aa  40.4  0.009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.595677  hitchhiker  0.0000523602 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3444  hypothetical protein  27.78 
 
 		 182 aa  40.4  0.009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.568465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3249  cytochrome c class I  34.31 
 
 		 255 aa  40  0.01  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00726195  hitchhiker  0.0000284914 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0147  cytochrome c, class I  27.7 
 
 		 222 aa  40  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>