64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_3665 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_3665  cytochrome c, class I  100 
 
 		 194 aa  379  1e-104  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.514371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3340  cytochrome c, class I  97.42 
 
 		 194 aa  345  2e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.147633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5874  cytochrome c class I  68.64 
 
 		 180 aa  218  6e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.362058  normal  0.18158 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4887  putative cytochrome c region protein  60.12 
 
 		 179 aa  214  5e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.362181 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8678  cytochrome c class I  65.38 
 
 		 185 aa  214  5e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00176651  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0152  putative sulfite oxidase cytochrome subunit  65.31 
 
 		 195 aa  211  4.9999999999999996e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2167  putative sulfite oxidase cytochrome c subunit, SoxD  66.67 
 
 		 180 aa  211  7e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6593  cytochrome c, class I  68.46 
 
 		 174 aa  206  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.263002 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1239  cytochrome c, class I  68.46 
 
 		 174 aa  206  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7231  cytochrome c class I  63.95 
 
 		 200 aa  204  6e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.77975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1895  putative cytochrome c  62.84 
 
 		 181 aa  202  3e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6197  cytochrome c class I  68.28 
 
 		 174 aa  198  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1517  putative cytochrome  59.18 
 
 		 260 aa  184  6e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.936874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4956  putative sulfite oxidase cytochrome subunit (SoxD)  55.33 
 
 		 251 aa  180  1e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4162  putative sulfite oxidase cytochrome subunit (SoxD)  50.6 
 
 		 225 aa  176  1e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2801  cytochrome c  50 
 
 		 342 aa  175  3e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.26281 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3677  putative sulfite oxidase cytochrome subunit (SoxD)  56.21 
 
 		 252 aa  174  7e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.699117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4156  cytochrome c, class I  48.85 
 
 		 382 aa  174  7e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.1533  normal  0.864347 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3042  cytochrome c, class I  56.29 
 
 		 259 aa  171  6.999999999999999e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.909018  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2087  putative sulfite oxidase cytochrome subunit  57.04 
 
 		 180 aa  170  1e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.829458 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4251  putative cytochrome  52.67 
 
 		 242 aa  169  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.460774  normal  0.218955 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3912  hypothetical protein  54.42 
 
 		 211 aa  166  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.411473 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4367  cytochrome c, class I  50.62 
 
 		 243 aa  165  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0147  cytochrome c, class I  55.92 
 
 		 222 aa  164  9e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1616  cytochrome c class I  49.08 
 
 		 171 aa  161  4.0000000000000004e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.986895 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1094  cytochrome c, class I  49.68 
 
 		 188 aa  155  4e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3211  putative sulfite oxidase cytochrome subunit  47.37 
 
 		 206 aa  152  2.9999999999999998e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0912  putative sulfite oxidase cytochrome subunit  57.72 
 
 		 202 aa  143  1e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.68088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2734  cytochrome c class I  47.68 
 
 		 200 aa  142  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.207547  hitchhiker  0.0000919605 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0341  putative cytochrome c, class I precursor  45.81 
 
 		 186 aa  140  8e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0560  sulfite oxidase cytochrome subunit  42.68 
 
 		 209 aa  137  8.999999999999999e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.876942 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2987  cytochrome c, class I  44.65 
 
 		 188 aa  135  3.0000000000000003e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.29363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1590  cytochrome c class I  49.04 
 
 		 344 aa  135  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.960712  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2285  cytochrome c, class I  48.08 
 
 		 346 aa  131  6e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00711214  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2630  cytochrome c, class I  44.94 
 
 		 404 aa  131  6.999999999999999e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.820751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2059  diheme cytochrome c SoxD  41.92 
 
 		 382 aa  130  9e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173988  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2868  cytochrome c class I  44.16 
 
 		 187 aa  130  9e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2437  diheme cytochrome c SoxD  42.13 
 
 		 355 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3133  cytochrome c, class I  40.45 
 
 		 348 aa  128  6e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.460697  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3444  hypothetical protein  44.08 
 
 		 182 aa  127  9.000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.568465  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3203  Mo-co oxidoreductase dimerization domain protein  44.08 
 
 		 182 aa  127  9.000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.595677  hitchhiker  0.0000523602 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1666  cytochrome c class I  46.75 
 
 		 344 aa  127  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.185876  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3257  cytochrome c, class I  41.4 
 
 		 344 aa  125  4.0000000000000003e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.225415  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0802  cytochrome c, class I  42.68 
 
 		 360 aa  123  1e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.641735  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3783  cytochrome c class I  43.12 
 
 		 355 aa  123  2e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0586  hypothetical protein  37.04 
 
 		 239 aa  100  2e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.649014  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0157  hypothetical protein  36.42 
 
 		 331 aa  96.7  2e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000097536  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2891  cytochrome c, class I  32.98 
 
 		 201 aa  52.4  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1943  c-type cytochrome  29.13 
 
 		 327 aa  46.2  0.0003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5154  extracellular solute-binding protein  30.95 
 
 		 401 aa  45.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2236  cytochrome c, class I  28.16 
 
 		 327 aa  45.8  0.0004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.472913 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2757  hypothetical protein  31.91 
 
 		 291 aa  45.1  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0570414  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5127  extracellular solute-binding protein  30.95 
 
 		 415 aa  45.4  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.600349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3241  extracellular solute-binding protein  30.95 
 
 		 415 aa  45.4  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0294244  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1569  cytochrome c, class I  29.13 
 
 		 141 aa  45.1  0.0007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.832933  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1149  Pyrrolo-quinoline quinone  28.71 
 
 		 678 aa  43.9  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.261687  normal  0.842615 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7193  cytochrome c class I  29.81 
 
 		 409 aa  44.3  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.99524  normal  0.500209 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2798  cytochrome c, class I  33.33 
 
 		 410 aa  43.9  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.228923  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3472  hypothetical protein  29.25 
 
 		 131 aa  43.9  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1810  cytochrome c class I  37.08 
 
 		 294 aa  43.1  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.780394  normal  0.101949 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0286  OmpA/MotB  33.72 
 
 		 329 aa  42.7  0.003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.251246  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1807  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  31.9 
 
 		 469 aa  42.7  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000207286  hitchhiker  0.000745759 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5973  cytochrome c class I  32.65 
 
 		 412 aa  41.6  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0365316 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5894  cytochrome c class I  32.98 
 
 		 421 aa  41.6  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.18364  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>