71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2734 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2734  cytochrome c class I  100 
 
 		 200 aa  409  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.207547  hitchhiker  0.0000919605 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1616  cytochrome c class I  62.96 
 
 		 171 aa  212  1.9999999999999998e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.986895 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0341  putative cytochrome c, class I precursor  59.12 
 
 		 186 aa  187  1e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0560  sulfite oxidase cytochrome subunit  57.89 
 
 		 209 aa  177  1e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.876942 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1895  putative cytochrome c  52.9 
 
 		 181 aa  159  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2167  putative sulfite oxidase cytochrome c subunit, SoxD  53.64 
 
 		 180 aa  153  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0152  putative sulfite oxidase cytochrome subunit  53.02 
 
 		 195 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3665  cytochrome c, class I  48.7 
 
 		 194 aa  149  3e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.514371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3340  cytochrome c, class I  48.7 
 
 		 194 aa  148  5e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.147633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7231  cytochrome c class I  50 
 
 		 200 aa  144  8.000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.77975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2087  putative sulfite oxidase cytochrome subunit  50.35 
 
 		 180 aa  144  9e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.829458 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4956  putative sulfite oxidase cytochrome subunit (SoxD)  48.67 
 
 		 251 aa  142  3e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4887  putative cytochrome c region protein  50.68 
 
 		 179 aa  141  6e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.362181 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6593  cytochrome c, class I  48.12 
 
 		 174 aa  141  7e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.263002 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1239  cytochrome c, class I  48.12 
 
 		 174 aa  141  7e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1517  putative cytochrome  45.27 
 
 		 260 aa  139  3e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.936874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8678  cytochrome c class I  44.59 
 
 		 185 aa  137  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00176651  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4251  putative cytochrome  48.68 
 
 		 242 aa  136  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.460774  normal  0.218955 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4162  putative sulfite oxidase cytochrome subunit (SoxD)  45.22 
 
 		 225 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1094  cytochrome c, class I  46.41 
 
 		 188 aa  135  6.0000000000000005e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4367  cytochrome c, class I  46.15 
 
 		 243 aa  134  9e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6197  cytochrome c class I  53.52 
 
 		 174 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2987  cytochrome c, class I  45 
 
 		 188 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.29363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3677  putative sulfite oxidase cytochrome subunit (SoxD)  44.23 
 
 		 252 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.699117  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3203  Mo-co oxidoreductase dimerization domain protein  44.79 
 
 		 182 aa  130  2.0000000000000002e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.595677  hitchhiker  0.0000523602 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3444  hypothetical protein  44.79 
 
 		 182 aa  130  2.0000000000000002e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.568465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5874  cytochrome c class I  45.16 
 
 		 180 aa  129  3e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.362058  normal  0.18158 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3912  hypothetical protein  42.47 
 
 		 211 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.411473 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0147  cytochrome c, class I  44.3 
 
 		 222 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2868  cytochrome c class I  48.67 
 
 		 187 aa  125  3e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3042  cytochrome c, class I  44.44 
 
 		 259 aa  125  3e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.909018  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2801  cytochrome c  38.67 
 
 		 342 aa  125  4.0000000000000003e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.26281 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4156  cytochrome c, class I  38.26 
 
 		 382 aa  121  6e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.1533  normal  0.864347 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3211  putative sulfite oxidase cytochrome subunit  40.67 
 
 		 206 aa  117  9.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2059  diheme cytochrome c SoxD  41.67 
 
 		 382 aa  112  3e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173988  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0912  putative sulfite oxidase cytochrome subunit  43.67 
 
 		 202 aa  101  6e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.68088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2437  diheme cytochrome c SoxD  38.96 
 
 		 355 aa  100  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3783  cytochrome c class I  40.27 
 
 		 355 aa  97.8  9e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3133  cytochrome c, class I  38.26 
 
 		 348 aa  95.9  3e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.460697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1590  cytochrome c class I  36.3 
 
 		 344 aa  95.1  6e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.960712  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0802  cytochrome c, class I  35.62 
 
 		 360 aa  94.4  1e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.641735  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2285  cytochrome c, class I  33.73 
 
 		 346 aa  92.8  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00711214  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2630  cytochrome c, class I  38.35 
 
 		 404 aa  92  5e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.820751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1666  cytochrome c class I  37.06 
 
 		 344 aa  91.3  9e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.185876  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3257  cytochrome c, class I  41.18 
 
 		 344 aa  90.9  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.225415  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0586  hypothetical protein  35.71 
 
 		 239 aa  87.4  1e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.649014  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0157  hypothetical protein  32.76 
 
 		 331 aa  77  0.0000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000097536  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5894  cytochrome c class I  33.04 
 
 		 421 aa  53.5  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.18364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6161  cytochrome c, class I  32.41 
 
 		 424 aa  50.8  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.969705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1149  Pyrrolo-quinoline quinone  31.63 
 
 		 678 aa  50.8  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.261687  normal  0.842615 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5973  cytochrome c class I  32.41 
 
 		 412 aa  50.4  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0365316 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1569  cytochrome c, class I  29.52 
 
 		 141 aa  49.3  0.00004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.832933  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7193  cytochrome c class I  29.13 
 
 		 409 aa  47.8  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.99524  normal  0.500209 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2798  cytochrome c, class I  29.03 
 
 		 410 aa  46.2  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.228923  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5154  extracellular solute-binding protein  27.87 
 
 		 401 aa  46.2  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2891  cytochrome c, class I  31.03 
 
 		 201 aa  46.2  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5127  extracellular solute-binding protein  27.87 
 
 		 415 aa  45.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.600349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3241  extracellular solute-binding protein  27.87 
 
 		 415 aa  45.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0294244  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2236  cytochrome c, class I  31.07 
 
 		 327 aa  45.1  0.0007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.472913 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1943  c-type cytochrome  31.07 
 
 		 327 aa  44.7  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1739  cytochrome c, class I  32.32 
 
 		 146 aa  44.3  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0307  putative cytochrome c  28.21 
 
 		 410 aa  44.7  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0124667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3425  cytochrome c class I  29.41 
 
 		 278 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4489  cytochrome c class I  27.73 
 
 		 280 aa  43.5  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.519402 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4098  cytochrome c, class I  29.41 
 
 		 278 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.982454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1946  cytochrome c, class I  29.41 
 
 		 277 aa  43.5  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.166629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4268  cytochrome c, class I  29.41 
 
 		 278 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1827  cytochrome c class I  30.56 
 
 		 280 aa  42.7  0.004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3472  hypothetical protein  24.53 
 
 		 131 aa  42  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3509  cytochrome c, class I  27.73 
 
 		 278 aa  41.6  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3992  cytochrome c class I  26.27 
 
 		 278 aa  41.6  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.08341  normal  0.223364 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>