68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1616 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1616  cytochrome c class I  100 
 
 		 171 aa  352  2e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.986895 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2734  cytochrome c class I  60.59 
 
 		 200 aa  202  3e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.207547  hitchhiker  0.0000919605 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0341  putative cytochrome c, class I precursor  57.32 
 
 		 186 aa  194  6e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0560  sulfite oxidase cytochrome subunit  54.43 
 
 		 209 aa  171  2.9999999999999996e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.876942 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3665  cytochrome c, class I  50 
 
 		 194 aa  160  8.000000000000001e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.514371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1895  putative cytochrome c  51.33 
 
 		 181 aa  159  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3340  cytochrome c, class I  50 
 
 		 194 aa  159  1e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.147633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8678  cytochrome c class I  49.01 
 
 		 185 aa  155  3e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00176651  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0152  putative sulfite oxidase cytochrome subunit  51.37 
 
 		 195 aa  150  8.999999999999999e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6593  cytochrome c, class I  52 
 
 		 174 aa  149  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.263002 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1239  cytochrome c, class I  52 
 
 		 174 aa  149  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7231  cytochrome c class I  48.1 
 
 		 200 aa  148  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.77975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5874  cytochrome c class I  48.77 
 
 		 180 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.362058  normal  0.18158 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4887  putative cytochrome c region protein  49.02 
 
 		 179 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.362181 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2167  putative sulfite oxidase cytochrome c subunit, SoxD  50 
 
 		 180 aa  145  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6197  cytochrome c class I  52.08 
 
 		 174 aa  143  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4956  putative sulfite oxidase cytochrome subunit (SoxD)  50.99 
 
 		 251 aa  142  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4162  putative sulfite oxidase cytochrome subunit (SoxD)  49.01 
 
 		 225 aa  137  7.999999999999999e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2087  putative sulfite oxidase cytochrome subunit  47.33 
 
 		 180 aa  136  1e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.829458 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2801  cytochrome c  41.61 
 
 		 342 aa  135  4e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.26281 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3444  hypothetical protein  46.1 
 
 		 182 aa  134  9e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.568465  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3203  Mo-co oxidoreductase dimerization domain protein  46.1 
 
 		 182 aa  134  9e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.595677  hitchhiker  0.0000523602 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4251  putative cytochrome  49.34 
 
 		 242 aa  132  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.460774  normal  0.218955 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2868  cytochrome c class I  44.23 
 
 		 187 aa  131  3.9999999999999996e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3677  putative sulfite oxidase cytochrome subunit (SoxD)  43.59 
 
 		 252 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.699117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4367  cytochrome c, class I  48.05 
 
 		 243 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3211  putative sulfite oxidase cytochrome subunit  41.56 
 
 		 206 aa  128  4.0000000000000003e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3042  cytochrome c, class I  41.61 
 
 		 259 aa  126  2.0000000000000002e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.909018  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1094  cytochrome c, class I  38.46 
 
 		 188 aa  125  3e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1517  putative cytochrome  42.86 
 
 		 260 aa  125  4.0000000000000003e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.936874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0147  cytochrome c, class I  44.67 
 
 		 222 aa  121  4e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4156  cytochrome c, class I  40.4 
 
 		 382 aa  120  6e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.1533  normal  0.864347 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2987  cytochrome c, class I  37.14 
 
 		 188 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.29363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3912  hypothetical protein  42.18 
 
 		 211 aa  117  6e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.411473 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2059  diheme cytochrome c SoxD  41.1 
 
 		 382 aa  114  7.999999999999999e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173988  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0912  putative sulfite oxidase cytochrome subunit  46.31 
 
 		 202 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.68088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2437  diheme cytochrome c SoxD  41.18 
 
 		 355 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3257  cytochrome c, class I  40.52 
 
 		 344 aa  100  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.225415  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1590  cytochrome c class I  38.96 
 
 		 344 aa  98.6  4e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.960712  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2630  cytochrome c, class I  37.36 
 
 		 404 aa  97.1  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.820751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3133  cytochrome c, class I  37.11 
 
 		 348 aa  95.1  4e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.460697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2285  cytochrome c, class I  37.82 
 
 		 346 aa  94.7  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00711214  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1666  cytochrome c class I  38.41 
 
 		 344 aa  94.7  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.185876  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0802  cytochrome c, class I  37.01 
 
 		 360 aa  93.6  1e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.641735  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3783  cytochrome c class I  36.59 
 
 		 355 aa  92.4  3e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0157  hypothetical protein  37.01 
 
 		 331 aa  82  0.000000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000097536  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0586  hypothetical protein  34.55 
 
 		 239 aa  81.3  0.000000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.649014  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1943  c-type cytochrome  36.27 
 
 		 327 aa  55.1  0.0000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7193  cytochrome c class I  30.4 
 
 		 409 aa  53.1  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.99524  normal  0.500209 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2236  cytochrome c, class I  34.31 
 
 		 327 aa  51.6  0.000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.472913 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2891  cytochrome c, class I  34.34 
 
 		 201 aa  50.8  0.000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1149  Pyrrolo-quinoline quinone  29.91 
 
 		 678 aa  50.4  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.261687  normal  0.842615 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5154  extracellular solute-binding protein  28.47 
 
 		 401 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2798  cytochrome c, class I  31.09 
 
 		 410 aa  49.3  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.228923  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5894  cytochrome c class I  35.04 
 
 		 421 aa  48.9  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.18364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1569  cytochrome c, class I  29.52 
 
 		 141 aa  48.5  0.00004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.832933  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3241  extracellular solute-binding protein  27.97 
 
 		 415 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0294244  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5127  extracellular solute-binding protein  27.97 
 
 		 415 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.600349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5973  cytochrome c class I  35.42 
 
 		 412 aa  46.6  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0365316 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2757  hypothetical protein  31.03 
 
 		 291 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0570414  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6161  cytochrome c, class I  33.33 
 
 		 424 aa  44.7  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.969705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0307  putative cytochrome c  26.67 
 
 		 410 aa  43.9  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0124667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1739  cytochrome c, class I  28.95 
 
 		 146 aa  43.5  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3640  cytochrome c class I  30.91 
 
 		 417 aa  43.1  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.102782  normal  0.70332 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2838  quinoprotein glucose dehydrogenase  31.87 
 
 		 126 aa  42.4  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.158282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1402  hypothetical protein  31.11 
 
 		 170 aa  42  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.781476  normal  0.402158 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32540  hypothetical protein  28.57 
 
 		 293 aa  42  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.277482 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2072  cytochrome c, class I  29.79 
 
 		 712 aa  40.8  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.901126 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>