48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0157 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0157  hypothetical protein  100 
 
 		 331 aa  689    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000097536  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3042  cytochrome c, class I  40.44 
 
 		 259 aa  110  5e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.909018  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2801  cytochrome c  33.18 
 
 		 342 aa  103  4e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.26281 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3677  putative sulfite oxidase cytochrome subunit (SoxD)  38.29 
 
 		 252 aa  103  6e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.699117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0147  cytochrome c, class I  36.56 
 
 		 222 aa  99  9e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8678  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 185 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00176651  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3665  cytochrome c, class I  36.42 
 
 		 194 aa  97.1  4e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.514371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1517  putative cytochrome  31.31 
 
 		 260 aa  97.1  4e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.936874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2167  putative sulfite oxidase cytochrome c subunit, SoxD  35.06 
 
 		 180 aa  97.1  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7231  cytochrome c class I  35.26 
 
 		 200 aa  96.3  7e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.77975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4956  putative sulfite oxidase cytochrome subunit (SoxD)  33.51 
 
 		 251 aa  94  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0152  putative sulfite oxidase cytochrome subunit  34.5 
 
 		 195 aa  93.6  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3340  cytochrome c, class I  35.26 
 
 		 194 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.147633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4162  putative sulfite oxidase cytochrome subunit (SoxD)  36.57 
 
 		 225 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4251  putative cytochrome  32.63 
 
 		 242 aa  89.7  7e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.460774  normal  0.218955 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4887  putative cytochrome c region protein  34.12 
 
 		 179 aa  88.6  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.362181 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3211  putative sulfite oxidase cytochrome subunit  33.65 
 
 		 206 aa  87.8  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4156  cytochrome c, class I  32.09 
 
 		 382 aa  86.3  7e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.1533  normal  0.864347 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3912  hypothetical protein  33.9 
 
 		 211 aa  85.9  9e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.411473 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1239  cytochrome c, class I  35.84 
 
 		 174 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6593  cytochrome c, class I  35.84 
 
 		 174 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.263002 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0341  putative cytochrome c, class I precursor  40.31 
 
 		 186 aa  85.5  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2868  cytochrome c class I  39.1 
 
 		 187 aa  85.5  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2059  diheme cytochrome c SoxD  29.92 
 
 		 382 aa  84.7  0.000000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173988  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1895  putative cytochrome c  38.35 
 
 		 181 aa  84.3  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2087  putative sulfite oxidase cytochrome subunit  38.4 
 
 		 180 aa  82.8  0.000000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.829458 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0586  hypothetical protein  33.16 
 
 		 239 aa  82.4  0.000000000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.649014  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1616  cytochrome c class I  37.01 
 
 		 171 aa  82  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.986895 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6197  cytochrome c class I  38.92 
 
 		 174 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4367  cytochrome c, class I  31.58 
 
 		 243 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5874  cytochrome c class I  40.48 
 
 		 180 aa  79.7  0.00000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.362058  normal  0.18158 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0560  sulfite oxidase cytochrome subunit  38.76 
 
 		 209 aa  79.7  0.00000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.876942 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3444  hypothetical protein  39.81 
 
 		 182 aa  72.4  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.568465  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3203  Mo-co oxidoreductase dimerization domain protein  39.81 
 
 		 182 aa  72.4  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.595677  hitchhiker  0.0000523602 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2734  cytochrome c class I  31.61 
 
 		 200 aa  71.6  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.207547  hitchhiker  0.0000919605 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1094  cytochrome c, class I  35.71 
 
 		 188 aa  70.5  0.00000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2987  cytochrome c, class I  27.59 
 
 		 188 aa  66.2  0.0000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.29363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0912  putative sulfite oxidase cytochrome subunit  33.15 
 
 		 202 aa  65.1  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.68088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3257  cytochrome c, class I  28.12 
 
 		 344 aa  63.9  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.225415  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3783  cytochrome c class I  28.36 
 
 		 355 aa  63.5  0.000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1590  cytochrome c class I  26.32 
 
 		 344 aa  63.5  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.960712  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3133  cytochrome c, class I  25.58 
 
 		 348 aa  62.8  0.000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.460697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1666  cytochrome c class I  26.49 
 
 		 344 aa  61.2  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.185876  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2437  diheme cytochrome c SoxD  27.32 
 
 		 355 aa  60.5  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2285  cytochrome c, class I  25.41 
 
 		 346 aa  60.5  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00711214  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0802  cytochrome c, class I  23.47 
 
 		 360 aa  58.2  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.641735  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2630  cytochrome c, class I  26.02 
 
 		 404 aa  58.2  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.820751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5211  putative cytochrome c  52.5 
 
 		 675 aa  43.1  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.0072933  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>