72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_6197 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6197  cytochrome c class I  100 
 
 		 174 aa  347  5e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6593  cytochrome c, class I  95.98 
 
 		 174 aa  317  6e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.263002 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1239  cytochrome c, class I  95.98 
 
 		 174 aa  317  6e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0152  putative sulfite oxidase cytochrome subunit  72.73 
 
 		 195 aa  233  8e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7231  cytochrome c class I  72.67 
 
 		 200 aa  233  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.77975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2167  putative sulfite oxidase cytochrome c subunit, SoxD  72.26 
 
 		 180 aa  230  7.000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8678  cytochrome c class I  68.42 
 
 		 185 aa  215  2e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00176651  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3665  cytochrome c, class I  67.79 
 
 		 194 aa  214  4e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.514371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3340  cytochrome c, class I  66.44 
 
 		 194 aa  209  2e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.147633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1895  putative cytochrome c  66.23 
 
 		 181 aa  206  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5874  cytochrome c class I  65.24 
 
 		 180 aa  195  3e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.362058  normal  0.18158 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4887  putative cytochrome c region protein  57.32 
 
 		 179 aa  192  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.362181 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3042  cytochrome c, class I  58.94 
 
 		 259 aa  177  7e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.909018  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2087  putative sulfite oxidase cytochrome subunit  57.04 
 
 		 180 aa  170  1e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.829458 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0147  cytochrome c, class I  55.92 
 
 		 222 aa  164  8e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3211  putative sulfite oxidase cytochrome subunit  48.7 
 
 		 206 aa  159  1e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2801  cytochrome c  48.47 
 
 		 342 aa  159  2e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.26281 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3677  putative sulfite oxidase cytochrome subunit (SoxD)  53.33 
 
 		 252 aa  159  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.699117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4956  putative sulfite oxidase cytochrome subunit (SoxD)  51.33 
 
 		 251 aa  158  3e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1616  cytochrome c class I  52.67 
 
 		 171 aa  157  5e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.986895 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1517  putative cytochrome  49.66 
 
 		 260 aa  155  3e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.936874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0560  sulfite oxidase cytochrome subunit  49.04 
 
 		 209 aa  153  1e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.876942 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4156  cytochrome c, class I  48.67 
 
 		 382 aa  152  2e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.1533  normal  0.864347 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4251  putative cytochrome  50.67 
 
 		 242 aa  152  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.460774  normal  0.218955 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1094  cytochrome c, class I  50 
 
 		 188 aa  150  8.999999999999999e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4162  putative sulfite oxidase cytochrome subunit (SoxD)  48.67 
 
 		 225 aa  150  1e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4367  cytochrome c, class I  50.67 
 
 		 243 aa  147  7e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3912  hypothetical protein  47.86 
 
 		 211 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.411473 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0912  putative sulfite oxidase cytochrome subunit  54.97 
 
 		 202 aa  143  2e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.68088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2987  cytochrome c, class I  46.11 
 
 		 188 aa  142  3e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.29363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2734  cytochrome c class I  51.3 
 
 		 200 aa  141  5e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.207547  hitchhiker  0.0000919605 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0341  putative cytochrome c, class I precursor  44.44 
 
 		 186 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2868  cytochrome c class I  46.45 
 
 		 187 aa  139  1.9999999999999998e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3133  cytochrome c, class I  42.7 
 
 		 348 aa  133  9.999999999999999e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.460697  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3444  hypothetical protein  45.16 
 
 		 182 aa  131  6e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.568465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3257  cytochrome c, class I  47.13 
 
 		 344 aa  130  6e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.225415  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3203  Mo-co oxidoreductase dimerization domain protein  45.16 
 
 		 182 aa  131  6e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.595677  hitchhiker  0.0000523602 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2437  diheme cytochrome c SoxD  45.45 
 
 		 355 aa  131  6e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1590  cytochrome c class I  47.13 
 
 		 344 aa  128  3e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.960712  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2059  diheme cytochrome c SoxD  44.1 
 
 		 382 aa  129  3e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173988  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2285  cytochrome c, class I  44.87 
 
 		 346 aa  122  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00711214  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1666  cytochrome c class I  45.75 
 
 		 344 aa  122  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.185876  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2630  cytochrome c, class I  43.56 
 
 		 404 aa  120  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.820751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0802  cytochrome c, class I  40.76 
 
 		 360 aa  119  3e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.641735  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3783  cytochrome c class I  42.5 
 
 		 355 aa  117  9.999999999999999e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0586  hypothetical protein  38.36 
 
 		 239 aa  105  2e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.649014  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0157  hypothetical protein  39.18 
 
 		 331 aa  97.8  7e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000097536  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1149  Pyrrolo-quinoline quinone  35.71 
 
 		 678 aa  58.9  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.261687  normal  0.842615 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1569  cytochrome c, class I  32.79 
 
 		 141 aa  57  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.832933  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2891  cytochrome c, class I  34.38 
 
 		 201 aa  52.8  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3241  extracellular solute-binding protein  30 
 
 		 415 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0294244  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5127  extracellular solute-binding protein  30 
 
 		 415 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.600349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1943  c-type cytochrome  28.24 
 
 		 327 aa  46.6  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2757  hypothetical protein  32.35 
 
 		 291 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0570414  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1739  cytochrome c, class I  34.74 
 
 		 146 aa  46.2  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32540  hypothetical protein  30.43 
 
 		 293 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.277482 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5154  extracellular solute-binding protein  29.09 
 
 		 401 aa  45.1  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2236  cytochrome c, class I  28.44 
 
 		 327 aa  44.3  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.472913 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1810  cytochrome c class I  35.16 
 
 		 294 aa  44.3  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.780394  normal  0.101949 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7193  cytochrome c class I  26.32 
 
 		 409 aa  43.5  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.99524  normal  0.500209 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1827  cytochrome c class I  32.76 
 
 		 280 aa  43.1  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3472  hypothetical protein  29.13 
 
 		 131 aa  42.7  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5973  cytochrome c class I  29.41 
 
 		 412 aa  42.4  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0365316 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1402  hypothetical protein  32.41 
 
 		 170 aa  42  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.781476  normal  0.402158 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4075  putative cytochrome c precursor  34.02 
 
 		 468 aa  42  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.635845  normal  0.598856 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5322  cytochrome c class I  28.71 
 
 		 346 aa  41.6  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0021785  normal  0.0885214 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3107  cytochrome c, class I  30.77 
 
 		 305 aa  41.2  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.510771  normal  0.352992 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3842  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  28.17 
 
 		 436 aa  40.8  0.009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3822  cytochrome c family protein  29.84 
 
 		 304 aa  40.8  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.445859  normal  0.312064 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3191  cytochrome c class I  31.78 
 
 		 304 aa  40.8  0.009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1948  cytochrome c, class I  29.84 
 
 		 304 aa  40.8  0.01  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.510162  normal  0.709424 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2485  Protein of unknown function DUF1588  47.5 
 
 		 778 aa  40.8  0.01  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.474006  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>