183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3133 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_3133  cytochrome c, class I  100 
 
 		 348 aa  717    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.460697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0802  cytochrome c, class I  55.56 
 
 		 360 aa  399  9.999999999999999e-111  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.641735  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3257  cytochrome c, class I  56.47 
 
 		 344 aa  378  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.225415  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3783  cytochrome c class I  54.05 
 
 		 355 aa  358  7e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1590  cytochrome c class I  54.22 
 
 		 344 aa  353  2e-96  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.960712  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2630  cytochrome c, class I  47.7 
 
 		 404 aa  348  6e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.820751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2285  cytochrome c, class I  53.94 
 
 		 346 aa  345  5e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00711214  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1666  cytochrome c class I  53.05 
 
 		 344 aa  336  3.9999999999999995e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.185876  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2437  diheme cytochrome c SoxD  47.35 
 
 		 355 aa  331  1e-89  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3912  hypothetical protein  39.49 
 
 		 211 aa  138  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.411473 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4162  putative sulfite oxidase cytochrome subunit (SoxD)  44.65 
 
 		 225 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4367  cytochrome c, class I  39.09 
 
 		 243 aa  133  5e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1517  putative cytochrome  39.3 
 
 		 260 aa  132  6.999999999999999e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.936874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2801  cytochrome c  33.96 
 
 		 342 aa  132  6.999999999999999e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.26281 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4956  putative sulfite oxidase cytochrome subunit (SoxD)  37.56 
 
 		 251 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3677  putative sulfite oxidase cytochrome subunit (SoxD)  38.78 
 
 		 252 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.699117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0147  cytochrome c, class I  37.5 
 
 		 222 aa  129  8.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3665  cytochrome c, class I  42.14 
 
 		 194 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.514371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3340  cytochrome c, class I  42.14 
 
 		 194 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.147633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4251  putative cytochrome  35.47 
 
 		 242 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.460774  normal  0.218955 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1239  cytochrome c, class I  42.7 
 
 		 174 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6593  cytochrome c, class I  42.7 
 
 		 174 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.263002 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1895  putative cytochrome c  41.67 
 
 		 181 aa  123  5e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2196  cytochrome c, class I  67.06 
 
 		 106 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.252301  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8678  cytochrome c class I  43.4 
 
 		 185 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00176651  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7231  cytochrome c class I  40.51 
 
 		 200 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.77975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3042  cytochrome c, class I  36.82 
 
 		 259 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.909018  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4887  putative cytochrome c region protein  43.67 
 
 		 179 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.362181 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0152  putative sulfite oxidase cytochrome subunit  41.14 
 
 		 195 aa  119  7e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4156  cytochrome c, class I  37.63 
 
 		 382 aa  119  7.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.1533  normal  0.864347 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6197  cytochrome c class I  44.37 
 
 		 174 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2167  putative sulfite oxidase cytochrome c subunit, SoxD  42.41 
 
 		 180 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2059  diheme cytochrome c SoxD  27.73 
 
 		 382 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173988  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2726  cytochrome C transmembrane protein  55.95 
 
 		 106 aa  106  7e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5874  cytochrome c class I  37.64 
 
 		 180 aa  104  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.362058  normal  0.18158 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3424  cytochrome c, class I  55.7 
 
 		 108 aa  102  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0342  cytochrome c, class I  55.26 
 
 		 108 aa  100  5e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.16869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3256  cytochrome c, class I  53.16 
 
 		 108 aa  98.6  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0912  putative sulfite oxidase cytochrome subunit  36.65 
 
 		 202 aa  99  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.68088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2879  cytochrome c, class I  56.41 
 
 		 106 aa  97.8  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.578668 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2099  cytochrome c class I  52.63 
 
 		 110 aa  97.4  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2087  putative sulfite oxidase cytochrome subunit  37.82 
 
 		 180 aa  97.8  3e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.829458 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2493  cytochrome c class I  52.63 
 
 		 110 aa  97.1  4e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.291916  normal  0.0913133 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0341  putative cytochrome c, class I precursor  35.96 
 
 		 186 aa  96.7  5e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2050  cytochrome c, class I  55.84 
 
 		 105 aa  96.7  5e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0434258 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3458  cytochrome c class I  48.75 
 
 		 115 aa  96.3  8e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3130  cytochrome c class I  48.75 
 
 		 115 aa  96.3  8e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1616  cytochrome c class I  37.11 
 
 		 171 aa  94.7  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.986895 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1488  cytochrome c class I  57.5 
 
 		 101 aa  94.7  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.02284 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1037  cytochrome c class I  50.6 
 
 		 96 aa  93.6  5e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.692369 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0200  cytochrome c class I  46.25 
 
 		 123 aa  93.2  6e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.566136  unclonable  0.00000000000521394 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0205  cytochrome c, class I  46.51 
 
 		 119 aa  92.8  7e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3260  cytochrome C transmembrane protein  47.37 
 
 		 141 aa  92.8  8e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.812906 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1783  cytochrome c, class I  43.01 
 
 		 106 aa  92.4  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.434687  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0219  cytochrome c class I  46.51 
 
 		 119 aa  92  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00518209 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2749  cytochrome c class I  46.24 
 
 		 102 aa  92  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.210292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4310  putative cytochrome c, class I  45.05 
 
 		 118 aa  91.3  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0038  cytochrome c family protein  45 
 
 		 228 aa  90.9  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3394  cytochrome c, class I  45.35 
 
 		 120 aa  90.9  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2813  cytochrome c, class I  45.35 
 
 		 117 aa  90.9  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.250545  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0293  cytochrome c, class I  45.35 
 
 		 117 aa  90.9  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0274  cytochrome c class I  45.35 
 
 		 117 aa  90.9  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544484 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3728  cytochrome c class I  53.33 
 
 		 102 aa  90.9  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3211  putative sulfite oxidase cytochrome subunit  29.02 
 
 		 206 aa  90.5  4e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0586  hypothetical protein  30.05 
 
 		 239 aa  90.5  4e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.649014  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0344  cytochrome c, class I  50 
 
 		 102 aa  90.1  5e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0270928  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0021  cytochrome c family protein  45 
 
 		 121 aa  90.1  5e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.042023  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1745  cytochrome c family protein  45 
 
 		 121 aa  90.1  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3816  cytochrome c family protein  45 
 
 		 121 aa  90.1  5e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.338903  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3897  cytochrome c family protein  45 
 
 		 121 aa  90.1  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3179  cytochrome c family protein  45 
 
 		 121 aa  90.1  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0692  cytochrome c, class I  51.32 
 
 		 104 aa  89.7  6e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.926342 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2798  cytochrome c family protein  45 
 
 		 111 aa  89.4  9e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.023573  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3145  cytochrome c family protein  43.96 
 
 		 111 aa  88.6  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1504  cytochrome c, class I  50 
 
 		 101 aa  88.6  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.125489 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0304  cytochrome c, class I  51.32 
 
 		 101 aa  88.2  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.45467e-21  normal  0.0822288 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3321  cytochrome c, class I  52.63 
 
 		 102 aa  87.8  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.344703  hitchhiker  0.0021347 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4892  sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit B  48.15 
 
 		 218 aa  87.8  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0474093 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0619  cytochrome c-551 precursor  52.11 
 
 		 104 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0560  sulfite oxidase cytochrome subunit  31.32 
 
 		 209 aa  88.2  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.876942 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06740  cytochrome c-551 precursor  50 
 
 		 104 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2734  cytochrome c class I  36.24 
 
 		 200 aa  88.2  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.207547  hitchhiker  0.0000919605 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1094  cytochrome c, class I  32.79 
 
 		 188 aa  87.4  3e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2987  cytochrome c, class I  30.73 
 
 		 188 aa  86.7  6e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.29363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0985  cytochrome c class I  48.68 
 
 		 101 aa  86.3  8e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1069  cytochrome c, class I  48.68 
 
 		 101 aa  86.3  8e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2468  cytochrome c, class I  43.59 
 
 		 115 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.202233  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3220  cytochrome c, class I  48.05 
 
 		 101 aa  85.5  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.294896  normal  0.453437 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0408  cytochrome c class I  42.31 
 
 		 116 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00360  Cytochrome c-551  51.32 
 
 		 104 aa  84.7  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.66895  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0126  cytochrome c class I  43.75 
 
 		 115 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3888  cytochrome c class I  45 
 
 		 95 aa  81.6  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.148772  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2405  cytochrome c family protein  45.45 
 
 		 105 aa  80.9  0.00000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2528  cytochrome c class I  44.16 
 
 		 101 aa  80.9  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5897  cytochrome c class I  46.67 
 
 		 93 aa  80.9  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.106259  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0037  cytochrome c, class I  38.1 
 
 		 117 aa  79.7  0.00000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000534033  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3082  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorB  44.29 
 
 		 208 aa  79.3  0.00000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.299915  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3171  cytochrome c, class I  44.16 
 
 		 101 aa  79  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0722  Crp/FNR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 800 aa  77.4  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1386  cytochrome c551/c552-like protein  46.05 
 
 		 118 aa  77.8  0.0000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.660069  normal  0.798955 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>