69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3912 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3912  hypothetical protein  100 
 
 		 211 aa  433  1e-121  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.411473 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2801  cytochrome c  66.51 
 
 		 342 aa  291  4e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.26281 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1517  putative cytochrome  63.74 
 
 		 260 aa  249  1e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.936874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4156  cytochrome c, class I  60 
 
 		 382 aa  244  6e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.1533  normal  0.864347 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4162  putative sulfite oxidase cytochrome subunit (SoxD)  56.7 
 
 		 225 aa  238  5e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4956  putative sulfite oxidase cytochrome subunit (SoxD)  55.38 
 
 		 251 aa  224  8e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3677  putative sulfite oxidase cytochrome subunit (SoxD)  54.12 
 
 		 252 aa  223  2e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.699117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4251  putative cytochrome  55.98 
 
 		 242 aa  221  6e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.460774  normal  0.218955 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4367  cytochrome c, class I  53.61 
 
 		 243 aa  219  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0147  cytochrome c, class I  49.7 
 
 		 222 aa  176  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3042  cytochrome c, class I  44.92 
 
 		 259 aa  168  7e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.909018  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3665  cytochrome c, class I  53.9 
 
 		 194 aa  166  2e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.514371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3340  cytochrome c, class I  52.6 
 
 		 194 aa  161  6e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.147633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4887  putative cytochrome c region protein  49.08 
 
 		 179 aa  160  9e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.362181 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1895  putative cytochrome c  50.7 
 
 		 181 aa  154  8e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0152  putative sulfite oxidase cytochrome subunit  48.3 
 
 		 195 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7231  cytochrome c class I  48.2 
 
 		 200 aa  150  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.77975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2167  putative sulfite oxidase cytochrome c subunit, SoxD  48.98 
 
 		 180 aa  149  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0802  cytochrome c, class I  42.63 
 
 		 360 aa  147  9e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.641735  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3133  cytochrome c, class I  38.57 
 
 		 348 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.460697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2059  diheme cytochrome c SoxD  42.06 
 
 		 382 aa  145  3e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173988  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8678  cytochrome c class I  48.98 
 
 		 185 aa  142  3e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00176651  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1239  cytochrome c, class I  43.53 
 
 		 174 aa  137  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6197  cytochrome c class I  48.55 
 
 		 174 aa  137  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6593  cytochrome c, class I  43.53 
 
 		 174 aa  137  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.263002 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3257  cytochrome c, class I  39.13 
 
 		 344 aa  134  8e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.225415  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5874  cytochrome c class I  47.27 
 
 		 180 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.362058  normal  0.18158 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2630  cytochrome c, class I  38.74 
 
 		 404 aa  132  3e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.820751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2087  putative sulfite oxidase cytochrome subunit  46.53 
 
 		 180 aa  131  6.999999999999999e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.829458 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2437  diheme cytochrome c SoxD  37.16 
 
 		 355 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1590  cytochrome c class I  39.89 
 
 		 344 aa  129  3e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.960712  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2285  cytochrome c, class I  39.78 
 
 		 346 aa  124  7e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00711214  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1666  cytochrome c class I  39.25 
 
 		 344 aa  123  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.185876  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0560  sulfite oxidase cytochrome subunit  40 
 
 		 209 aa  121  6e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.876942 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3783  cytochrome c class I  36.32 
 
 		 355 aa  121  6e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2734  cytochrome c class I  42.47 
 
 		 200 aa  119  3.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.207547  hitchhiker  0.0000919605 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1094  cytochrome c, class I  45.1 
 
 		 188 aa  118  7e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1616  cytochrome c class I  41.89 
 
 		 171 aa  117  9e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.986895 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0912  putative sulfite oxidase cytochrome subunit  44.94 
 
 		 202 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.68088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3211  putative sulfite oxidase cytochrome subunit  40.65 
 
 		 206 aa  116  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0341  putative cytochrome c, class I precursor  39.66 
 
 		 186 aa  114  8.999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3444  hypothetical protein  37.13 
 
 		 182 aa  110  1.0000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.568465  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3203  Mo-co oxidoreductase dimerization domain protein  37.13 
 
 		 182 aa  110  1.0000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.595677  hitchhiker  0.0000523602 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2987  cytochrome c, class I  39.49 
 
 		 188 aa  104  9e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.29363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2868  cytochrome c class I  37.32 
 
 		 187 aa  95.5  5e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0586  hypothetical protein  29.79 
 
 		 239 aa  95.1  7e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.649014  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0157  hypothetical protein  33.9 
 
 		 331 aa  86.7  3e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000097536  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1943  c-type cytochrome  32.43 
 
 		 327 aa  53.1  0.000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2236  cytochrome c, class I  32.43 
 
 		 327 aa  52.4  0.000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.472913 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0286  OmpA/MotB  32.97 
 
 		 329 aa  47  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.251246  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0786  cytochrome c, class I  26.5 
 
 		 310 aa  47  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00021722  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03090  putative cytochrome C signal peptide protein  30.56 
 
 		 363 aa  46.6  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.649207  normal  0.393052 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0259  cytochrome c class I  34.44 
 
 		 331 aa  45.8  0.0005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2492  cytochrome c, class I  32.26 
 
 		 698 aa  44.3  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00140351  normal  0.928162 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3191  cytochrome c class I  25.83 
 
 		 304 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3822  cytochrome c family protein  26.8 
 
 		 304 aa  43.1  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.445859  normal  0.312064 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1948  cytochrome c, class I  26.8 
 
 		 304 aa  43.1  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.510162  normal  0.709424 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4075  putative cytochrome c precursor  39.22 
 
 		 468 aa  42.7  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.635845  normal  0.598856 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1569  helix-turn-helix, AraC type  27.91 
 
 		 1113 aa  42.7  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3545  cytochrome c family protein  29.13 
 
 		 372 aa  42.7  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7193  cytochrome c class I  32.56 
 
 		 409 aa  42.7  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.99524  normal  0.500209 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3537  cytochrome c class I  25.51 
 
 		 304 aa  42.7  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.429309  normal  0.0523965 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2105  cytochrome c, class I  25.58 
 
 		 315 aa  42.4  0.005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0625  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  39.22 
 
 		 461 aa  42.4  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.956199  normal  0.273824 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2757  hypothetical protein  24.2 
 
 		 291 aa  42.4  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0570414  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1587  cytochrome c, class I  39.47 
 
 		 220 aa  42  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0500716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1184  cytochrome c, class I  29.9 
 
 		 337 aa  42.4  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2656  cytochrome c, class I  32.5 
 
 		 213 aa  41.6  0.008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.964453  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1873  putative cytochrome c  44.12 
 
 		 102 aa  41.6  0.009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.490249  normal  0.677809 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>