80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2167 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2167  putative sulfite oxidase cytochrome c subunit, SoxD  100 
 
 		 180 aa  361  3e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0152  putative sulfite oxidase cytochrome subunit  82.35 
 
 		 195 aa  287  7e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7231  cytochrome c class I  68.82 
 
 		 200 aa  259  1e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.77975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6593  cytochrome c, class I  72.9 
 
 		 174 aa  218  3e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.263002 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1239  cytochrome c, class I  72.9 
 
 		 174 aa  218  3e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6197  cytochrome c class I  74.15 
 
 		 174 aa  211  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3665  cytochrome c, class I  66.67 
 
 		 194 aa  211  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.514371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3340  cytochrome c, class I  65.99 
 
 		 194 aa  208  4e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.147633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8678  cytochrome c class I  64.47 
 
 		 185 aa  207  5e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00176651  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4887  putative cytochrome c region protein  58.68 
 
 		 179 aa  203  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.362181 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1895  putative cytochrome c  63.09 
 
 		 181 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5874  cytochrome c class I  58.05 
 
 		 180 aa  190  9e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.362058  normal  0.18158 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3042  cytochrome c, class I  56.95 
 
 		 259 aa  168  4e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.909018  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1517  putative cytochrome  51.02 
 
 		 260 aa  164  6.9999999999999995e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.936874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2087  putative sulfite oxidase cytochrome subunit  52.11 
 
 		 180 aa  160  7e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.829458 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0147  cytochrome c, class I  55.03 
 
 		 222 aa  158  3e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3677  putative sulfite oxidase cytochrome subunit (SoxD)  47.74 
 
 		 252 aa  154  8e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.699117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3912  hypothetical protein  50 
 
 		 211 aa  150  8e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.411473 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4956  putative sulfite oxidase cytochrome subunit (SoxD)  47.3 
 
 		 251 aa  149  2e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3211  putative sulfite oxidase cytochrome subunit  46.1 
 
 		 206 aa  149  2e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4162  putative sulfite oxidase cytochrome subunit (SoxD)  47.65 
 
 		 225 aa  148  4e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2734  cytochrome c class I  53.64 
 
 		 200 aa  147  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.207547  hitchhiker  0.0000919605 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4251  putative cytochrome  48.65 
 
 		 242 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.460774  normal  0.218955 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1616  cytochrome c class I  50 
 
 		 171 aa  145  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.986895 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1094  cytochrome c, class I  48.03 
 
 		 188 aa  145  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2801  cytochrome c  47.62 
 
 		 342 aa  144  5e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.26281 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4156  cytochrome c, class I  46.1 
 
 		 382 aa  143  2e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.1533  normal  0.864347 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0560  sulfite oxidase cytochrome subunit  47.02 
 
 		 209 aa  141  6e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.876942 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4367  cytochrome c, class I  49.65 
 
 		 243 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0341  putative cytochrome c, class I precursor  46.71 
 
 		 186 aa  138  3.9999999999999997e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3444  hypothetical protein  46.71 
 
 		 182 aa  135  2e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.568465  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3203  Mo-co oxidoreductase dimerization domain protein  46.71 
 
 		 182 aa  135  2e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.595677  hitchhiker  0.0000523602 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2987  cytochrome c, class I  47.22 
 
 		 188 aa  135  3.0000000000000003e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.29363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2868  cytochrome c class I  45.03 
 
 		 187 aa  133  9.999999999999999e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0912  putative sulfite oxidase cytochrome subunit  56.76 
 
 		 202 aa  131  5e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.68088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2059  diheme cytochrome c SoxD  44.16 
 
 		 382 aa  126  1.0000000000000001e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173988  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2437  diheme cytochrome c SoxD  43.01 
 
 		 355 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3257  cytochrome c, class I  45.22 
 
 		 344 aa  123  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.225415  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3133  cytochrome c, class I  39.34 
 
 		 348 aa  120  9.999999999999999e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.460697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1590  cytochrome c class I  44.52 
 
 		 344 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.960712  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2285  cytochrome c, class I  44.52 
 
 		 346 aa  118  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00711214  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1666  cytochrome c class I  44.74 
 
 		 344 aa  116  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.185876  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3783  cytochrome c class I  43.04 
 
 		 355 aa  114  7.999999999999999e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0802  cytochrome c, class I  36.7 
 
 		 360 aa  114  1.0000000000000001e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.641735  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2630  cytochrome c, class I  40.76 
 
 		 404 aa  109  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.820751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0157  hypothetical protein  35.26 
 
 		 331 aa  97.1  1e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000097536  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0586  hypothetical protein  34.18 
 
 		 239 aa  93.6  1e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.649014  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1569  cytochrome c, class I  36.79 
 
 		 141 aa  59.3  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.832933  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1149  Pyrrolo-quinoline quinone  33.33 
 
 		 678 aa  55.8  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.261687  normal  0.842615 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2891  cytochrome c, class I  33.33 
 
 		 201 aa  50.4  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5154  extracellular solute-binding protein  29.69 
 
 		 401 aa  49.3  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7193  cytochrome c class I  32.69 
 
 		 409 aa  48.5  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.99524  normal  0.500209 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3241  extracellular solute-binding protein  29.69 
 
 		 415 aa  48.1  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0294244  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5127  extracellular solute-binding protein  29.69 
 
 		 415 aa  48.1  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.600349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1739  cytochrome c, class I  36.96 
 
 		 146 aa  47  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32540  hypothetical protein  30.89 
 
 		 293 aa  47  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.277482 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2757  hypothetical protein  29.84 
 
 		 291 aa  44.7  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0570414  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0317  cytochrome c, class I  29.66 
 
 		 285 aa  44.7  0.0007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00320646 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0656  cytochrome c, class I  63.33 
 
 		 283 aa  44.7  0.0008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.93712 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5973  cytochrome c class I  31.16 
 
 		 412 aa  44.3  0.0009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0365316 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3472  hypothetical protein  29.25 
 
 		 131 aa  44.3  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0683  cytochrome c class I  45.83 
 
 		 381 aa  43.5  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5894  cytochrome c class I  32.29 
 
 		 421 aa  43.1  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.18364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4236  cytochrome c class I  30.28 
 
 		 343 aa  42.4  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00185461  normal  0.468789 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3576  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  55.88 
 
 		 326 aa  42.4  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5764  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  34.83 
 
 		 447 aa  42  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.729406  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3822  cytochrome c family protein  27.03 
 
 		 304 aa  41.6  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.445859  normal  0.312064 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3537  cytochrome c class I  27.5 
 
 		 304 aa  42  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.429309  normal  0.0523965 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0698  cytochrome c class I  29.57 
 
 		 189 aa  42  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1948  cytochrome c, class I  27.27 
 
 		 304 aa  41.6  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.510162  normal  0.709424 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4253  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  55.88 
 
 		 313 aa  41.6  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.49464  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4258  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  55.88 
 
 		 325 aa  41.6  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.816603 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2236  cytochrome c, class I  27.36 
 
 		 327 aa  41.6  0.006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.472913 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3572  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  55.88 
 
 		 313 aa  41.6  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1601  cytochrome c, class I  31.73 
 
 		 125 aa  41.2  0.008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.402085 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0307  putative cytochrome c  31.25 
 
 		 410 aa  41.2  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0124667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6161  cytochrome c, class I  30.85 
 
 		 424 aa  41.2  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.969705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2583  cytochrome c class I  32.08 
 
 		 407 aa  41.2  0.009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.333903  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0942  cytochrome c class I  51.72 
 
 		 329 aa  40.8  0.01  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.240089 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1360  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  48.84 
 
 		 308 aa  40.8  0.01  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.240618 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>