76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_1239 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008060  Bcen_1239  cytochrome c, class I  100 
 
 		 174 aa  348  3e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6593  cytochrome c, class I  100 
 
 		 174 aa  348  3e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.263002 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6197  cytochrome c class I  95.98 
 
 		 174 aa  296  1e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0152  putative sulfite oxidase cytochrome subunit  73.38 
 
 		 195 aa  235  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7231  cytochrome c class I  64.8 
 
 		 200 aa  234  3e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.77975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2167  putative sulfite oxidase cytochrome c subunit, SoxD  72.9 
 
 		 180 aa  233  1.0000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8678  cytochrome c class I  69.74 
 
 		 185 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00176651  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3665  cytochrome c, class I  68.46 
 
 		 194 aa  217  7.999999999999999e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.514371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3340  cytochrome c, class I  67.11 
 
 		 194 aa  211  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.147633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1895  putative cytochrome c  67.53 
 
 		 181 aa  210  7e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5874  cytochrome c class I  65.85 
 
 		 180 aa  197  5e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.362058  normal  0.18158 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4887  putative cytochrome c region protein  62.59 
 
 		 179 aa  193  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.362181 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3042  cytochrome c, class I  59.6 
 
 		 259 aa  179  1e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.909018  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2087  putative sulfite oxidase cytochrome subunit  56.34 
 
 		 180 aa  170  1e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.829458 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0147  cytochrome c, class I  55.26 
 
 		 222 aa  161  3e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4956  putative sulfite oxidase cytochrome subunit (SoxD)  51.33 
 
 		 251 aa  160  9e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2801  cytochrome c  49.08 
 
 		 342 aa  160  1e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.26281 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3677  putative sulfite oxidase cytochrome subunit (SoxD)  52.67 
 
 		 252 aa  158  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.699117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1616  cytochrome c class I  52 
 
 		 171 aa  157  9e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.986895 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3211  putative sulfite oxidase cytochrome subunit  46.75 
 
 		 206 aa  156  1e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1517  putative cytochrome  48.98 
 
 		 260 aa  154  6e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.936874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0560  sulfite oxidase cytochrome subunit  49.04 
 
 		 209 aa  154  8e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.876942 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1094  cytochrome c, class I  50.65 
 
 		 188 aa  152  2e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4251  putative cytochrome  50 
 
 		 242 aa  152  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.460774  normal  0.218955 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4162  putative sulfite oxidase cytochrome subunit (SoxD)  49.33 
 
 		 225 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4156  cytochrome c, class I  48 
 
 		 382 aa  150  8e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.1533  normal  0.864347 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0912  putative sulfite oxidase cytochrome subunit  56.14 
 
 		 202 aa  149  2e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.68088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4367  cytochrome c, class I  50 
 
 		 243 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3912  hypothetical protein  47.86 
 
 		 211 aa  145  3e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.411473 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2987  cytochrome c, class I  45.25 
 
 		 188 aa  143  2e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.29363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2734  cytochrome c class I  51.3 
 
 		 200 aa  141  4e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.207547  hitchhiker  0.0000919605 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0341  putative cytochrome c, class I precursor  43.79 
 
 		 186 aa  140  8e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2868  cytochrome c class I  44.38 
 
 		 187 aa  134  5e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2437  diheme cytochrome c SoxD  46.02 
 
 		 355 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3133  cytochrome c, class I  43.26 
 
 		 348 aa  134  7.000000000000001e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.460697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3257  cytochrome c, class I  46.5 
 
 		 344 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.225415  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1590  cytochrome c class I  47.13 
 
 		 344 aa  129  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.960712  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2059  diheme cytochrome c SoxD  41.62 
 
 		 382 aa  129  3e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173988  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3203  Mo-co oxidoreductase dimerization domain protein  43.23 
 
 		 182 aa  125  3e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.595677  hitchhiker  0.0000523602 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3444  hypothetical protein  43.23 
 
 		 182 aa  125  3e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.568465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2285  cytochrome c, class I  44.87 
 
 		 346 aa  123  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00711214  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1666  cytochrome c class I  45.75 
 
 		 344 aa  122  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.185876  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3783  cytochrome c class I  44.38 
 
 		 355 aa  122  2e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2630  cytochrome c, class I  42.17 
 
 		 404 aa  120  8e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.820751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0802  cytochrome c, class I  41.4 
 
 		 360 aa  120  9.999999999999999e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.641735  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0586  hypothetical protein  38.36 
 
 		 239 aa  106  1e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.649014  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0157  hypothetical protein  36.84 
 
 		 331 aa  96.7  1e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000097536  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1149  Pyrrolo-quinoline quinone  38.38 
 
 		 678 aa  56.2  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.261687  normal  0.842615 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1569  cytochrome c, class I  31.15 
 
 		 141 aa  53.9  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.832933  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2891  cytochrome c, class I  33.33 
 
 		 201 aa  50.8  0.000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1943  c-type cytochrome  29.01 
 
 		 327 aa  48.1  0.00006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1739  cytochrome c, class I  36.78 
 
 		 146 aa  47  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2757  hypothetical protein  30.4 
 
 		 291 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0570414  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32540  hypothetical protein  28.8 
 
 		 293 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.277482 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5154  extracellular solute-binding protein  27.97 
 
 		 401 aa  45.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1827  cytochrome c class I  32.76 
 
 		 280 aa  44.3  0.0008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2236  cytochrome c, class I  28.33 
 
 		 327 aa  44.3  0.0008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.472913 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3537  cytochrome c class I  28.47 
 
 		 304 aa  43.9  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.429309  normal  0.0523965 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1948  cytochrome c, class I  29.06 
 
 		 304 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.510162  normal  0.709424 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5322  cytochrome c class I  29.7 
 
 		 346 aa  43.1  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0021785  normal  0.0885214 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4075  putative cytochrome c precursor  32.74 
 
 		 468 aa  43.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.635845  normal  0.598856 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3822  cytochrome c family protein  29.06 
 
 		 304 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.445859  normal  0.312064 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3241  extracellular solute-binding protein  28.18 
 
 		 415 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0294244  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7193  cytochrome c class I  26.92 
 
 		 409 aa  43.5  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.99524  normal  0.500209 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5127  extracellular solute-binding protein  28.18 
 
 		 415 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.600349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3191  cytochrome c class I  28.47 
 
 		 304 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1810  cytochrome c class I  34.07 
 
 		 294 aa  42.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.780394  normal  0.101949 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0226  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  31.67 
 
 		 467 aa  42.4  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2187  hypothetical protein  41.03 
 
 		 515 aa  42  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0625  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  31.97 
 
 		 461 aa  42  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.956199  normal  0.273824 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3842  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  28.17 
 
 		 436 aa  42  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4236  cytochrome c class I  30.3 
 
 		 343 aa  42.4  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00185461  normal  0.468789 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0786  cytochrome c, class I  32.14 
 
 		 310 aa  41.6  0.006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00021722  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1402  hypothetical protein  32.41 
 
 		 170 aa  41.2  0.007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.781476  normal  0.402158 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5894  cytochrome c class I  27 
 
 		 421 aa  41.2  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.18364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6161  cytochrome c, class I  27.37 
 
 		 424 aa  40.8  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.969705  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>