177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A3257 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A3257  cytochrome c, class I  100 
 
 		 344 aa  704    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.225415  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3133  cytochrome c, class I  52.56 
 
 		 348 aa  385  1e-106  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.460697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0802  cytochrome c, class I  51.26 
 
 		 360 aa  388  1e-106  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.641735  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3783  cytochrome c class I  56.52 
 
 		 355 aa  372  1e-102  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1590  cytochrome c class I  56.78 
 
 		 344 aa  353  2.9999999999999997e-96  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.960712  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2285  cytochrome c, class I  56.78 
 
 		 346 aa  352  7e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00711214  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1666  cytochrome c class I  55.87 
 
 		 344 aa  348  5e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.185876  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2630  cytochrome c, class I  51.19 
 
 		 404 aa  345  6e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.820751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2437  diheme cytochrome c SoxD  50.42 
 
 		 355 aa  335  7.999999999999999e-91  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3677  putative sulfite oxidase cytochrome subunit (SoxD)  38.78 
 
 		 252 aa  139  4.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.699117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3042  cytochrome c, class I  40.31 
 
 		 259 aa  137  2e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.909018  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3912  hypothetical protein  39.13 
 
 		 211 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.411473 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2801  cytochrome c  32.68 
 
 		 342 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.26281 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4956  putative sulfite oxidase cytochrome subunit (SoxD)  37.5 
 
 		 251 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1895  putative cytochrome c  44.51 
 
 		 181 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8678  cytochrome c class I  40.78 
 
 		 185 aa  130  3e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00176651  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4367  cytochrome c, class I  37.44 
 
 		 243 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4887  putative cytochrome c region protein  45.45 
 
 		 179 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.362181 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1517  putative cytochrome  36.46 
 
 		 260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.936874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0147  cytochrome c, class I  40.45 
 
 		 222 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4251  putative cytochrome  36.92 
 
 		 242 aa  126  5e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.460774  normal  0.218955 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4162  putative sulfite oxidase cytochrome subunit (SoxD)  36.32 
 
 		 225 aa  126  5e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3665  cytochrome c, class I  41.4 
 
 		 194 aa  126  7e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.514371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1239  cytochrome c, class I  44.77 
 
 		 174 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6593  cytochrome c, class I  44.77 
 
 		 174 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.263002 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4156  cytochrome c, class I  36.51 
 
 		 382 aa  124  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.1533  normal  0.864347 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7231  cytochrome c class I  42.64 
 
 		 200 aa  125  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.77975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2167  putative sulfite oxidase cytochrome c subunit, SoxD  44.58 
 
 		 180 aa  123  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0152  putative sulfite oxidase cytochrome subunit  42.05 
 
 		 195 aa  123  5e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3340  cytochrome c, class I  40.76 
 
 		 194 aa  122  8e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.147633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5874  cytochrome c class I  40.62 
 
 		 180 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.362058  normal  0.18158 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6197  cytochrome c class I  47.33 
 
 		 174 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0912  putative sulfite oxidase cytochrome subunit  43.58 
 
 		 202 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.68088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3211  putative sulfite oxidase cytochrome subunit  33.49 
 
 		 206 aa  113  5e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0586  hypothetical protein  37.36 
 
 		 239 aa  108  2e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.649014  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1616  cytochrome c class I  40.72 
 
 		 171 aa  103  4e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.986895 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2059  diheme cytochrome c SoxD  31.32 
 
 		 382 aa  102  1e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173988  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0341  putative cytochrome c, class I precursor  38.6 
 
 		 186 aa  102  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3728  cytochrome c class I  49.44 
 
 		 102 aa  99.4  9e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3394  cytochrome c, class I  51.16 
 
 		 120 aa  98.2  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4892  sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit B  51.28 
 
 		 218 aa  97.8  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0474093 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2813  cytochrome c, class I  50.59 
 
 		 117 aa  97.1  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.250545  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0274  cytochrome c class I  50.59 
 
 		 117 aa  97.1  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544484 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0293  cytochrome c, class I  50.59 
 
 		 117 aa  97.1  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0205  cytochrome c, class I  50.6 
 
 		 119 aa  95.9  9e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0408  cytochrome c class I  48.15 
 
 		 116 aa  95.5  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2749  cytochrome c class I  47.78 
 
 		 102 aa  95.5  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.210292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0219  cytochrome c class I  49.4 
 
 		 119 aa  94.7  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00518209 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4310  putative cytochrome c, class I  50.55 
 
 		 118 aa  94.7  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0200  cytochrome c class I  50 
 
 		 123 aa  94.7  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.566136  unclonable  0.00000000000521394 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3458  cytochrome c class I  48 
 
 		 115 aa  93.2  5e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3130  cytochrome c class I  48 
 
 		 115 aa  93.2  5e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2726  cytochrome C transmembrane protein  48.72 
 
 		 106 aa  93.2  6e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2087  putative sulfite oxidase cytochrome subunit  34.15 
 
 		 180 aa  93.2  6e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.829458 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3082  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorB  50.67 
 
 		 208 aa  92.8  9e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.299915  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3260  cytochrome C transmembrane protein  50 
 
 		 141 aa  92  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.812906 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2879  cytochrome c, class I  46 
 
 		 106 aa  92  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.578668 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0021  cytochrome c family protein  48.72 
 
 		 121 aa  92  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.042023  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1745  cytochrome c family protein  48.72 
 
 		 121 aa  92  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3816  cytochrome c family protein  48.72 
 
 		 121 aa  92  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.338903  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3897  cytochrome c family protein  48.72 
 
 		 121 aa  92  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3179  cytochrome c family protein  48.72 
 
 		 121 aa  92  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2798  cytochrome c family protein  48.72 
 
 		 111 aa  91.3  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.023573  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0038  cytochrome c family protein  48.72 
 
 		 228 aa  91.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2196  cytochrome c, class I  55.07 
 
 		 106 aa  91.7  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.252301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1094  cytochrome c, class I  34.73 
 
 		 188 aa  91.3  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0560  sulfite oxidase cytochrome subunit  35.29 
 
 		 209 aa  91.3  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.876942 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2050  cytochrome c, class I  43.88 
 
 		 105 aa  90.5  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0434258 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0126  cytochrome c class I  55.07 
 
 		 115 aa  90.9  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2987  cytochrome c, class I  33.33 
 
 		 188 aa  90.5  4e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.29363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3145  cytochrome c family protein  44.12 
 
 		 111 aa  90.1  5e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2099  cytochrome c class I  45.33 
 
 		 110 aa  89  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2734  cytochrome c class I  40.46 
 
 		 200 aa  88.2  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.207547  hitchhiker  0.0000919605 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0304  cytochrome c, class I  42.42 
 
 		 101 aa  88.6  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.45467e-21  normal  0.0822288 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3256  cytochrome c, class I  46.05 
 
 		 108 aa  88.2  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0692  cytochrome c, class I  44.33 
 
 		 104 aa  87.4  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.926342 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2468  cytochrome c, class I  38.74 
 
 		 115 aa  87.4  3e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.202233  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1504  cytochrome c, class I  49.32 
 
 		 101 aa  87  4e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.125489 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1386  cytochrome c551/c552-like protein  44.94 
 
 		 118 aa  87.4  4e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.660069  normal  0.798955 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1037  cytochrome c class I  49.43 
 
 		 96 aa  86.3  7e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.692369 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3321  cytochrome c, class I  47.44 
 
 		 102 aa  85.5  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.344703  hitchhiker  0.0021347 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2405  cytochrome c family protein  45.83 
 
 		 105 aa  84.3  0.000000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0342  cytochrome c, class I  55.71 
 
 		 108 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.16869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3424  cytochrome c, class I  44.74 
 
 		 108 aa  84.7  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0985  cytochrome c class I  41.67 
 
 		 101 aa  84  0.000000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1069  cytochrome c, class I  41.67 
 
 		 101 aa  84  0.000000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1006  cytochrome c, class I  39.81 
 
 		 112 aa  82.8  0.000000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2528  cytochrome c class I  40.23 
 
 		 101 aa  82  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2493  cytochrome c class I  40.26 
 
 		 110 aa  82  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.291916  normal  0.0913133 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3220  cytochrome c, class I  39 
 
 		 101 aa  80.5  0.00000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.294896  normal  0.453437 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00360  Cytochrome c-551  40.22 
 
 		 104 aa  80.1  0.00000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.66895  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2792  cytochrome c, class I  35.05 
 
 		 249 aa  79.7  0.00000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.52873  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1488  cytochrome c class I  44.19 
 
 		 101 aa  79.3  0.00000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.02284 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3648  cytochrome c class I  35.64 
 
 		 135 aa  79.3  0.00000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0037  cytochrome c, class I  38.67 
 
 		 117 aa  79.3  0.00000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000534033  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06740  cytochrome c-551 precursor  44.44 
 
 		 104 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0619  cytochrome c-551 precursor  44.44 
 
 		 104 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0826  cytochrome c subfamily protein  43.21 
 
 		 107 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1852  cytochrome c, class I  40 
 
 		 108 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2463  cytochrome c, class I  40 
 
 		 108 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>