67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2087 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2087  putative sulfite oxidase cytochrome subunit  100 
 
 		 180 aa  356  8e-98  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.829458 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3665  cytochrome c, class I  55.84 
 
 		 194 aa  171  5.999999999999999e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.514371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3340  cytochrome c, class I  55.84 
 
 		 194 aa  170  1e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.147633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0152  putative sulfite oxidase cytochrome subunit  55.63 
 
 		 195 aa  169  3e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4887  putative cytochrome c region protein  52.29 
 
 		 179 aa  164  5e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.362181 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7231  cytochrome c class I  51.77 
 
 		 200 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.77975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2167  putative sulfite oxidase cytochrome c subunit, SoxD  52.11 
 
 		 180 aa  160  9e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6593  cytochrome c, class I  52.02 
 
 		 174 aa  160  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.263002 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1239  cytochrome c, class I  52.02 
 
 		 174 aa  160  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5874  cytochrome c class I  50.6 
 
 		 180 aa  157  8e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.362058  normal  0.18158 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1895  putative cytochrome c  51.41 
 
 		 181 aa  157  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6197  cytochrome c class I  56.43 
 
 		 174 aa  155  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8678  cytochrome c class I  49.3 
 
 		 185 aa  150  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00176651  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4162  putative sulfite oxidase cytochrome subunit (SoxD)  49.67 
 
 		 225 aa  149  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4956  putative sulfite oxidase cytochrome subunit (SoxD)  50.35 
 
 		 251 aa  145  3e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1094  cytochrome c, class I  45.29 
 
 		 188 aa  144  5e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3677  putative sulfite oxidase cytochrome subunit (SoxD)  46.2 
 
 		 252 aa  143  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.699117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1616  cytochrome c class I  46.11 
 
 		 171 aa  141  5e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.986895 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3042  cytochrome c, class I  49.64 
 
 		 259 aa  139  1.9999999999999998e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.909018  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4251  putative cytochrome  48.98 
 
 		 242 aa  139  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.460774  normal  0.218955 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2868  cytochrome c class I  46.15 
 
 		 187 aa  139  3e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2734  cytochrome c class I  50 
 
 		 200 aa  137  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.207547  hitchhiker  0.0000919605 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0341  putative cytochrome c, class I precursor  46.58 
 
 		 186 aa  133  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2801  cytochrome c  44.52 
 
 		 342 aa  134  9.999999999999999e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.26281 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4367  cytochrome c, class I  47.55 
 
 		 243 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1517  putative cytochrome  45.89 
 
 		 260 aa  132  3e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.936874  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3444  hypothetical protein  46.85 
 
 		 182 aa  130  6.999999999999999e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.568465  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3203  Mo-co oxidoreductase dimerization domain protein  46.85 
 
 		 182 aa  130  6.999999999999999e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.595677  hitchhiker  0.0000523602 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0560  sulfite oxidase cytochrome subunit  45.52 
 
 		 209 aa  130  1.0000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.876942 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3912  hypothetical protein  46.15 
 
 		 211 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.411473 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4156  cytochrome c, class I  43.66 
 
 		 382 aa  127  7.000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.1533  normal  0.864347 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0147  cytochrome c, class I  46.9 
 
 		 222 aa  127  7.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2987  cytochrome c, class I  41.61 
 
 		 188 aa  125  4.0000000000000003e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.29363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3211  putative sulfite oxidase cytochrome subunit  38.46 
 
 		 206 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2059  diheme cytochrome c SoxD  36.9 
 
 		 382 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173988  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3133  cytochrome c, class I  35.23 
 
 		 348 aa  101  7e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.460697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2437  diheme cytochrome c SoxD  35.71 
 
 		 355 aa  97.1  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3257  cytochrome c, class I  33.51 
 
 		 344 aa  95.9  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.225415  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0912  putative sulfite oxidase cytochrome subunit  45.07 
 
 		 202 aa  95.1  4e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.68088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3783  cytochrome c class I  35.9 
 
 		 355 aa  95.1  4e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2630  cytochrome c, class I  31.41 
 
 		 404 aa  95.5  4e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.820751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0586  hypothetical protein  31.21 
 
 		 239 aa  90.5  1e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.649014  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1590  cytochrome c class I  35.9 
 
 		 344 aa  87.8  8e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.960712  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2285  cytochrome c, class I  36.36 
 
 		 346 aa  85.9  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00711214  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0802  cytochrome c, class I  29.05 
 
 		 360 aa  84.3  8e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.641735  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0157  hypothetical protein  38.4 
 
 		 331 aa  82.8  0.000000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000097536  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1666  cytochrome c class I  35.06 
 
 		 344 aa  83.6  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.185876  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7193  cytochrome c class I  30.3 
 
 		 409 aa  47.4  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.99524  normal  0.500209 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1360  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  33.33 
 
 		 308 aa  46.2  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.240618 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1569  cytochrome c, class I  30.19 
 
 		 141 aa  45.4  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.832933  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5154  extracellular solute-binding protein  27.12 
 
 		 401 aa  45.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5894  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 421 aa  44.7  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.18364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3241  extracellular solute-binding protein  28.44 
 
 		 415 aa  44.3  0.0009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0294244  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5127  extracellular solute-binding protein  28.44 
 
 		 415 aa  44.3  0.0009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.600349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2798  cytochrome c, class I  32.18 
 
 		 410 aa  43.5  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.228923  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0456  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  36.56 
 
 		 312 aa  43.9  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.844005  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2891  cytochrome c, class I  31.82 
 
 		 201 aa  43.1  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0307  putative cytochrome c  30.56 
 
 		 410 aa  43.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0124667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2419  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  31.19 
 
 		 298 aa  43.1  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.203271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5973  cytochrome c class I  30.53 
 
 		 412 aa  42.7  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0365316 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1827  cytochrome c class I  29.92 
 
 		 280 aa  42.4  0.003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0698  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 189 aa  42.4  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2939  hypothetical protein  37.88 
 
 		 505 aa  42.4  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.582281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1149  Pyrrolo-quinoline quinone  22.66 
 
 		 678 aa  42  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.261687  normal  0.842615 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3637  iron permease FTR1  52.5 
 
 		 664 aa  41.2  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.489611 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1587  cytochrome c, class I  29.17 
 
 		 220 aa  41.2  0.009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0500716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1402  hypothetical protein  34.41 
 
 		 170 aa  40.8  0.01  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.781476  normal  0.402158 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>