52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_5973 on replicon NC_010087
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010087  Bmul_5973  cytochrome c class I  100 
 
 		 412 aa  827    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0365316 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5894  cytochrome c class I  77.46 
 
 		 421 aa  625  1e-178  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.18364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6161  cytochrome c, class I  76.67 
 
 		 424 aa  615  1e-175  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.969705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5154  extracellular solute-binding protein  61.58 
 
 		 401 aa  482  1e-135  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5127  extracellular solute-binding protein  60.59 
 
 		 415 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.600349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3241  extracellular solute-binding protein  60.59 
 
 		 415 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0294244  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0307  putative cytochrome c  57.39 
 
 		 410 aa  421  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0124667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7193  cytochrome c class I  55.85 
 
 		 409 aa  413  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.99524  normal  0.500209 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3640  cytochrome c class I  28.46 
 
 		 417 aa  123  8e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.102782  normal  0.70332 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1739  cytochrome c, class I  42.86 
 
 		 146 aa  90.1  6e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2798  cytochrome c, class I  42.86 
 
 		 410 aa  88.2  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.228923  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1149  Pyrrolo-quinoline quinone  33.12 
 
 		 678 aa  81.3  0.00000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.261687  normal  0.842615 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1569  cytochrome c, class I  40.82 
 
 		 141 aa  74.3  0.000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.832933  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3472  hypothetical protein  37.86 
 
 		 131 aa  71.2  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2891  cytochrome c, class I  36.67 
 
 		 201 aa  67.8  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2838  quinoprotein glucose dehydrogenase  39.13 
 
 		 126 aa  64.3  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.158282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0560  sulfite oxidase cytochrome subunit  31.43 
 
 		 209 aa  53.1  0.000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.876942 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2734  cytochrome c class I  32.41 
 
 		 200 aa  48.5  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.207547  hitchhiker  0.0000919605 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3547  extracellular solute-binding protein  25.81 
 
 		 263 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.171423  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3545  solute-binding family 3 protein  26.45 
 
 		 263 aa  47  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2868  cytochrome c class I  30.39 
 
 		 187 aa  46.6  0.0007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1616  cytochrome c class I  35.42 
 
 		 171 aa  46.6  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.986895 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2757  hypothetical protein  32.95 
 
 		 291 aa  45.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0570414  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0908  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  32.93 
 
 		 265 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00179052  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3203  Mo-co oxidoreductase dimerization domain protein  30.58 
 
 		 182 aa  45.1  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.595677  hitchhiker  0.0000523602 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3444  hypothetical protein  30.58 
 
 		 182 aa  45.1  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.568465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4887  putative cytochrome c region protein  31.73 
 
 		 179 aa  45.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.362181 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2062  extracellular solute-binding protein  28.86 
 
 		 287 aa  44.7  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.131474  normal  0.156087 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1441  Pyrrolo-quinoline quinone  33.78 
 
 		 708 aa  44.7  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0121309 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0760  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  31.71 
 
 		 265 aa  44.7  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0753  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  31.71 
 
 		 265 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00539884  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2889  hypothetical protein  26.32 
 
 		 274 aa  44.7  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0776  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  34.18 
 
 		 270 aa  44.7  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.616971 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0152  putative sulfite oxidase cytochrome subunit  29.71 
 
 		 195 aa  44.7  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2599  cytochrome c family protein  34.12 
 
 		 306 aa  45.1  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.349522  normal  0.253602 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0885  extracellular solute-binding protein family 3  22.75 
 
 		 284 aa  44.7  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000379801  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0812  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  31.71 
 
 		 265 aa  44.3  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00534966  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2693  cytochrome c class I  45 
 
 		 306 aa  44.3  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.714589  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5018  nitrite reductase (NO-forming)  39.77 
 
 		 503 aa  44.3  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0855  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  31.71 
 
 		 265 aa  44.3  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3249  cytochrome c class I  35.16 
 
 		 255 aa  44.3  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00726195  hitchhiker  0.0000284914 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0947  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  31.71 
 
 		 265 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4430  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  31.71 
 
 		 265 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.10616  normal  0.255053 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1035  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  31.71 
 
 		 265 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00041367  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32540  hypothetical protein  31.82 
 
 		 293 aa  44.3  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.277482 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3233  extracellular solute-binding protein  25.16 
 
 		 263 aa  44.3  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.228634  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8678  cytochrome c class I  31.46 
 
 		 185 aa  43.9  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00176651  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2167  putative sulfite oxidase cytochrome c subunit, SoxD  31.16 
 
 		 180 aa  43.9  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1827  cytochrome c, class I  28.72 
 
 		 159 aa  43.9  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.876214 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5347  putative cytochrome c  34.94 
 
 		 272 aa  43.5  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.118303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1188  cytochrome c, class I  33.75 
 
 		 139 aa  43.1  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1295  extracellular solute-binding protein  31.76 
 
 		 292 aa  43.1  0.01  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.914061  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>