More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCAH187_A3547 on replicon NC_011658
Organism: Bacillus cereus AH187



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011658  BCAH187_A3547  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
263 aa  520  1e-147  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.171423  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3545  solute-binding family 3 protein  98.86 
 
 
263 aa  515  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3233  extracellular solute-binding protein  95.06 
 
 
263 aa  476  1e-133  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.228634  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2350  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter amino acid-binding protein/permease  41.64 
 
 
502 aa  199  5e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.140877  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2062  glutamine-binding periplasmic protein of glutamine ABC transporter  41.64 
 
 
502 aa  199  5e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2600  extracellular solute-binding protein  40.49 
 
 
252 aa  175  5e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0008  putative amino acid ABC transporter,substrate-binding protein  42.54 
 
 
250 aa  170  3e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00216943  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002010  amino acid ABC transporter amino acid-binding portion  42.11 
 
 
248 aa  169  5e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000538879  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00441  ABC amino acid transporter periplasmic component  40.35 
 
 
248 aa  163  2.0000000000000002e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2509  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  39.91 
 
 
248 aa  160  3e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000936361  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1920  ABC amino acid transporter extracellular solute-binding protein, family 3  39.47 
 
 
252 aa  159  5e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.541755  hitchhiker  0.00384825 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3995  extracellular solute-binding protein family 3  38.02 
 
 
263 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0932187  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3038  extracellular solute-binding protein  35.74 
 
 
250 aa  149  4e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0172  extracellular solute-binding protein family 3  35.63 
 
 
259 aa  149  6e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00460836  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4186  extracellular solute-binding protein family 3  35.77 
 
 
263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2936  cystine transporter subunit  35.47 
 
 
265 aa  144  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0217  extracellular solute-binding protein family 3  37.93 
 
 
255 aa  144  2e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5180  cystine ABC transporter, periplasmic cystine binding protein  38.81 
 
 
268 aa  143  3e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0358  cystine transporter subunit  36.12 
 
 
265 aa  139  3e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.95727 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2009  cystine transporter subunit  33.71 
 
 
265 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.163072  decreased coverage  0.0074335 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2507  cystine transporter subunit  35.41 
 
 
266 aa  137  2e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.292922  normal  0.810962 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4191  extracellular solute-binding protein family 3  33.85 
 
 
269 aa  135  7.000000000000001e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1726  extracellular solute-binding protein family 3  34.63 
 
 
285 aa  135  9e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0106098  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2694  cystine transporter subunit  34.63 
 
 
266 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.520163  normal  0.0574677 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1048  cystine transporter subunit  34.63 
 
 
266 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.202301  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1719  cystine transporter subunit  34.63 
 
 
285 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.470206 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1262  cystine transporter subunit  33.84 
 
 
266 aa  133  3e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0848905  normal  0.0261829 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2019  cystine transporter subunit  34.24 
 
 
266 aa  133  3e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.579561  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2154  cystine transporter subunit  34.24 
 
 
266 aa  133  3e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0349557  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2588  extracellular solute-binding protein  34.33 
 
 
270 aa  132  5e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0781  amino-acid ABC transporter extracellular-binding protein yckK  32.28 
 
 
252 aa  131  9e-30  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2487  extracellular solute-binding protein  31.27 
 
 
259 aa  130  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2439  extracellular solute-binding protein  31.27 
 
 
259 aa  130  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.732764  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0112  ABC-type amino acid transport system, periplasmic component  36.05 
 
 
271 aa  130  3e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0244  cystine transporter subunit  38.71 
 
 
266 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.136857  normal  0.712908 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5576  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  30.08 
 
 
503 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1289  cystine transporter subunit  33.46 
 
 
266 aa  129  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000238805 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2110  cystine transporter subunit  33.46 
 
 
266 aa  129  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.587115  normal  0.0126347 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1986  extracellular solute-binding protein  36.09 
 
 
253 aa  129  7.000000000000001e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.647291  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2116  cystine transporter subunit  33.46 
 
 
266 aa  129  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000583389 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2169  cystine transporter subunit  33.46 
 
 
266 aa  129  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000488454 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1166  cystine transporter subunit  33.46 
 
 
266 aa  128  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.379234  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3585  extracellular solute-binding protein  34.18 
 
 
266 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.435512  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4248  extracellular solute-binding protein  30.22 
 
 
266 aa  126  3e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0312845 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0382  extracellular solute-binding protein  33.05 
 
 
266 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0366  extracellular solute-binding protein  33.05 
 
 
266 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0588118  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0351  extracellular solute-binding protein  33.05 
 
 
266 aa  125  9e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3131  extracellular solute-binding protein  32.09 
 
 
266 aa  124  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0249016 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4985  cystine transporter subunit  35.66 
 
 
264 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.916643 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2376  cystine transporter subunit  33.46 
 
 
266 aa  123  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0433  extracellular solute-binding protein  32.63 
 
 
266 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0980273  hitchhiker  0.00000000179971 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2274  cystine transporter subunit  33.46 
 
 
266 aa  123  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2031  cystine transporter subunit  33.46 
 
 
266 aa  123  2e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2649  extracellular solute-binding protein  32.63 
 
 
266 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0458  extracellular solute-binding protein  32.63 
 
 
266 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.357598  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2005  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  30.15 
 
 
262 aa  123  3e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3548  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  32.63 
 
 
266 aa  123  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.233102 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4772  extracellular solute-binding protein  29.96 
 
 
266 aa  123  4e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0344  extracellular solute-binding protein  36.22 
 
 
264 aa  122  6e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0687  extracellular solute-binding protein  32.84 
 
 
265 aa  122  6e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0413327  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1051  extracellular solute-binding protein family 3  34.85 
 
 
257 aa  122  7e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.310082  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1232  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  29.96 
 
 
503 aa  122  8e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0615942 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2345  extracellular solute-binding protein  36.84 
 
 
273 aa  121  9.999999999999999e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.949438  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0251  cystine transporter subunit  36.8 
 
 
264 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0836  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  29.54 
 
 
266 aa  120  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0996489 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0757  cjaC protein  33.72 
 
 
251 aa  119  3.9999999999999996e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.943565  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0834  CjaC  33.72 
 
 
251 aa  119  4.9999999999999996e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0971  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  33.98 
 
 
259 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000530479  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2908  cystine transporter subunit  33.77 
 
 
265 aa  119  6e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.647057  normal  0.0539473 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4059  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  33.59 
 
 
259 aa  119  7e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000988465  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3898  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  33.59 
 
 
259 aa  119  7e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.3817799999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4376  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  33.59 
 
 
259 aa  119  7e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000139221  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2291  extracellular solute-binding protein family 3  34.08 
 
 
260 aa  118  9e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000299609  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0759  extracellular solute-binding protein  31.46 
 
 
265 aa  118  9e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.221068  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0227  cystine transporter subunit  36.36 
 
 
264 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00670463 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1475  extracellular solute-binding protein  34.75 
 
 
264 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1295  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  29.82 
 
 
267 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.397869 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1454  extracellular solute-binding protein  34.75 
 
 
264 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0945  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  32.21 
 
 
265 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.336039  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1642  ABC transporter, substrate-binding protein  34.23 
 
 
277 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.275268  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1529  extracellular solute-binding protein  34.75 
 
 
264 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.890695 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0812  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  32.21 
 
 
265 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00534966  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3905  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  33.59 
 
 
259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000878527  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0242  cystine transporter subunit  36.36 
 
 
264 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.310723 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0855  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  32.21 
 
 
265 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4285  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  33.2 
 
 
259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000352358  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1553  extracellular solute-binding protein  34.75 
 
 
264 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4430  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  32.21 
 
 
265 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.10616  normal  0.255053 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1073  extracellular solute-binding protein  34.75 
 
 
264 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0908  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  31.46 
 
 
265 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00179052  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0947  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  32.21 
 
 
265 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4174  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  33.2 
 
 
259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0433211 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3995  extracellular solute-binding protein  32.95 
 
 
259 aa  116  3e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0155411  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0760  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  32.21 
 
 
265 aa  116  3e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0753  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  32.21 
 
 
265 aa  116  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00539884  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1924  glutamine-binding periplasmic protein/glutamine transport system permease protein  33.83 
 
 
259 aa  116  3e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1495  glutamine ABC transporter periplasmic protein  35.66 
 
 
247 aa  116  3e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000566563  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5323  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  31.93 
 
 
489 aa  116  3e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4225  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  32.82 
 
 
259 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000103966  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5030  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  31.93 
 
 
489 aa  116  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>