103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5018 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B5018  nitrite reductase (NO-forming)  100 
 
 		 503 aa  1028    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3169  cytochrome d1, heme region  73.79 
 
 		 493 aa  761    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1450  cytochrome d1 heme region  58.91 
 
 		 525 aa  588  1e-167  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.593871 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1905  cytochrome d1, heme region  58.11 
 
 		 542 aa  578  1e-164  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.275872  normal  0.619697 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3260  cytochrome d1, heme region  54.3 
 
 		 528 aa  575  1.0000000000000001e-163  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1710  cytochrome d1 heme region  58.11 
 
 		 566 aa  578  1.0000000000000001e-163  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.111193  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0610  putative c-type cytochrome  58.9 
 
 		 493 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.221994  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0070  nitrite reductase (NO-forming)  60 
 
 		 517 aa  570  1e-161  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.532245  normal  0.428629 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06650  putative c-type cytochrome  59.32 
 
 		 493 aa  559  1e-158  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0252622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2608  cytochrome d1 heme region  57.11 
 
 		 547 aa  555  1e-157  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.213874  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3132  hydroxylamine reductase  53.24 
 
 		 504 aa  549  1e-155  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4229  heme-binding protein NirN  47.73 
 
 		 542 aa  531  1e-150  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3172  nitrite reductase protein N  51.8 
 
 		 517 aa  520  1e-146  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.854794 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2495  cytochrome d1, heme region  53.12 
 
 		 484 aa  496  1e-139  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.399935 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0461  cytochrome d1 heme region  28.45 
 
 		 556 aa  237  4e-61  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00181768  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4220  nitrite reductase  30.08 
 
 		 542 aa  218  2.9999999999999998e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0434848  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0340  cytochrome d1 heme region  29.03 
 
 		 557 aa  211  3e-53  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000596399  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3331  cytochrome d1, heme region  28.33 
 
 		 519 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3430  hydroxylamine reductase  28.43 
 
 		 690 aa  163  8.000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.133713  decreased coverage  0.000818462 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3029  cytochrome d1 heme subunit  27.64 
 
 		 527 aa  162  1e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.612791  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1985  nitrite reductase NirS  28.08 
 
 		 546 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.0000493691  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2487  hydroxylamine reductase  27.18 
 
 		 596 aa  141  1.9999999999999998e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.756283 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5010  hydroxylamine reductase  26.68 
 
 		 567 aa  140  6e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.824886  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3125  hydroxylamine reductase  26.13 
 
 		 574 aa  137  3.0000000000000003e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.74527  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0620  nitrite reductase precursor  25.74 
 
 		 568 aa  136  8e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3172  cytochrome d1, heme region  26.88 
 
 		 549 aa  136  9e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06750  nitrite reductase precursor  25.74 
 
 		 568 aa  136  9e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3323  cytochrome c, class I:cytochrome d1, heme region  25.69 
 
 		 576 aa  134  3.9999999999999996e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000018049 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0077  nitrite reductase (NO-forming)  26.52 
 
 		 575 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.157876  normal  0.459085 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3274  cytochrome d1, heme region  25.67 
 
 		 561 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.825394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0652  Nitrite reductase (NO-forming)  26.32 
 
 		 565 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0462  Hydroxylamine reductase  25.48 
 
 		 553 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000301578  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1912  nitrite reductase (NO-forming)  24.8 
 
 		 574 aa  128  3e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1717  Hydroxylamine reductase  24.8 
 
 		 574 aa  128  3e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0339  Hydroxylamine reductase  24.75 
 
 		 548 aa  126  7e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000373839  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1442  hydroxylamine reductase  23.47 
 
 		 573 aa  118  3e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2618  Nitrite reductase (NO-forming)  23.56 
 
 		 560 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0412143  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3180  nitrite reductase precursor  25.29 
 
 		 583 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.795013  normal  0.689934 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3123  cytochrome d1, heme region  25.4 
 
 		 400 aa  110  7.000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.475371  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0075  heme d1 biosynthesis protein NirF  25.96 
 
 		 391 aa  106  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.61983 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4223  nirF protein  23.68 
 
 		 413 aa  98.6  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3270  cytochrome d1, heme region  25.07 
 
 		 387 aa  98.2  3e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1910  cytochrome d1, heme region  24.93 
 
 		 404 aa  95.1  3e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1715  cytochrome d1 heme region  24.93 
 
 		 404 aa  94.7  4e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.792941  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5013  cytochrome d1, heme region  26.87 
 
 		 413 aa  93.2  9e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2080  cytochrome d1, heme region  25.54 
 
 		 390 aa  91.7  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.79845  normal  0.193812 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06720  heme d1 biosynthesis protein NirF  24.93 
 
 		 392 aa  90.1  7e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.729227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0617  heme d1 biosynthesis protein NirF  25.41 
 
 		 392 aa  88.2  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1444  cytochrome d1 heme region  25.68 
 
 		 397 aa  85.1  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3177  cytochrome cd1  25.74 
 
 		 388 aa  80.5  0.00000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.976412 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2490  cytochrome d1, heme region  26.58 
 
 		 384 aa  72.8  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.697669 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2613  cytochrome d1 heme region  25.29 
 
 		 402 aa  72.4  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.683986  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0591  cytochrome d1, heme region  23.58 
 
 		 538 aa  66.6  0.0000000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1921  cytochrome d1, heme region  23.99 
 
 		 541 aa  63.9  0.000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4957  Pyrrolo-quinoline quinone  41.03 
 
 		 698 aa  57  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.897916 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3124  cytochrome c, mono- and diheme variants  33.98 
 
 		 121 aa  54.3  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.412627  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2545  putative cytochrome c  38.54 
 
 		 350 aa  53.9  0.000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1425  cytochrome c, class I  37.66 
 
 		 97 aa  51.2  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3271  hypothetical protein  44.62 
 
 		 110 aa  49.7  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1358  cb-type cytochrome c oxidase subunit III  37.04 
 
 		 152 aa  48.5  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.112598  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2102  cytochrome c, class I  35.44 
 
 		 268 aa  48.1  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.895116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1471  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.5 
 
 		 348 aa  48.5  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2714  cytochrome c, class I  29.35 
 
 		 101 aa  48.1  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.30061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2435  cytochrome c class I  36.36 
 
 		 97 aa  48.1  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1045  cytochrome c class I  43.66 
 
 		 98 aa  47  0.0007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0292  iron permease FTR1  40.7 
 
 		 629 aa  47  0.0008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4116  cytochrome c class I  38.1 
 
 		 124 aa  47  0.0008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.115646 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2189  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  25.55 
 
 		 348 aa  47  0.0008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0180  cytochrome c family protein  33.07 
 
 		 636 aa  46.6  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.558942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06730  putative c-type cytochrome precursor  41.58 
 
 		 119 aa  46.2  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0202  cytochrome c, class I  33.07 
 
 		 647 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0618  putative c-type cytochrome precursor  41.58 
 
 		 119 aa  46.2  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0986  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  28.12 
 
 		 430 aa  46.6  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1104  cytochrome c, class I  28.12 
 
 		 416 aa  45.8  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3376  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  28.12 
 
 		 426 aa  45.4  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0966  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  28.12 
 
 		 430 aa  45.8  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1001  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  28.12 
 
 		 430 aa  45.4  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0482  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  36.07 
 
 		 326 aa  45.8  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2412  cytochrome c class I  36.84 
 
 		 120 aa  45.8  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000673714  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4222  c-type cytochrome c55x  35.82 
 
 		 123 aa  45.1  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0141  lead uptake protein, putative  42.86 
 
 		 632 aa  45.4  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5973  cytochrome c class I  39.77 
 
 		 412 aa  45.1  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0365316 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0205  cytochrome c class I  36.63 
 
 		 647 aa  45.1  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844315 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1809  cytochrome c class I  33.75 
 
 		 153 aa  45.1  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1651  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  22.73 
 
 		 366 aa  45.1  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0495995  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0049  cytochrome c, class I:Iron permease FTR1  40 
 
 		 632 aa  44.7  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5421  WD-40 repeat-containing protein  25.99 
 
 		 354 aa  44.7  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2304  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  22.07 
 
 		 317 aa  44.7  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0594691 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0759  cytochrome c, class I  32 
 
 		 100 aa  44.7  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.940622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5993  hypothetical protein  40 
 
 		 652 aa  44.7  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1583  cytochrome c class I  33.75 
 
 		 152 aa  44.7  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.889837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2614  hypothetical protein  39.71 
 
 		 139 aa  44.7  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.537147  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3043  cytochrome c class I  35.82 
 
 		 163 aa  44.7  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5894  cytochrome c class I  42.65 
 
 		 421 aa  44.3  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.18364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0858  cytochrome c, class I  29.35 
 
 		 429 aa  44.3  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61130  putative c-type cytochrome  38.67 
 
 		 415 aa  43.9  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00213286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5264  putative c-type cytochrome  38.67 
 
 		 415 aa  43.9  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3088  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  36.04 
 
 		 442 aa  43.9  0.007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.161961  normal  0.0270934 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2522  cytochrome c class I  34.25 
 
 		 97 aa  43.9  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0076  hypothetical protein  35.59 
 
 		 98 aa  43.5  0.008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.518394 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>