More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0885 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_0885  extracellular solute-binding protein family 3  100 
 
 		 284 aa  574  1.0000000000000001e-163  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000379801  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3014  extracellular solute-binding protein  44.28 
 
 		 265 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.569959  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0316  extracellular solute-binding protein  48.66 
 
 		 255 aa  239  4e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000382447  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5539  extracellular solute-binding protein  43.75 
 
 		 268 aa  236  2e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.959026 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0208  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  50 
 
 		 257 aa  236  4e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0259  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  50 
 
 		 257 aa  236  4e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000559258 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0711  extracellular solute-binding protein family 3  48.44 
 
 		 266 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0743  extracellular solute-binding protein  48.44 
 
 		 295 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0655438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1010  extracellular solute-binding protein  43.17 
 
 		 267 aa  231  7.000000000000001e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2969  extracellular solute-binding protein  47.32 
 
 		 262 aa  228  9e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.87246  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3928  extracellular solute-binding protein family 3  47.56 
 
 		 265 aa  224  1e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.259325  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4550  extracellular solute-binding protein family 3  44.36 
 
 		 274 aa  219  5e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000001355  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1324  amino acid ABC transporter (binding protein)  41.01 
 
 		 262 aa  215  8e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216539  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2352  extracellular solute-binding protein family 3  46.89 
 
 		 275 aa  208  1e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.9341599999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2118  extracellular solute-binding protein family 3  45.61 
 
 		 265 aa  206  5e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.137137  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1531  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  43.1 
 
 		 262 aa  205  7e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000230414  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0983  extracellular solute-binding protein family 3  41.7 
 
 		 264 aa  204  9e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0154796  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3277  extracellular solute-binding protein family 3  40.89 
 
 		 264 aa  203  3e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1294  extracellular solute-binding protein family 3  40.82 
 
 		 263 aa  202  4e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0278324  normal  0.772509 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0800  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  40.34 
 
 		 256 aa  194  2e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.38805  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1377  extracellular solute-binding protein  38.7 
 
 		 277 aa  192  4e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000115158  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1665  amino acid ABC transporter periplasmic protein  38.75 
 
 		 282 aa  191  1e-47  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0578  amino acid ABC transporter periplasmic protein  35.94 
 
 		 284 aa  191  1e-47  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13330  amino acid-binding protein  40.14 
 
 		 291 aa  189  7e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0949  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  34.59 
 
 		 276 aa  182  5.0000000000000004e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.2503  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0661  extracellular solute-binding protein family 3  35.85 
 
 		 276 aa  179  5.999999999999999e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.126579  hitchhiker  0.00355564 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1942  extracellular solute-binding protein family 3  37.01 
 
 		 266 aa  173  2.9999999999999996e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000237139  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0517  extracellular solute-binding protein  35 
 
 		 283 aa  171  2e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06880  amino acid-binding protein  39.83 
 
 		 286 aa  169  5e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0612376  normal  0.365115 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0907  amino acid ABC transporter periplasmic protein  33.85 
 
 		 283 aa  167  1e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.455944  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0378  extracellular solute-binding protein  36.55 
 
 		 294 aa  167  2e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.150141  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2353  extracellular solute-binding protein family 3  38.75 
 
 		 286 aa  166  5.9999999999999996e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.09811e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0360  amino acid ABC transporter periplasmic protein  34.76 
 
 		 263 aa  158  1e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000870142  hitchhiker  0.00010092 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0324  extracellular solute-binding protein  38.79 
 
 		 246 aa  157  2e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0342  extracellular solute-binding protein  39.13 
 
 		 246 aa  156  5.0000000000000005e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03950  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  33.58 
 
 		 364 aa  145  6e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.72321  normal  0.568441 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1262  cystine transporter subunit  32.77 
 
 		 266 aa  144  1e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0848905  normal  0.0261829 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1458  extracellular solute-binding protein  33.84 
 
 		 269 aa  144  2e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000125438  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2154  cystine transporter subunit  32.77 
 
 		 266 aa  144  2e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0349557  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1719  cystine transporter subunit  32.77 
 
 		 285 aa  144  2e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.470206 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2019  cystine transporter subunit  32.77 
 
 		 266 aa  144  2e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.579561  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1048  cystine transporter subunit  32.77 
 
 		 266 aa  144  2e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.202301  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1726  extracellular solute-binding protein family 3  32.77 
 
 		 285 aa  143  3e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0106098  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2694  cystine transporter subunit  32.77 
 
 		 266 aa  143  3e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.520163  normal  0.0574677 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0771  extracellular solute-binding protein  35.24 
 
 		 264 aa  142  5e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000484393  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1056  extracellular solute-binding protein  33.76 
 
 		 250 aa  140  1.9999999999999998e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133402  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2376  cystine transporter subunit  32.91 
 
 		 266 aa  137  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2274  cystine transporter subunit  32.91 
 
 		 266 aa  137  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2031  cystine transporter subunit  32.91 
 
 		 266 aa  137  2e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0468  extracellular solute-binding protein  31.43 
 
 		 260 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000361301  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2507  cystine transporter subunit  31.49 
 
 		 266 aa  135  6.0000000000000005e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.292922  normal  0.810962 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1166  cystine transporter subunit  30.18 
 
 		 266 aa  134  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.379234  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2110  cystine transporter subunit  30.29 
 
 		 266 aa  134  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.587115  normal  0.0126347 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0947  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  31.43 
 
 		 265 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0812  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  31.43 
 
 		 265 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00534966  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2169  cystine transporter subunit  29.93 
 
 		 266 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000488454 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4430  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  31.43 
 
 		 265 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.10616  normal  0.255053 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1289  cystine transporter subunit  29.93 
 
 		 266 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000238805 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2116  cystine transporter subunit  29.93 
 
 		 266 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000583389 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0855  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  31.43 
 
 		 265 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2936  cystine transporter subunit  30.49 
 
 		 265 aa  134  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0945  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  31.07 
 
 		 265 aa  133  3e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.336039  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3742  extracellular solute-binding protein  33.05 
 
 		 261 aa  133  3e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1035  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  30.71 
 
 		 265 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00041367  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0760  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  30.71 
 
 		 265 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0753  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  30.71 
 
 		 265 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00539884  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0727  extracellular solute-binding protein  36.24 
 
 		 264 aa  132  7.999999999999999e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114827  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0687  extracellular solute-binding protein  29.86 
 
 		 265 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0413327  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2092  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein, putative  30.42 
 
 		 279 aa  130  2.0000000000000002e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.514591  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0908  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  30.71 
 
 		 265 aa  130  3e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00179052  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0759  extracellular solute-binding protein  30.71 
 
 		 265 aa  130  3e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.221068  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0244  cystine transporter subunit  30.42 
 
 		 266 aa  128  8.000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.136857  normal  0.712908 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1918  extracellular solute-binding protein family 3  34.82 
 
 		 248 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0567  amino acid ABC transporter  34.55 
 
 		 278 aa  126  4.0000000000000003e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0581  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  34.55 
 
 		 278 aa  126  5e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.143423  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1476  extracellular solute-binding protein family 3  31.91 
 
 		 286 aa  124  1e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2806  extracellular solute-binding protein family 3  32.13 
 
 		 281 aa  125  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1126  extracellular solute-binding protein  32.31 
 
 		 284 aa  125  1e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1448  extracellular solute-binding protein  32.31 
 
 		 254 aa  124  2e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.194926  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1051  extracellular solute-binding protein family 3  32.13 
 
 		 257 aa  124  2e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.310082  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0242  cystine transporter subunit  29.58 
 
 		 264 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.310723 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3496  extracellular solute-binding protein  32.2 
 
 		 258 aa  124  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0227  cystine transporter subunit  29.58 
 
 		 264 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00670463 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5123  extracellular solute-binding protein family 3  29.46 
 
 		 252 aa  123  3e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.815904  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1706  glutamine ABC transporter periplasmic protein  34.23 
 
 		 252 aa  123  3e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.114527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2855  extracellular solute-binding protein  33.04 
 
 		 249 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0470  extracellular solute-binding protein  31.03 
 
 		 247 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4985  cystine transporter subunit  27.95 
 
 		 264 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.916643 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1449  extracellular solute-binding protein family 3  30.51 
 
 		 295 aa  121  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3807  extracellular solute-binding protein  28.51 
 
 		 255 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0339434  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0251  cystine transporter subunit  27.92 
 
 		 264 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0353  amino acid ABC transporter solute binding protein  28.21 
 
 		 264 aa  120  3e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0336  amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  28.21 
 
 		 264 aa  120  3e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.137288  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0367  putative amino acid ABC transporter substrate-binding protein  28.21 
 
 		 264 aa  120  3e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0402  putative amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  28.21 
 
 		 264 aa  120  3e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2508  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  30.68 
 
 		 264 aa  120  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.897054  normal  0.357479 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1454  extracellular solute-binding protein  31.06 
 
 		 264 aa  120  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0743  extracellular solute-binding protein  28.83 
 
 		 260 aa  120  3e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2367  extracellular solute-binding protein family 3  31.72 
 
 		 246 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0467  putative amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  28.21 
 
 		 264 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>