More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_2118 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_2118  extracellular solute-binding protein family 3  100 
 
 
265 aa  521  1e-147  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.137137  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3014  extracellular solute-binding protein  45.52 
 
 
265 aa  238  9e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.569959  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0711  extracellular solute-binding protein family 3  45.69 
 
 
266 aa  233  3e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0743  extracellular solute-binding protein  45.69 
 
 
295 aa  231  6e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0655438  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3928  extracellular solute-binding protein family 3  47.37 
 
 
265 aa  231  8.000000000000001e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.259325  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5539  extracellular solute-binding protein  46.1 
 
 
268 aa  229  3e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.959026 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1010  extracellular solute-binding protein  43.28 
 
 
267 aa  226  2e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4550  extracellular solute-binding protein family 3  47.54 
 
 
274 aa  224  1e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000001355  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2969  extracellular solute-binding protein  47.14 
 
 
262 aa  218  1e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.87246  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1324  amino acid ABC transporter (binding protein)  42.28 
 
 
262 aa  210  2e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216539  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2352  extracellular solute-binding protein family 3  42.39 
 
 
275 aa  207  2e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.9341599999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0885  extracellular solute-binding protein family 3  45.61 
 
 
284 aa  206  5e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000379801  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0208  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  43.93 
 
 
257 aa  205  6e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0259  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  43.93 
 
 
257 aa  205  6e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000559258 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1531  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  43.04 
 
 
262 aa  203  2e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000230414  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0949  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  43.91 
 
 
276 aa  203  3e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.2503  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0907  amino acid ABC transporter periplasmic protein  40.22 
 
 
283 aa  192  4e-48  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.455944  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0517  extracellular solute-binding protein  40.78 
 
 
283 aa  192  5e-48  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0578  amino acid ABC transporter periplasmic protein  40.74 
 
 
284 aa  191  8e-48  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0316  extracellular solute-binding protein  45.24 
 
 
255 aa  191  1e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000382447  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1377  extracellular solute-binding protein  44.25 
 
 
277 aa  186  5e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000115158  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0360  amino acid ABC transporter periplasmic protein  40.82 
 
 
263 aa  185  8e-46  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000870142  hitchhiker  0.00010092 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2353  extracellular solute-binding protein family 3  39.3 
 
 
286 aa  184  1.0000000000000001e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.09811e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1665  amino acid ABC transporter periplasmic protein  39.22 
 
 
282 aa  173  2.9999999999999996e-42  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0983  extracellular solute-binding protein family 3  37.83 
 
 
264 aa  169  3e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0154796  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0378  extracellular solute-binding protein  38.79 
 
 
294 aa  167  1e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.150141  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1294  extracellular solute-binding protein family 3  36.36 
 
 
263 aa  167  2e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0278324  normal  0.772509 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3277  extracellular solute-binding protein family 3  37.45 
 
 
264 aa  167  2e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0800  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  41.05 
 
 
256 aa  166  4e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.38805  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1942  extracellular solute-binding protein family 3  38.49 
 
 
266 aa  159  4e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000237139  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0661  extracellular solute-binding protein family 3  36.14 
 
 
276 aa  157  2e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.126579  hitchhiker  0.00355564 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1051  extracellular solute-binding protein family 3  39.3 
 
 
257 aa  152  4e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.310082  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13330  amino acid-binding protein  33.21 
 
 
291 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3442  extracellular solute-binding protein  35.84 
 
 
285 aa  146  4.0000000000000006e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1148  extracellular solute-binding protein  35.4 
 
 
283 aa  145  6e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0342  extracellular solute-binding protein  37.99 
 
 
246 aa  142  5e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2936  cystine transporter subunit  36.96 
 
 
265 aa  140  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0324  extracellular solute-binding protein  37.55 
 
 
246 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1050  extracellular solute-binding protein  36.96 
 
 
286 aa  140  3e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.875025  normal  0.0927945 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1231  extracellular solute-binding protein  33.96 
 
 
260 aa  140  3e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.62778 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0131  glutamine transport system substrate-binding protein  35.84 
 
 
285 aa  139  6e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.210199  normal  0.0525108 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0771  extracellular solute-binding protein  35.27 
 
 
264 aa  137  2e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000484393  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2053  extracellular solute-binding protein family 3  33.59 
 
 
271 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3807  extracellular solute-binding protein  32.78 
 
 
255 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0339434  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1918  extracellular solute-binding protein family 3  35.53 
 
 
248 aa  136  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00865  arginine transporter subunit  36.4 
 
 
243 aa  136  4e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2782  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  36.4 
 
 
243 aa  136  4e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0257892  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0932  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtJ  36.4 
 
 
243 aa  136  4e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1056  extracellular solute-binding protein  34.47 
 
 
250 aa  136  4e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133402  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2736  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  36.4 
 
 
243 aa  136  4e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0318086  normal  0.950747 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00871  hypothetical protein  36.4 
 
 
243 aa  136  4e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0964  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtJ  36.4 
 
 
243 aa  136  4e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3517  extracellular solute-binding protein family 3  35.22 
 
 
273 aa  136  4e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0724  extracellular solute-binding protein  34.72 
 
 
260 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.531273  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0888  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtJ  35.96 
 
 
243 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.214233  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0244  cystine transporter subunit  36.69 
 
 
266 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.136857  normal  0.712908 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1019  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtJ  35.09 
 
 
243 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.211484 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0727  extracellular solute-binding protein  37.77 
 
 
264 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114827  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2471  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtJ  35.96 
 
 
243 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.198291  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1458  extracellular solute-binding protein  32.69 
 
 
269 aa  133  3.9999999999999996e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000125438  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1726  extracellular solute-binding protein family 3  34.35 
 
 
285 aa  132  5e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0106098  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2694  cystine transporter subunit  34.35 
 
 
266 aa  132  5e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.520163  normal  0.0574677 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3152  extracellular solute-binding protein family 3  30.3 
 
 
271 aa  132  6.999999999999999e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0865808 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1048  cystine transporter subunit  34.35 
 
 
266 aa  132  7.999999999999999e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.202301  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1719  cystine transporter subunit  34.35 
 
 
285 aa  132  7.999999999999999e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.470206 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2507  cystine transporter subunit  33.77 
 
 
266 aa  131  1.0000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.292922  normal  0.810962 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1475  extracellular solute-binding protein  33.96 
 
 
260 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0984243  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4985  cystine transporter subunit  36.55 
 
 
264 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.916643 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1041  arginine ABC transporter periplasmic arginine-binding protein ArtJ  36.4 
 
 
243 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.385191  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1022  arginine ABC transporter periplasmic arginine-binding protein ArtJ  36.4 
 
 
243 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.186752  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2154  cystine transporter subunit  33.91 
 
 
266 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0349557  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0991  arginine ABC transporter periplasmic arginine-binding protein ArtJ  36.4 
 
 
243 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0959  arginine ABC transporter periplasmic arginine-binding protein ArtJ  36.4 
 
 
243 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0924  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtJ  36.4 
 
 
243 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0338236  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2019  cystine transporter subunit  33.91 
 
 
266 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.579561  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0467  putative amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  32.58 
 
 
264 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1262  cystine transporter subunit  33.91 
 
 
266 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0848905  normal  0.0261829 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0251  cystine transporter subunit  36.69 
 
 
264 aa  129  3e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2357  glutamine ABC transporter periplasmic protein  34.93 
 
 
253 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2009  cystine transporter subunit  35.5 
 
 
265 aa  129  6e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.163072  decreased coverage  0.0074335 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0339  amino acid ABC transporter, substrate-binding protein  31.84 
 
 
264 aa  129  6e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.140169  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1376  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  35.53 
 
 
243 aa  129  6e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1961  glutamine ABC transporter periplasmic protein  34.06 
 
 
250 aa  129  6e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.40948  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0468  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  32.58 
 
 
264 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.829999  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0242  cystine transporter subunit  36.29 
 
 
264 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.310723 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0470  extracellular solute-binding protein  33.08 
 
 
247 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2031  cystine transporter subunit  34.35 
 
 
266 aa  128  1.0000000000000001e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0353  amino acid ABC transporter solute binding protein  31.84 
 
 
264 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0336  amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  31.84 
 
 
264 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.137288  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0367  putative amino acid ABC transporter substrate-binding protein  31.84 
 
 
264 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2376  cystine transporter subunit  34.35 
 
 
266 aa  128  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4752  extracellular solute-binding protein family 3  33.33 
 
 
269 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000170582  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2274  cystine transporter subunit  34.35 
 
 
266 aa  128  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0402  putative amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  31.84 
 
 
264 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0227  cystine transporter subunit  36.29 
 
 
264 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00670463 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2169  cystine transporter subunit  32.9 
 
 
266 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000488454 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2725  extracellular solute-binding protein  30.29 
 
 
255 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.377172 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2116  cystine transporter subunit  32.9 
 
 
266 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000583389 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1289  cystine transporter subunit  32.9 
 
 
266 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000238805 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1166  cystine transporter subunit  33.91 
 
 
266 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.379234  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>