More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_3517 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_3517  extracellular solute-binding protein family 3  100 
 
 
273 aa  550  1e-156  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3387  extracellular solute-binding protein family 3  71.7 
 
 
195 aa  237  1e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1236  ABC-type amino acid transport system, periplasmic component  45.92 
 
 
278 aa  219  3.9999999999999997e-56  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1148  extracellular solute-binding protein  44.75 
 
 
283 aa  195  8.000000000000001e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3442  extracellular solute-binding protein  42.59 
 
 
285 aa  194  9e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4752  extracellular solute-binding protein family 3  40.51 
 
 
269 aa  189  4e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000170582  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0131  glutamine transport system substrate-binding protein  47.32 
 
 
285 aa  186  5e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.210199  normal  0.0525108 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3807  extracellular solute-binding protein  44.64 
 
 
255 aa  185  6e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0339434  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2725  extracellular solute-binding protein  42.29 
 
 
255 aa  181  1e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.377172 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1050  extracellular solute-binding protein  47.51 
 
 
286 aa  178  8e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.875025  normal  0.0927945 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2053  extracellular solute-binding protein family 3  37.78 
 
 
271 aa  178  1e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0771  extracellular solute-binding protein  41.96 
 
 
264 aa  178  1e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000484393  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1051  extracellular solute-binding protein family 3  39.33 
 
 
257 aa  173  1.9999999999999998e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.310082  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0727  extracellular solute-binding protein  42.67 
 
 
264 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114827  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5123  extracellular solute-binding protein family 3  40.87 
 
 
252 aa  171  1e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.815904  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1126  extracellular solute-binding protein  38.4 
 
 
284 aa  167  1e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2367  extracellular solute-binding protein family 3  41.13 
 
 
246 aa  168  1e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00778  glutamine ABC transporter periplasmic protein  42.61 
 
 
248 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2831  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  42.61 
 
 
248 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0546212  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00795  hypothetical protein  42.61 
 
 
248 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0880  glutamine ABC transporter periplasmic protein  42.61 
 
 
248 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000245333  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2832  glutamine ABC transporter periplasmic protein  42.61 
 
 
248 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.220182  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0835  glutamine ABC transporter periplasmic protein  42.61 
 
 
248 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000431676  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0867  glutamine ABC transporter periplasmic protein  42.61 
 
 
248 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00000000156347  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1070  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein  37.12 
 
 
263 aa  166  2.9999999999999998e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.623597  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0960  glutamine ABC transporter periplasmic protein  42.61 
 
 
248 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000163371  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0978  glutamine ABC transporter periplasmic protein  39.39 
 
 
248 aa  166  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0375425  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0957  glutamine ABC transporter periplasmic protein  39.39 
 
 
248 aa  166  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0849319  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0866  glutamine ABC transporter periplasmic protein  39.39 
 
 
248 aa  166  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.717155  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0894  glutamine ABC transporter periplasmic protein  39.39 
 
 
248 aa  166  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.379869  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0925  glutamine ABC transporter periplasmic protein  39.77 
 
 
248 aa  166  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0376492  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2537  glutamine ABC transporter periplasmic protein  42.17 
 
 
248 aa  165  5.9999999999999996e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000279663  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0824  extracellular solute-binding protein  40.91 
 
 
256 aa  164  1.0000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.471601 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0501  extracellular solute-binding protein  38.77 
 
 
281 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1495  glutamine ABC transporter periplasmic protein  39.3 
 
 
247 aa  164  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000566563  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1600  glutamine ABC transporter periplasmic protein  39.3 
 
 
247 aa  163  3e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1773  glutamine ABC transporter periplasmic protein  39.3 
 
 
247 aa  163  3e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000148695  normal  0.114873 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2391  glutamine ABC transporter periplasmic protein  36.74 
 
 
248 aa  161  9e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.333457  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2878  glutamine ABC transporter periplasmic protein  39.13 
 
 
248 aa  160  2e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0116852  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3512  extracellular solute-binding protein family 3  35.88 
 
 
256 aa  160  3e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.249774  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3355  extracellular solute-binding protein family 3  36.64 
 
 
261 aa  159  3e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_362  amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  37.34 
 
 
260 aa  157  1e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000000733431  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1584  glutamine ABC transporter periplasmic protein  39.13 
 
 
248 aa  158  1e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.118123  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6986  extracellular solute-binding protein family 3  38.1 
 
 
271 aa  157  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.821047  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1298  glutamine ABC transporter periplasmic protein  38.26 
 
 
247 aa  157  2e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.219686  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2488  glutamine ABC transporter periplasmic protein  37.93 
 
 
248 aa  156  3e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.405859  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1156  glutamine ABC transporter periplasmic protein  37.44 
 
 
248 aa  156  3e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.752491  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3886  amino acid ABC transporter permease  36.44 
 
 
501 aa  156  4e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2855  extracellular solute-binding protein  39.13 
 
 
249 aa  154  1e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1706  glutamine ABC transporter periplasmic protein  36.84 
 
 
252 aa  154  1e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.114527  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1479  glutamine ABC transporter periplasmic protein  37.12 
 
 
247 aa  154  1e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3699  glutamine ABC transporter periplasmic protein  36.4 
 
 
248 aa  154  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0756284  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1918  extracellular solute-binding protein family 3  38.94 
 
 
248 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1848  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.01 
 
 
513 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38840  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  34.93 
 
 
272 aa  149  5e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.621896 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0468  extracellular solute-binding protein  35.11 
 
 
260 aa  149  7e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000361301  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0419  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  37.5 
 
 
260 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000266261  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18770  extracellular solute-binding protein family 3  33.33 
 
 
244 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.74936e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1487  glutamine ABC transporter periplasmic protein  37.12 
 
 
250 aa  147  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3272  glutamine ABC transporter periplasmic protein  37.12 
 
 
250 aa  146  3e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3158  glutamine ABC transporter periplasmic protein  37.12 
 
 
250 aa  147  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0137955  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2306  extracellular solute-binding protein  37.72 
 
 
246 aa  146  5e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000000079937  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1056  extracellular solute-binding protein  36.02 
 
 
250 aa  145  6e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133402  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2291  extracellular solute-binding protein family 3  35.61 
 
 
260 aa  144  1e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000299609  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1459  extracellular solute-binding protein family 3  39.47 
 
 
246 aa  145  1e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1093  extracellular solute-binding protein family 3  37.07 
 
 
247 aa  144  2e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.253807  normal  0.019092 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2098  glutamine ABC transporter periplasmic protein  36.68 
 
 
250 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.230871  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1135  extracellular solute-binding protein  35.07 
 
 
268 aa  144  2e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0567537  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1658  extracellular solute-binding protein  34.98 
 
 
243 aa  144  2e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000026827  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1126  glutamine ABC transporter periplasmic protein  36.68 
 
 
250 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1406  glutamine ABC transporter periplasmic protein  36.68 
 
 
250 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.584446  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2391  glutamine ABC transporter periplasmic protein  36.68 
 
 
250 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2357  glutamine ABC transporter periplasmic protein  36.84 
 
 
253 aa  143  3e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0588  extracellular solute-binding protein family 3  36.16 
 
 
247 aa  143  3e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00341778  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0743  extracellular solute-binding protein  35.58 
 
 
295 aa  142  5e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0655438  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0711  extracellular solute-binding protein family 3  35.58 
 
 
266 aa  142  7e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3166  extracellular solute-binding protein  36.5 
 
 
242 aa  142  7e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.190587  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0168  extracellular solute-binding protein  37.12 
 
 
247 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0398  extracellular solute-binding protein  36.49 
 
 
257 aa  141  9.999999999999999e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000444097  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3441  glutamine ABC transporter periplasmic protein  36.89 
 
 
250 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4284  glutamine ABC transporter periplasmic protein  36.89 
 
 
250 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4082  glutamine ABC transporter periplasmic protein  36.89 
 
 
250 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.314608  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4550  extracellular solute-binding protein family 3  36.52 
 
 
274 aa  139  3e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000001355  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0589  extracellular solute-binding protein family 3  36.61 
 
 
247 aa  139  6e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0251025  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1010  extracellular solute-binding protein  34.83 
 
 
267 aa  139  6e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1961  glutamine ABC transporter periplasmic protein  36.4 
 
 
250 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.40948  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1692  extracellular solute-binding protein family 3  30.34 
 
 
258 aa  137  1e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.350495 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1869  extracellular solute-binding protein family 3  32.58 
 
 
272 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000802311  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2118  extracellular solute-binding protein family 3  33.47 
 
 
265 aa  136  3.0000000000000003e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.137137  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0907  amino acid ABC transporter periplasmic protein  30.77 
 
 
283 aa  135  5e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.455944  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0470  extracellular solute-binding protein  35.14 
 
 
247 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3298  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 
254 aa  134  9.999999999999999e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0413  homoserine kinase (HSK; HK)  32.82 
 
 
256 aa  134  9.999999999999999e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.862983  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3027  extracellular solute-binding protein  39.82 
 
 
244 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5539  extracellular solute-binding protein  34.2 
 
 
268 aa  134  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.959026 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1231  extracellular solute-binding protein  34.94 
 
 
260 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.62778 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3053  extracellular solute-binding protein  39.37 
 
 
244 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000807518  normal  0.0316275 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3760  extracellular solute-binding protein  37.12 
 
 
245 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000882813  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3014  extracellular solute-binding protein  32.7 
 
 
265 aa  133  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.569959  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0919  extracellular solute-binding protein  38.84 
 
 
244 aa  133  3e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.994657 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>