More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0517 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_0517  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
283 aa  579  1e-164  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0378  extracellular solute-binding protein  55.78 
 
 
294 aa  294  1e-78  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.150141  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0907  amino acid ABC transporter periplasmic protein  50.36 
 
 
283 aa  283  3.0000000000000004e-75  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.455944  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0360  amino acid ABC transporter periplasmic protein  55.38 
 
 
263 aa  280  2e-74  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000870142  hitchhiker  0.00010092 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0578  amino acid ABC transporter periplasmic protein  50.37 
 
 
284 aa  266  2.9999999999999995e-70  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0949  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  46.84 
 
 
276 aa  263  2e-69  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.2503  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1665  amino acid ABC transporter periplasmic protein  49.59 
 
 
282 aa  244  9.999999999999999e-64  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1324  amino acid ABC transporter (binding protein)  45.19 
 
 
262 aa  239  4e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216539  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1531  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  47.08 
 
 
262 aa  228  1e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000230414  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2118  extracellular solute-binding protein family 3  40.39 
 
 
265 aa  193  3e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.137137  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4550  extracellular solute-binding protein family 3  34.41 
 
 
274 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000001355  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0208  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  35.29 
 
 
257 aa  179  4e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0259  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  35.29 
 
 
257 aa  179  4e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000559258 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0743  extracellular solute-binding protein  33.7 
 
 
295 aa  178  1e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0655438  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0711  extracellular solute-binding protein family 3  33.7 
 
 
266 aa  177  2e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0885  extracellular solute-binding protein family 3  32.39 
 
 
284 aa  174  9.999999999999999e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000379801  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1010  extracellular solute-binding protein  31.77 
 
 
267 aa  173  2.9999999999999996e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2969  extracellular solute-binding protein  34.32 
 
 
262 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.87246  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3928  extracellular solute-binding protein family 3  35.74 
 
 
265 aa  171  1e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.259325  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5539  extracellular solute-binding protein  35.29 
 
 
268 aa  171  2e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.959026 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3014  extracellular solute-binding protein  32.97 
 
 
265 aa  167  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.569959  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1294  extracellular solute-binding protein family 3  33.45 
 
 
263 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0278324  normal  0.772509 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2352  extracellular solute-binding protein family 3  34.02 
 
 
275 aa  165  6.9999999999999995e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.9341599999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0316  extracellular solute-binding protein  32.82 
 
 
255 aa  158  1e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000382447  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0800  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  34.84 
 
 
256 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.38805  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2353  extracellular solute-binding protein family 3  31.56 
 
 
286 aa  152  4e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.09811e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1942  extracellular solute-binding protein family 3  34.42 
 
 
266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000237139  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1377  extracellular solute-binding protein  32.64 
 
 
277 aa  145  5e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000115158  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0983  extracellular solute-binding protein family 3  30.3 
 
 
264 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0154796  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3277  extracellular solute-binding protein family 3  29.92 
 
 
264 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0661  extracellular solute-binding protein family 3  31.44 
 
 
276 aa  134  1.9999999999999998e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.126579  hitchhiker  0.00355564 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13330  amino acid-binding protein  29.85 
 
 
291 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2487  extracellular solute-binding protein  31.34 
 
 
259 aa  124  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2439  extracellular solute-binding protein  31.34 
 
 
259 aa  124  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.732764  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0468  extracellular solute-binding protein  30.18 
 
 
260 aa  123  3e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000361301  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2694  cystine transporter subunit  29.43 
 
 
266 aa  118  7.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.520163  normal  0.0574677 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1726  extracellular solute-binding protein family 3  29.43 
 
 
285 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0106098  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1056  extracellular solute-binding protein  30 
 
 
250 aa  118  9.999999999999999e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133402  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1719  cystine transporter subunit  29.43 
 
 
285 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.470206 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1048  cystine transporter subunit  29.43 
 
 
266 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.202301  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2936  cystine transporter subunit  29.32 
 
 
265 aa  117  3e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2019  cystine transporter subunit  29.06 
 
 
266 aa  116  3e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.579561  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2154  cystine transporter subunit  29.06 
 
 
266 aa  116  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0349557  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1289  cystine transporter subunit  28.68 
 
 
266 aa  116  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000238805 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2169  cystine transporter subunit  28.68 
 
 
266 aa  116  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000488454 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1051  extracellular solute-binding protein family 3  30.66 
 
 
257 aa  116  5e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.310082  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2116  cystine transporter subunit  28.68 
 
 
266 aa  116  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000583389 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2110  cystine transporter subunit  28.68 
 
 
266 aa  115  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.587115  normal  0.0126347 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1166  cystine transporter subunit  29.43 
 
 
266 aa  115  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.379234  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1262  cystine transporter subunit  28.79 
 
 
266 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0848905  normal  0.0261829 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2009  cystine transporter subunit  29.06 
 
 
265 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.163072  decreased coverage  0.0074335 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0771  extracellular solute-binding protein  26.47 
 
 
264 aa  113  3e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000484393  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3517  extracellular solute-binding protein family 3  29.91 
 
 
273 aa  114  3e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1361  extracellular solute-binding protein  29.93 
 
 
257 aa  113  3e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2908  cystine transporter subunit  29.54 
 
 
265 aa  112  5e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.647057  normal  0.0539473 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3950  extracellular solute-binding protein  30.18 
 
 
258 aa  113  5e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.358906 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2005  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  29.7 
 
 
262 aa  111  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3110  extracellular solute-binding protein family 3  28.21 
 
 
278 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2588  extracellular solute-binding protein  28.77 
 
 
270 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0251  cystine transporter subunit  30.54 
 
 
264 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3442  extracellular solute-binding protein  26.41 
 
 
285 aa  110  3e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4985  cystine transporter subunit  29.28 
 
 
264 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.916643 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0227  cystine transporter subunit  30.54 
 
 
264 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00670463 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0382  extracellular solute-binding protein  30.68 
 
 
266 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0242  cystine transporter subunit  30.54 
 
 
264 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.310723 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0366  extracellular solute-binding protein  30.68 
 
 
266 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0588118  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0351  extracellular solute-binding protein  30.68 
 
 
266 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2507  cystine transporter subunit  28.3 
 
 
266 aa  109  4.0000000000000004e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.292922  normal  0.810962 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4748  arginine-binding periplasmic protein 2  28.38 
 
 
246 aa  109  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00354956  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4629  arginine-binding periplasmic protein 2  28.38 
 
 
246 aa  109  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000336124  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4712  arginine-binding periplasmic protein 2  28.38 
 
 
246 aa  109  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00168872  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4769  arginine-binding periplasmic protein 2  28.38 
 
 
246 aa  109  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.129317  normal  0.0665997 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2649  extracellular solute-binding protein  30.68 
 
 
266 aa  109  6e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0458  extracellular solute-binding protein  30.68 
 
 
266 aa  109  6e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.357598  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0888  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtJ  27.38 
 
 
243 aa  108  7.000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.214233  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2075  extracellular solute-binding protein  25.09 
 
 
280 aa  109  7.000000000000001e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0433  extracellular solute-binding protein  30.68 
 
 
266 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0980273  hitchhiker  0.00000000179971 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00865  arginine transporter subunit  28.21 
 
 
243 aa  108  8.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3406  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  29.01 
 
 
251 aa  108  8.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.940811  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0932  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtJ  28.21 
 
 
243 aa  108  8.000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2736  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  28.21 
 
 
243 aa  108  8.000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0318086  normal  0.950747 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0964  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtJ  28.21 
 
 
243 aa  108  8.000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00871  hypothetical protein  28.21 
 
 
243 aa  108  8.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3548  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  30.68 
 
 
266 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.233102 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0324  extracellular solute-binding protein  29.17 
 
 
246 aa  108  1e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2031  cystine transporter subunit  28.2 
 
 
266 aa  108  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0342  extracellular solute-binding protein  29.41 
 
 
246 aa  108  1e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1019  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtJ  27.35 
 
 
243 aa  108  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.211484 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2471  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtJ  28.21 
 
 
243 aa  108  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.198291  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2153  extracellular solute-binding protein family 3  25.36 
 
 
273 aa  108  1e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0684055 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2376  cystine transporter subunit  28.2 
 
 
266 aa  108  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0327  extracellular solute-binding protein  25.54 
 
 
305 aa  108  1e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4620  arginine-binding periplasmic protein 2  28.38 
 
 
246 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.370137  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3903  extracellular solute-binding protein  33.19 
 
 
252 aa  108  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.754855  normal  0.154621 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2274  cystine transporter subunit  28.2 
 
 
266 aa  108  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0244  cystine transporter subunit  29.87 
 
 
266 aa  107  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.136857  normal  0.712908 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2508  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28.09 
 
 
264 aa  107  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.897054  normal  0.357479 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2782  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  27.78 
 
 
243 aa  107  3e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0257892  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0991  arginine ABC transporter periplasmic arginine-binding protein ArtJ  29.49 
 
 
243 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0690  extracellular solute-binding protein  30.83 
 
 
282 aa  107  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.370968  normal  0.982005 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>