More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0342 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0342  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
246 aa  479  1e-134  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0324  extracellular solute-binding protein  98.37 
 
 
246 aa  473  1e-132  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0470  extracellular solute-binding protein  58.37 
 
 
247 aa  289  2e-77  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1056  extracellular solute-binding protein  57.83 
 
 
250 aa  272  4.0000000000000004e-72  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133402  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0468  extracellular solute-binding protein  42.25 
 
 
260 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000361301  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1051  extracellular solute-binding protein family 3  44.09 
 
 
257 aa  194  1e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.310082  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1868  extracellular solute-binding protein family 3  41.74 
 
 
247 aa  191  1e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.265180000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1231  extracellular solute-binding protein  39.61 
 
 
260 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.62778 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1044  extracellular solute-binding protein family 3  42.57 
 
 
247 aa  179  2.9999999999999997e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1942  extracellular solute-binding protein family 3  42.97 
 
 
266 aa  177  2e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000237139  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0717  extracellular solute-binding protein family 3  41.37 
 
 
247 aa  176  5e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.303541  normal  0.0145592 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0724  extracellular solute-binding protein  39.22 
 
 
260 aa  175  7e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.531273  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3760  extracellular solute-binding protein  43.37 
 
 
245 aa  174  9e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000882813  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3397  extracellular solute-binding protein  43.72 
 
 
245 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0771  extracellular solute-binding protein  43.18 
 
 
264 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000484393  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1475  extracellular solute-binding protein  38.82 
 
 
260 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0984243  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0928  extracellular solute-binding protein family 3  44.91 
 
 
254 aa  172  5.999999999999999e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3166  extracellular solute-binding protein  42.15 
 
 
242 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.190587  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0951  extracellular solute-binding protein  47.62 
 
 
244 aa  171  6.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3053  extracellular solute-binding protein  46.12 
 
 
244 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000807518  normal  0.0316275 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0986  extracellular solute-binding protein  47.62 
 
 
244 aa  171  6.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3392  extracellular solute-binding protein  47.62 
 
 
244 aa  171  9e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0624048  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3027  extracellular solute-binding protein  46.58 
 
 
244 aa  171  1e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1044  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  45.66 
 
 
244 aa  170  2e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0919  extracellular solute-binding protein  45.66 
 
 
244 aa  170  2e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.994657 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0882  extracellular solute-binding protein  46.12 
 
 
244 aa  170  2e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00121366  normal  0.225798 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1385  extracellular solute-binding protein  39.06 
 
 
271 aa  169  3e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00529871  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18770  extracellular solute-binding protein family 3  44.05 
 
 
244 aa  167  1e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.74936e-17  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2782  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  36.36 
 
 
243 aa  165  5e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0257892  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00865  arginine transporter subunit  36.36 
 
 
243 aa  165  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0932  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtJ  36.36 
 
 
243 aa  165  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00871  hypothetical protein  36.36 
 
 
243 aa  165  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2736  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  36.36 
 
 
243 aa  165  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0318086  normal  0.950747 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2022  extracellular solute-binding protein  40.87 
 
 
272 aa  165  5.9999999999999996e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.167722  normal  0.899953 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0964  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtJ  36.36 
 
 
243 aa  165  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0124  extracellular solute-binding protein family 3  38.37 
 
 
266 aa  164  9e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1019  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtJ  35.97 
 
 
243 aa  164  9e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.211484 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0888  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtJ  36.36 
 
 
243 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.214233  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2471  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtJ  35.97 
 
 
243 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.198291  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0727  extracellular solute-binding protein  43.24 
 
 
264 aa  163  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114827  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1377  extracellular solute-binding protein  40.87 
 
 
277 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000115158  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3696  extracellular solute-binding protein  37.07 
 
 
268 aa  162  5.0000000000000005e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589095  normal  0.448557 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0991  arginine ABC transporter periplasmic arginine-binding protein ArtJ  37.15 
 
 
243 aa  162  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1022  arginine ABC transporter periplasmic arginine-binding protein ArtJ  37.15 
 
 
243 aa  162  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.186752  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1041  arginine ABC transporter periplasmic arginine-binding protein ArtJ  37.15 
 
 
243 aa  162  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.385191  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0924  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtJ  37.15 
 
 
243 aa  162  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0338236  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0959  arginine ABC transporter periplasmic arginine-binding protein ArtJ  37.15 
 
 
243 aa  162  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1135  extracellular solute-binding protein  42.53 
 
 
268 aa  161  8.000000000000001e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0567537  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1726  extracellular solute-binding protein family 3  36.8 
 
 
285 aa  160  1e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0106098  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3277  extracellular solute-binding protein family 3  39.27 
 
 
264 aa  160  1e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2019  cystine transporter subunit  36.8 
 
 
266 aa  160  2e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.579561  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2694  cystine transporter subunit  36.4 
 
 
266 aa  160  2e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.520163  normal  0.0574677 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3903  extracellular solute-binding protein  40 
 
 
252 aa  160  2e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.754855  normal  0.154621 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0972  extracellular solute-binding protein family 3  46.05 
 
 
250 aa  160  2e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.801508  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1719  cystine transporter subunit  36.8 
 
 
285 aa  159  3e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.470206 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4748  arginine-binding periplasmic protein 2  37.15 
 
 
246 aa  159  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00354956  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1126  extracellular solute-binding protein  44.5 
 
 
284 aa  159  3e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4629  arginine-binding periplasmic protein 2  37.15 
 
 
246 aa  159  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000336124  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4712  arginine-binding periplasmic protein 2  37.15 
 
 
246 aa  159  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00168872  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2154  cystine transporter subunit  36.8 
 
 
266 aa  159  3e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0349557  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1048  cystine transporter subunit  36.8 
 
 
266 aa  159  3e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.202301  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4769  arginine-binding periplasmic protein 2  37.15 
 
 
246 aa  159  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.129317  normal  0.0665997 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0983  extracellular solute-binding protein family 3  38.96 
 
 
264 aa  159  4e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0154796  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1344  extracellular solute-binding protein family 3  39.57 
 
 
272 aa  159  4e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.752805 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1566  extracellular solute-binding protein family 3  41.41 
 
 
253 aa  158  9e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4620  arginine-binding periplasmic protein 2  36.76 
 
 
246 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.370137  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1818  extracellular solute-binding protein family 3  39.13 
 
 
273 aa  157  1e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0079129  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1262  cystine transporter subunit  36.4 
 
 
266 aa  157  1e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0848905  normal  0.0261829 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0885  extracellular solute-binding protein family 3  39.13 
 
 
284 aa  156  3e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000379801  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2507  cystine transporter subunit  36 
 
 
266 aa  155  4e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.292922  normal  0.810962 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1658  extracellular solute-binding protein  40.87 
 
 
243 aa  155  4e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000026827  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1376  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  36.65 
 
 
243 aa  155  5.0000000000000005e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0800  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  39.22 
 
 
256 aa  155  8e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.38805  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4752  extracellular solute-binding protein family 3  39.55 
 
 
269 aa  154  9e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000170582  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1652  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  36.76 
 
 
244 aa  154  1e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.513751 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2724  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  36.76 
 
 
243 aa  154  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00108182  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1070  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein  37.88 
 
 
263 aa  154  1e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.623597  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2589  extracellular solute-binding protein family 3  39.04 
 
 
268 aa  154  2e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2380  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  35.57 
 
 
249 aa  153  2e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.730778  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0411  UDP-3-O-[3-hydroxymyristoyl] N-acetylglucosamine deacetylase  38.62 
 
 
238 aa  154  2e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2639  arginine ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein ArtJ  36.76 
 
 
243 aa  153  2.9999999999999998e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000964568  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1569  arginine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein ArtJ  36.76 
 
 
243 aa  153  2.9999999999999998e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2053  extracellular solute-binding protein family 3  37.94 
 
 
271 aa  152  4e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2110  cystine transporter subunit  35.6 
 
 
266 aa  151  8.999999999999999e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.587115  normal  0.0126347 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1166  cystine transporter subunit  35.6 
 
 
266 aa  151  8.999999999999999e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.379234  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0419  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  36.58 
 
 
260 aa  151  1e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000266261  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1289  cystine transporter subunit  35.2 
 
 
266 aa  150  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000238805 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0489  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  43 
 
 
490 aa  150  1e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2116  cystine transporter subunit  35.2 
 
 
266 aa  150  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000583389 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67050  putative binding protein component of ABC transporter  35.63 
 
 
266 aa  151  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2169  cystine transporter subunit  35.2 
 
 
266 aa  150  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000488454 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0814  extracellular solute-binding protein  38.91 
 
 
268 aa  151  1e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00687374  normal  0.141124 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5815  putative ABC transporter binding protein subunit  35.63 
 
 
266 aa  151  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.387818  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2798  extracellular solute-binding protein family 3  40.83 
 
 
254 aa  150  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2391  extracellular solute-binding protein family 3  40.83 
 
 
254 aa  149  3e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_362  amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  40.28 
 
 
260 aa  149  4e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000000733431  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2377  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  33.99 
 
 
243 aa  149  5e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.730778  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2490  extracellular solute-binding protein family 3  38.36 
 
 
273 aa  149  5e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2291  extracellular solute-binding protein family 3  38.55 
 
 
260 aa  148  8e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000299609  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1655  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  34.78 
 
 
243 aa  148  1.0000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.568539 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>