More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1344 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_1344  extracellular solute-binding protein family 3  100 
 
 		 272 aa  555  1e-157  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.752805 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2022  extracellular solute-binding protein  87.87 
 
 		 272 aa  475  1e-133  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.167722  normal  0.899953 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1818  extracellular solute-binding protein family 3  74.8 
 
 		 273 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0079129  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2490  extracellular solute-binding protein family 3  70.15 
 
 		 273 aa  391  1e-108  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1385  extracellular solute-binding protein  66.18 
 
 		 271 aa  393  1e-108  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00529871  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0124  extracellular solute-binding protein family 3  59.18 
 
 		 266 aa  333  2e-90  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3696  extracellular solute-binding protein  58.24 
 
 		 268 aa  329  3e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589095  normal  0.448557 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67050  putative binding protein component of ABC transporter  52.99 
 
 		 266 aa  311  4.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5815  putative ABC transporter binding protein subunit  52.94 
 
 		 266 aa  309  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.387818  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0375  extracellular solute-binding protein  54.47 
 
 		 265 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.734058 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5024  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  50.94 
 
 		 266 aa  302  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.258075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4898  extracellular solute-binding protein  50.56 
 
 		 266 aa  301  1e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.733781 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5074  extracellular solute-binding protein  50.56 
 
 		 266 aa  300  2e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.599311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0441  extracellular solute-binding protein  50.19 
 
 		 266 aa  297  1e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.775109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2597  extracellular solute-binding protein family 3  37.63 
 
 		 270 aa  207  1e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00189611  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0477  extracellular solute-binding protein family 3  40.21 
 
 		 278 aa  198  7e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.225572 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2685  extracellular solute-binding protein family 3  36.68 
 
 		 288 aa  182  5.0000000000000004e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0288477 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3070  extracellular solute-binding protein  35.74 
 
 		 273 aa  179  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.966648  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2287  extracellular solute-binding protein  36.84 
 
 		 261 aa  178  1e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.268829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0814  extracellular solute-binding protein  35.91 
 
 		 268 aa  176  4e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00687374  normal  0.141124 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0342  extracellular solute-binding protein  40.26 
 
 		 246 aa  159  4e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0324  extracellular solute-binding protein  40.26 
 
 		 246 aa  159  4e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1051  extracellular solute-binding protein family 3  37.07 
 
 		 257 aa  159  6e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.310082  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2649  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  38.16 
 
 		 269 aa  152  5.9999999999999996e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05952  ABC amino acid transporter periplasmic ligand binding protein  35 
 
 		 272 aa  150  3e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3959  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 		 276 aa  149  4e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.406686 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1056  extracellular solute-binding protein  35.11 
 
 		 250 aa  144  1e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133402  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000216  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  34.05 
 
 		 272 aa  140  9.999999999999999e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.909844  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0236  extracellular solute-binding protein  32.43 
 
 		 266 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1835  extracellular solute-binding protein family 3  34.45 
 
 		 262 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0545252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0470  extracellular solute-binding protein  36.96 
 
 		 247 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3796  extracellular solute-binding protein family 3  35.34 
 
 		 281 aa  136  4e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0150584  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2512  putative cyclohexadienyl dehydratase precursor signal peptide protein  32.06 
 
 		 267 aa  135  9e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.204589  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0202  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  33.73 
 
 		 278 aa  134  9.999999999999999e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.55601  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1377  extracellular solute-binding protein  36.21 
 
 		 277 aa  133  3e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000115158  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1231  extracellular solute-binding protein  34.1 
 
 		 260 aa  133  3e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.62778 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0445  extracellular solute-binding protein  32 
 
 		 266 aa  130  3e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3496  extracellular solute-binding protein  32.44 
 
 		 258 aa  129  6e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0727  extracellular solute-binding protein  35.56 
 
 		 264 aa  129  7.000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114827  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0468  extracellular solute-binding protein  32.49 
 
 		 260 aa  128  9.000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000361301  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0125  arogenate dehydratase  31.33 
 
 		 270 aa  126  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2945  prephenate dehydratase  31.33 
 
 		 270 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0273907  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0110  prephenate dehydratase  31.33 
 
 		 270 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.433262  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0836  amino acid-binding protein  33.48 
 
 		 256 aa  126  4.0000000000000003e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.462057  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1475  extracellular solute-binding protein  33.98 
 
 		 260 aa  125  6e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0984243  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0906  amino acid-binding protein  33.48 
 
 		 256 aa  125  7e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0771  extracellular solute-binding protein  33.72 
 
 		 264 aa  125  7e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000484393  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0100  prephenate dehydratase  30.47 
 
 		 270 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.688966  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1196  amino acid-binding protein  34.78 
 
 		 256 aa  125  9e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.166337  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3291  cyclohexadienyl dehydratase  31.78 
 
 		 266 aa  124  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.87694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2357  glutamine ABC transporter periplasmic protein  34.67 
 
 		 253 aa  124  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0724  extracellular solute-binding protein  33.59 
 
 		 260 aa  125  1e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.531273  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3964  cyclohexadienyl dehydratase  30.08 
 
 		 261 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2009  cystine transporter subunit  27.84 
 
 		 265 aa  124  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.163072  decreased coverage  0.0074335 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4037  cyclohexadienyl dehydratase  30.08 
 
 		 261 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0172  cyclohexadienyl dehydratase  30.08 
 
 		 261 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1487  glutamine ABC transporter periplasmic protein  34.67 
 
 		 250 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1942  extracellular solute-binding protein family 3  32.96 
 
 		 266 aa  124  2e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000237139  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3158  glutamine ABC transporter periplasmic protein  34.67 
 
 		 250 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0137955  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4284  glutamine ABC transporter periplasmic protein  35.75 
 
 		 250 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3110  extracellular solute-binding protein family 3  31.92 
 
 		 278 aa  124  2e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3272  glutamine ABC transporter periplasmic protein  34.67 
 
 		 250 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4082  glutamine ABC transporter periplasmic protein  35.75 
 
 		 250 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.314608  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2961  cyclohexadienyl dehydratase  29.7 
 
 		 261 aa  123  3e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0109  arogenate dehydratase  30.04 
 
 		 270 aa  123  4e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.224766  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1476  extracellular solute-binding protein family 3  34.17 
 
 		 286 aa  123  4e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1961  glutamine ABC transporter periplasmic protein  35.29 
 
 		 250 aa  123  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.40948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3305  cyclohexadienyl dehydratase  30.4 
 
 		 264 aa  123  4e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6677  extracellular solute-binding protein  33.94 
 
 		 277 aa  122  4e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3021  cyclohexadienyl dehydratase  29.7 
 
 		 261 aa  122  5e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.329674  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1581  cyclohexadienyl dehydratase  29.7 
 
 		 261 aa  122  5e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3350  cyclohexadienyl dehydratase  29.7 
 
 		 261 aa  122  5e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0111  prephenate dehydratase  30.9 
 
 		 258 aa  122  6e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.669855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2391  glutamine ABC transporter periplasmic protein  34.22 
 
 		 250 aa  122  8e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1406  glutamine ABC transporter periplasmic protein  34.22 
 
 		 250 aa  122  8e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.584446  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2098  glutamine ABC transporter periplasmic protein  34.22 
 
 		 250 aa  122  8e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.230871  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1651  cyclohexadienyl dehydratase precursor  27.03 
 
 		 268 aa  122  8e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1126  glutamine ABC transporter periplasmic protein  34.22 
 
 		 250 aa  122  8e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0358  cystine transporter subunit  28.57 
 
 		 265 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.95727 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3024  arogenate dehydratase  30.2 
 
 		 260 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0168  extracellular solute-binding protein  31.52 
 
 		 247 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2169  cystine transporter subunit  29.77 
 
 		 266 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000488454 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1289  cystine transporter subunit  29.77 
 
 		 266 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000238805 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2116  cystine transporter subunit  29.77 
 
 		 266 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000583389 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1070  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein  28.52 
 
 		 263 aa  120  1.9999999999999998e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.623597  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3441  glutamine ABC transporter periplasmic protein  35.29 
 
 		 250 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1534  extracellular solute-binding protein  30.12 
 
 		 253 aa  119  4.9999999999999996e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.195786  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3891  Arogenate dehydratase  30.08 
 
 		 265 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0717  extracellular solute-binding protein family 3  32.54 
 
 		 247 aa  119  6e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.303541  normal  0.0145592 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1135  extracellular solute-binding protein  34.22 
 
 		 268 aa  119  6e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0567537  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2507  cystine transporter subunit  29.17 
 
 		 266 aa  119  6e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.292922  normal  0.810962 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1166  cystine transporter subunit  29.01 
 
 		 266 aa  119  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.379234  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2110  cystine transporter subunit  28.63 
 
 		 266 aa  118  7.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.587115  normal  0.0126347 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2806  extracellular solute-binding protein family 3  32.38 
 
 		 281 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0043  cyclohexadienyl dehydratase  29.24 
 
 		 265 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.561569  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1726  extracellular solute-binding protein family 3  27.1 
 
 		 285 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0106098  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0251  cystine transporter subunit  30.74 
 
 		 264 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4410  extracellular solute-binding protein family 3  32.45 
 
 		 251 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4985  cystine transporter subunit  30.74 
 
 		 264 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.916643 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2053  extracellular solute-binding protein family 3  34.22 
 
 		 271 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>